Estudo da resistência a biocidas e antibióticos em estafilococos associados a infeções em animais de companhia
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/93487 |
Resumo: | RESUMO: A espécie Staphylococcus schleiferi é o segundo agente patogénico mais frequentemente associado a infeções da pele e tecidos moles (SSTIs) em cães. Esta Dissertação teve como objetivo estudar a suscetibilidade de uma coleção de S. schleiferi associada à SSTIs caninas, a antibióticos e biocidas associados à terapêutica destas infeções. A coleção inicial englobou todos os isolados (n = 89) identificados como S. schleiferi ou Staphylococcus spp. em dois laboratórios veterinários em Lisboa, entre 1999 e 2018. A identificação ao nível de espécie foi feita por amplificação do gene nuc e ao nível da subespécie pela produção de urease. A suscetibilidade aos antibióticos e biocidas foi avaliada por Kirby-Bauer e determinação de concentrações mínimas inibitórias (CMI), respetivamente. A distribuição de halos de inibição e de CMIs foi usada para estimar valores de “cut-off” epidemiológicos (ECOFFs). A presença de genes de resistência foi pesquisada por PCR. A produção de biofilme foi avaliada pelo método de cristal de violeta. Dos 89 isolados testados, 28 foram identificados como S. schleiferi, correspondendo a 27 S. schleiferi subsp. coagulans e um S. schleiferi subsp. schleiferi. Dos 28 isolados, dois (7,1%) são resistentes à meticilina (MRSS, mecA+) e cinco (17,8%) são multirresistentes. Observou-se também resistência à penicilina (PEN) (18/28, 64,3%), às fluoroquinolonas (12/28, 42,9%), à eritromicina (ERY) e clindamicina (CLI) (3/28, 10,7%), ao ácido fusídico (3/28, 10,7%) e à tetraciclina (1/28, 3,6%). O gene blaZ foi detetado em 16 isolados PENR e o erm(B) num isolado ERYR CLIR. Os ECOFF estimados permitiram identificar isolados “non wild-type” para alguns dos antibióticos e biocidas testados. Identificaram-se ainda dois isolados (7,1%) com produção de biofilme moderada ou forte. Neste trabalho são propostos valores de ECOFF que poderão ser aplicados em estudos futuros de vigilância da resistência aos antibióticos e biocidas em S. schleiferi. Este é um dos poucos estudos sobre S. schleiferi em Portugal, sendo o primeiro a documentar estirpes MRSS associadas à SSTIs caninas no nosso país, destacando a emergência de resistência aos antibióticos neste agente patogénico, alguns dos quais de importância elevada ou crítica na medicina humana. |
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Estudo da resistência a biocidas e antibióticos em estafilococos associados a infeções em animais de companhiaStaphylococcus schleiferAntibióticosSSTIBiocidasResistênciaStaphylococcus schleiferiSSTIsAntibioticBiocideResistanceCiências MédicasRESUMO: A espécie Staphylococcus schleiferi é o segundo agente patogénico mais frequentemente associado a infeções da pele e tecidos moles (SSTIs) em cães. Esta Dissertação teve como objetivo estudar a suscetibilidade de uma coleção de S. schleiferi associada à SSTIs caninas, a antibióticos e biocidas associados à terapêutica destas infeções. A coleção inicial englobou todos os isolados (n = 89) identificados como S. schleiferi ou Staphylococcus spp. em dois laboratórios veterinários em Lisboa, entre 1999 e 2018. A identificação ao nível de espécie foi feita por amplificação do gene nuc e ao nível da subespécie pela produção de urease. A suscetibilidade aos antibióticos e biocidas foi avaliada por Kirby-Bauer e determinação de concentrações mínimas inibitórias (CMI), respetivamente. A distribuição de halos de inibição e de CMIs foi usada para estimar valores de “cut-off” epidemiológicos (ECOFFs). A presença de genes de resistência foi pesquisada por PCR. A produção de biofilme foi avaliada pelo método de cristal de violeta. Dos 89 isolados testados, 28 foram identificados