Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pombal, Diana Raquel Carneiro
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10348/4545
Resumo: Compreender o sistema imunológico e como é influenciado pelo genoma são processos fundamentais para desvendar a base genética da regulação e desregulação imunológica. Os avanços das ferramentas genéticas e estratégias de sequenciação potenciam a identificação de mutações causadoras de doenças mal compreendidas como a síndrome de hiper-IgE (HIES). HIES é uma imunodeficiência primária cujas características incluem eczema, infecções pulmonares recorrentes e níveis séricos de IgE extremamente elevados. HIES tem sido associada à herança mendeliana de mutações em STAT3, DOCK8 e TYK2, no entanto, a maior parte dos casos não tem causa genética conhecida. Neste estudo, trabalhamos uma família com dois casos de HIES. Os pacientes deste estudo, filhos de pais consanguíneos, foram diagnosticados com HIES, no entanto nenhuma mutação foi encontrada em STAT3, DOCK8 ou TYK2. Recorrendo a “whole-exome sequencing” encontrou-se um SNP codificante raro em CARD11. Este SNP foi considerado o melhor candidato para explicar o fenótipo do paciente, devido às semelhanças com o fenótipo murino de deficiência em Card11 (dermatite atópica, aumento dos níveis séricos de IgE e resposta imune mediada por células Th2). Com base nisto, a hipótese de que este SNP era a causa de HIES nos doentes foi formulada. Contudo, os nossos resultados excluem CARD11 de ser o gene causador do fenótipo clínico. A elaboração do perfil imunológico de um dos paciente revelou uma diminuição de células Th2, Tregs e células T CD4+ naïve, e um aumento nas células CD4+ em CD8+ de memória. Em suma, estes resultados sugerem que a HIES apresentada pelos pacientes pertence a uma nova categoria, quer de foro genético, quer de foro imunológico. Pesquisa adicional é necessária para identificar a causa da doença nesta família e pode contribuir para uma melhor compreensão da produção de IgE e de doenças mediadas por IgE.
id RCAP_f5d5f76253ef27653a600f5951c995f8
oai_identifier_str oai:repositorio.utad.pt:10348/4545
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigreeExpressão génicaGenomaMutaçãoSindrome de hyper-IgECompreender o sistema imunológico e como é influenciado pelo genoma são processos fundamentais para desvendar a base genética da regulação e desregulação imunológica. Os avanços das ferramentas genéticas e estratégias de sequenciação potenciam a identificação de mutações causadoras de doenças mal compreendidas como a síndrome de hiper-IgE (HIES). HIES é uma imunodeficiência primária cujas características incluem eczema, infecções pulmonares recorrentes e níveis séricos de IgE extremamente elevados. HIES tem sido associada à herança mendeliana de mutações em STAT3, DOCK8 e TYK2, no entanto, a maior parte dos casos não tem causa genética conhecida. Neste estudo, trabalhamos uma família com dois casos de HIES. Os pacientes deste estudo, filhos de pais consanguíneos, foram diagnosticados com HIES, no entanto nenhuma mutação foi encontrada em STAT3, DOCK8 ou TYK2. Recorrendo a “whole-exome sequencing” encontrou-se um SNP codificante raro em CARD11. Este SNP foi considerado o melhor candidato para explicar o fenótipo do paciente, devido às semelhanças com o fenótipo murino de deficiência em Card11 (dermatite atópica, aumento dos níveis séricos de IgE e resposta imune mediada por células Th2). Com base nisto, a hipótese de que este SNP era a causa de HIES nos doentes foi formulada. Contudo, os nossos resultados excluem CARD11 de ser o gene causador do fenótipo clínico. A elaboração do perfil imunológico de um dos paciente revelou uma diminuição de células Th2, Tregs e células T CD4+ naïve, e um aumento nas células CD4+ em CD8+ de memória. Em suma, estes resultados sugerem que a HIES apresentada pelos pacientes pertence a uma nova categoria, quer de foro genético, quer de foro imunológico. Pesquisa adicional é necessária para identificar a causa da doença nesta família e pode contribuir para uma melhor compreensão da produção de IgE e de doenças mediadas por IgE.Understanding the immune system and how it is influenced by the genome are key steps for unraveling the genetic basis of immunological regulation and dysregulation. Advances in genetic tools and sequencing strategies potentially allow us to identify novel disease-causing mutations in poorly understood diseases such as hyper-IgE syndrome (HIES). HIES is a primary immune deficiency characterized by eczema, recurrent skin and lung infection, and greatly increased serum levels of IgE. HIES has