Resistência primária e diversidade genética do vírus da imunideficiência humana (HIV-1), em amostras de pacientes que iniciaram tratamento antirretroviral (HAART) no Município de Itanhaem - Estado de São Paulo, 2009-2011
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Data de Publicação: | 2013 |
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Resumo: | Introduction: The use of viral genotyping as a tool for the treatment of HIV positive patients is relevant to review health policies concerning the dispensing of antiretrovirals and contribute to mapping the frequency of HIV virus subtypes in our region. Objective: To identify and characterize the genetic diversity and primary resistance to HIV-1 antiretroviral agents in the city of itanhaem in patients at early stage of treatment . Methods: Cross-sectional study using 50 samples. After extraction and RNA transcription Polymerase Chain Reaction was performed with primers (K1, K2, DP10, F2) which produced fragments of 1200 bp, identified in agarose gel. After purification of PCR products, the fragments were subjected to sequencing reaction. Genetic diversity was analyzed throuh the comparison to the Stanford HIV drug resistance database . Qualitative variables were presented as absolute and relative values. Quantitative variables were presented through their values of central tendency and dispersion. Results: Among the 50 samples, 25 were amplified for analysis of genetic diversity, obtaining results in 13 (52%) female patients and 12 (48%) male patients. Eleven patients (44%) presented mutation in reverse transcriptase with high-level resistance to efavirez ripivirine and 7 patients (28%) presented mutations in the protease with low resistance. Four (16%) recombinant subtypes F / B were found. Conclusion: In the city of Itanhém 52% of the analyzed samples presented acquired resistance. The predominant primary resistance was to NNRTI (11 patients, representing 44%) group; One patient (4%) was found resistant to NRTI group. One patient (4%) was resistant to IP 1 group and one patient (4%) presented resistance to both NRTI and NNRTI groups. We conclude that health policies shoud be implemented considerinG genotyping as a tool to be be offered regionally, respecting the epidemiologic aspects of the disease in each city. A major 10 research concerning the most common subtype of the virus shoud be taken in our region, in order to determine the most effective drugs for antiretroviral therapy. |
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Objective: To identify and characterize the genetic diversity and primary resistance to HIV-1 antiretroviral agents in the city of itanhaem in patients at early stage of treatment . Methods: Cross-sectional study using 50 samples. After extraction and RNA transcription Polymerase Chain Reaction was performed with primers (K1, K2, DP10, F2) which produced fragments of 1200 bp, identified in agarose gel. After purification of PCR products, the fragments were subjected to sequencing reaction. Genetic diversity was analyzed throuh the comparison to the Stanford HIV drug resistance database . Qualitative variables were presented as absolute and relative values. Quantitative variables were presented through their values of central tendency and dispersion. Results: Among the 50 samples, 25 were amplified for analysis of genetic diversity, obtaining results in 13 (52%) female patients and 12 (48%) male patients. Eleven patients (44%) presented mutation in reverse transcriptase with high-level