como S. schleiferi, correspondendo a 27 S. schleiferi subsp. coagulans e um S. schleiferi subsp. schleiferi. Dos 28 isolados, dois (7,1%) são resistentes à meticilina (MRSS, mecA+) e cinco (17,8%) são multirresistentes. Observou-se também resistência à penicilina (PEN) (18/28, 64,3%), às fluoroquinolonas (12/28, 42,9%), à eritromicina (ERY) e clindamicina (CLI) (3/28, 10,7%), ao ácido fusídico (3/28, 10,7%) e à tetraciclina (1/28, 3,6%). O gene blaZ foi detetado em 16 isolados PENR e o erm(B) num isolado ERYR CLIR. Os ECOFF estimados permitiram identificar isolados “non wild-type” para alguns dos antibióticos e biocidas testados. Identificaram-se ainda dois isolados (7,1%) com produção de biofilme moderada ou forte. Neste trabalho são propostos valores de ECOFF que poderão ser aplicados em estudos futuros de vigilância da resistência aos antibióticos e biocidas em S. schleiferi. Este é um dos poucos estudos sobre S. schleiferi em Portugal, sendo o primeiro a documentar estirpes MRSS associadas à SSTIs caninas no nosso país, destacando a emergência de resistência aos antibióticos neste agente patogénico, alguns dos quais de importância elevada ou crítica na medicina humana.ABSTRACT: Staphylococcus schleiferi is the second most frequent pathogen associated with skin and soft tissue infections (SSTIs) in dogs. This Thesis aims to study the susceptibility of a collection of S. schleiferi causing canine SSTIs to antibiotics and biocides associated with SSTIs therapeutics. The initial collection comprised all isolates (n = 89) identified as S. schleiferi or Staphylococcus spp. in two veterinary laboratories in Lisbon, between 1999 and 2018. The isolates were identified at the species level by a species specific nuc gene PCR, and at the subspecies level by urease production. Antibiotic and biocide susceptibility were evaluated by disk diffusion and determination of minimum inhibitory concentrations (MIC), respectively. The distributions of MICs and inhibition zones were used to estimate epidemiological cut-off (ECOFF) values. The presence of resistance genes was screened by PCR. Biofilm production was evaluated by the crystal violet method. Of the 89 isolates, 28 were identified as S. schleiferi, which corresponded to 27 S. schleiferi subsp. coagulans and one S. schleiferi subsp. schleiferi. Of the 28 isolates, 2 (7.1%) were methicillin-resistant (MRSS, mecA+) and five (17.8%) were multiresistant. We also observed resistance to penicillin (PEN) (18/28, 64,3%), fluoroquinolones (12/28, 42.9%), to erythromycin (ERY) and clindamycin (CLI) (3/28, 10.7%), to fusidic acid (3/28, 10.7%) and to tetracycline (1/28, 3.6%). The blaZ gene was detected in 16 PENR isolates whereas erm(B) was detected in one ERYR CLIR isolate. The estimated ECOFF revealed non-wild-type isolates towards some of the antibiotics and biocides tested. Two isolates were also identified as moderate or strong biofilm producers. This work provides ECOFF values that can be used in future studies surveilling antibiotic and biocide resistance in S. schleiferi. This is one of the few studies on S. schleiferi in Portugal and the first to report MRSS strains associated with canine SSTIs in our country, highlighting the emergence of resistance to antibiotics in this pathogen, many of which are considered highly or critically important in human medicineCosta, Sofia SantosCouto, Isabel Maria dos Santos LeitãoRUNOliveira, Valéria Joaquina Henrique de2022-10-24T00:30:52Z2019-12-192020-02-282019-12-19T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/93487TID:202428184porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T04:41:52Zoai:run.unl.pt:10362/93487Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:37:46.388105Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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