been linked to a Mendelian inheritance of mutations in STAT3, DOCK8 and TYK2, however, most cases do not have a known genetic cause. In this study we worked on a family which manifested two cases of HIES in children of consanguineous parents. The patients of this study were diagnosed with HIES, yet no mutation in STAT3, DOCK8 orTYK2 were found. Resorting to whole-exome sequencing we found a rare coding SNP in CARD11, which was considered the best candidate to explain the patient’s phenotype due to the similarities to the Card11-deficient mouse phenotype (atopic dermatitis, increased serum levels of IgE and Th2-driven immune response). Based on this we hypothesized that this SNP was causing HIES in the patients, however our results rule out CARD11 as the causable gene for the clinical phenotype. The immune phenotyping of one of the patient revealed a decrease in Th2 cells, Tregs and naïve CD4+ T cells, and an increase in memory CD4+ and CD8+ T cells. Together, these results suggest a novel category of HIES, in genetic and immunologic basis. Additional research to identify the disease causation in this family may contribute for the better understanding of IgE production and IgE-mediated diseases.2015-05-04T18:07:06Z2015-05-04T00:00:00Z2015-05-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10348/4545engPombal, Diana Raquel Carneiroinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-02-02T12:36:10Zoai:repositorio.utad.pt:10348/4545Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T02:01:23.730326Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
title Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
spellingShingle Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
Pombal, Diana Raquel Carneiro
Expressão génica
Genoma
Mutação
Sindrome de hyper-IgE
title_short Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
title_full Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
title_fullStr Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
title_full_unstemmed Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
title_sort Genetic and immunological characterization of a hyper-IgE Syndrome pedigree
author Pombal, Diana Raquel Carneiro
author_facet Pombal, Diana Raquel Carneiro
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Pombal, Diana Raquel Carneiro
dc.subject.por.fl_str_mv Expressão génica
Genoma
Mutação
Sindrome de hyper-IgE
topic Expressão génica
Genoma
Mutação
Sindrome de hyper-IgE
description Compreender o sistema imunológico e como é influenciado pelo genoma são processos fundamentais para desvendar a base genética da regulação e desregulação imunológica. Os avanços das ferramentas genéticas e estratégias de sequenciação potenciam a identificação de mutações causadoras de doenças mal compreendidas como a síndrome de hiper-IgE (HIES). HIES é uma imunodeficiência primária cujas características incluem eczema, infecções pulmonares recorrentes e níveis séricos de IgE extremamente elevados. HIES tem sido associada à herança mendeliana de mutações em STAT3, DOCK8 e TYK2, no entanto, a maior parte dos casos não tem causa genética conhecida. Neste estudo, trabalhamos uma família com dois casos de HIES. Os pacientes deste estudo, filhos de pais consanguíneos, foram diagnosticados com HIES, no entanto nenhuma mutação foi encontrada em STAT3, DOCK8 ou TYK2. Recorrendo a “whole-exome sequencing” encontrou-se um SNP codificante raro em CARD11. Este SNP foi considerado o melhor candidato para explicar o fenótipo do paciente, devido às semelhanças com o fenótipo murino de deficiência em Card11 (dermatite atópica, aumento dos níveis séricos de IgE e resposta imune mediada por células Th2). Com base nisto, a hipótese de que este SNP era a causa de HIES nos doentes foi formulada. Contudo, os nossos resultados excluem CARD11 de ser o gene causador do fenótipo clínico. A elaboração do perfil imunológico de um dos paciente revelou uma diminuição de células Th2, Tregs e células T CD4+ naïve, e um aumento nas células CD4+ em CD8+ de memória. Em suma, estes resultados sugerem que a HIES apresentada pelos pacientes pertence a uma nova categoria, quer de foro genético, quer de foro imunológico. Pesquisa adicional é necessária para identificar a causa da doença nesta família e pode contribuir para uma melhor compreensão da produção de IgE e de doenças mediadas por IgE.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-05-04T18:07:06Z
2015-05-04T00:00:00Z
2015-05-04
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10348/4545
url http://hdl.handle.net/10348/4545
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799137097658925056