resistance to efavirez ripivirine and 7 patients (28%) presented mutations in the protease with low resistance. Four (16%) recombinant subtypes F / B were found. Conclusion: In the city of Itanhém 52% of the analyzed samples presented acquired resistance. The predominant primary resistance was to NNRTI (11 patients, representing 44%) group; One patient (4%) was found resistant to NRTI group. One patient (4%) was resistant to IP 1 group and one patient (4%) presented resistance to both NRTI and NNRTI groups. We conclude that health policies shoud be implemented considerinG genotyping as a tool to be be offered regionally, respecting the epidemiologic aspects of the disease in each city. A major 10 research concerning the most common subtype of the virus shoud be taken in our region, in order to determine the most effective drugs for antiretroviral therapy.Introdução: A utilização da genotipagem viral como instrumento para o tratamento dos pacientes HIV positivo é relevante para rever as políticas de saúde concernentes a dispensação de antiretrovirais e contribuir para o mapeamento da freqüência do subtipo do vírus do HIV na região. Objetivo: Identificar e caracterizar a diversidade genética e a resistência primária do HIV-1 aos agentes antirretrovirais no município de Itanhaém, em pacientes em início de tratamento. Método: Estudo Transversal utilizando 50 amostras. Após a extração e trancrição do RNA foi realizada a Reação em Cadeia da Polimerase em primers(K1, K2, DP10, F2) que produziu fragmentos de 1200 pares de bases, identificados no gel de agarose. Apos a purificação dos produtos da PCR, os fragmentos foram submetidos à reação de seqüenciamento. A diversidade genética foi analisada no banco de dados HIV drug resistance database (Stanford). As variáveis qualitativas foram apresentadas através de valores absolutos e relativos. As variáveis quantitativas foram apresentadas através dos seus valores de tendência central e de dispersão. Resultados: Das 50 amostras, 25 foram amplificados para analise da diversidade genética, 13(52%) feminino e12(48%) masculino. Sendo 11(44%) identificadas com mutação na transcriptase reversa com alto nível de resistência ao efavirez ripivirine 7(28%) apresentado mutações na protease com baixo nível de resistência. Foram encontrados 4(16%) recombinantes do subtipos F/B. Conclusão: A resistência adquirida no município de Itanhaém foi de 52 % nas amostras analisadas. A resistência primaria predominante foi aos ITRNN- 11 (44 %); ITRN -1 (4 %) e aos IP -1 (4 %) e 1 (4 %) caso de resistência a dois grupos ITRNN e ITRN . Em vista disto as políticas de saúde devem considerar que a genotipagem 8 é um instrumento que deve ser oferecido regionalmente conforme o perfil epidemiológico da doença de cada município, possibilitando o estudo do subtipo do vírus mais freqüente na região afim de utilizar as drogas mais eficientes para a terapia antirretroviral.application/pdfporUniversidade Católica de SantosMestrado em Saúde ColetivaCatólica de SantosBrasilCentro de Ciências Sociais Aplicadas e SaúdeDIAS, Wellington. Resistência primária e diversidade genética do vírus da imunideficiência humana (HIV-1), em amostras de pacientes que iniciaram tratamento antirretroviral (HAART) no Município de Itanhaem - Estado de São Paulo, 2009-2011. 2012. 89 f. Dissertação (mestrado) - Universidade Católica de Santos, Santos, 2012.resistência primária HIV 1; antirretrovirais; genotipagem do HIVprimary resistance of HIV-1; anti retroviral; HIV genotypingCIENCIAS DA SAUDE::SAUDE COLETIVAResistência primária e diversidade genética do vírus da imunideficiência humana (HIV-1), em amostras de pacientes que iniciaram tratamento antirretroviral (HAART) no Município de Itanhaem - Estado de São Paulo, 2009-2011Primary resistance and genetic diversity of human immunodeficiency Virus (hiv-1) insamples collected from patients at early stage Of antiretroviral treatment(haart) in the city of itanhaém - state Of são paulo, from 2009 to 2011info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UNISANTOSinstname:Universidade Católica de Santos (UNISANTOS)instacron:UNISANTOSLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165https://tede.unisantos.br/bitstream/tede/1401/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51ORIGINALWellington Dias.pdfWellington Dias.pdfDissertação_Mestrado em Saúde Coletivaapplication/pdf2827942https://tede.unisantos.br/bitstream/tede/1401/2/Wellington%20Dias.pdf17fd5915b3792de99e3b58f162440777MD52TEXTWellington Dias.pdf.txtWellington Dias.pdf.txtExtracted texttext/plain83299https://tede.unisantos.br/bitstream/tede/1401/3/Wellington%20Dias.pdf.txtc3cfdbfd579511dc5c250aa2f6b163f7MD53THUMBNAILWellington Dias.pdf.jpgWellington Dias.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1339https://tede.unisantos.br/bitstream/tede/1401/4/Wellington%20Dias.pdf.jpg5a2cae5fdd97522496c45c29313d560dMD54tede/14012021-10-04 18:29:44.0oai:tede.unisantos.br:tede/1401Tk9UQTogQ09MT1FVRSBBUVVJIEEgU1VBIFBSw5NQUklBIExJQ0VOw4dBCkVzdGEgbGljZW7Dp2EgZGUgZXhlbXBsbyDDqSBmb3JuZWNpZGEgYXBlbmFzIHBhcmEgZmlucyBpbmZvcm1hdGl2b3MuCgpMSUNFTsOHQSBERSBESVNUUklCVUnDh8ODTyBOw4NPLUVYQ0xVU0lWQQoKQ29tIGEgYXByZXNlbnRhw6fDo28gZGVzdGEgbGljZW7Dp2EsIHZvY8OqIChvIGF1dG9yIChlcykgb3UgbyB0aXR1bGFyIGRvcyBkaXJlaXRvcyBkZSBhdXRvcikgY29uY2VkZSDDoCBVbml2ZXJzaWRhZGUgClhYWCAoU2lnbGEgZGEgVW5pdmVyc2lkYWRlKSBvIGRpcmVpdG8gbsOjby1leGNsdXNpdm8gZGUgcmVwcm9kdXppciwgIHRyYWR1emlyIChjb25mb3JtZSBkZWZpbmlkbyBhYmFpeG8pLCBlL291IApkaXN0cmlidWlyIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyAoaW5jbHVpbmRvIG8gcmVzdW1vKSBwb3IgdG9kbyBvIG11bmRvIG5vIGZvcm1hdG8gaW1wcmVzc28gZSBlbGV0csO0bmljbyBlIAplbSBxdWFscXVlciBtZWlvLCBpbmNsdWluZG8gb3MgZm9ybWF0b3Mgw6F1ZGlvIG91IHbDrWRlby4KClZvY8OqIGNvbmNvcmRhIHF1ZSBhIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSBwb2RlLCBzZW0gYWx0ZXJhciBvIGNvbnRlw7pkbywgdHJhbnNwb3IgYSBzdWEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvIApwYXJhIHF1YWxxdWVyIG1laW8gb3UgZm9ybWF0byBwYXJhIGZpbnMgZGUgcHJlc2VydmHDp8Ojby4KClZvY8OqIHRhbWLDqW0gY29uY29yZGEgcXVlIGEgU2lnbGEgZGUgVW5pdmVyc2lkYWRlIHBvZGUgbWFudGVyIG1haXMgZGUgdW1hIGPDs3BpYSBhIHN1YSB0ZXNlIG91IApkaXNzZXJ0YcOnw6NvIHBhcmEgZmlucyBkZSBzZWd1cmFuw6dhLCBiYWNrLXVwIGUgcHJlc2VydmHDp8Ojby4KClZvY8OqIGRlY2xhcmEgcXVlIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyDDqSBvcmlnaW5hbCBlIHF1ZSB2b2PDqiB0ZW0gbyBwb2RlciBkZSBjb25jZWRlciBvcyBkaXJlaXRvcyBjb250aWRvcyAKbmVzdGEgbGljZW7Dp2EuIFZvY8OqIHRhbWLDqW0gZGVjbGFyYSBxdWUgbyBkZXDDs3NpdG8gZGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyBuw6NvLCBxdWUgc2VqYSBkZSBzZXUgCmNvbmhlY2ltZW50bywgaW5mcmluZ2UgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgZGUgbmluZ3XDqW0uCgpDYXNvIGEgc3VhIHRlc2Ugb3UgZGlzc2VydGHDp8OjbyBjb250ZW5oYSBtYXRlcmlhbCBxdWUgdm9jw6ogbsOjbyBwb3NzdWkgYSB0aXR1bGFyaWRhZGUgZG9zIGRpcmVpdG9zIGF1dG9yYWlzLCB2b2PDqiAKZGVjbGFyYSBxdWUgb2J0ZXZlIGEgcGVybWlzc8OjbyBpcnJlc3RyaXRhIGRvIGRldGVudG9yIGRvcyBkaXJlaXRvcyBhdXRvcmFpcyBwYXJhIGNvbmNlZGVyIMOgIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSAKb3MgZGlyZWl0b3MgYXByZXNlbnRhZG9zIG5lc3RhIGxpY2Vuw6dhLCBlIHF1ZSBlc3NlIG1hdGVyaWFsIGRlIHByb3ByaWVkYWRlIGRlIHRlcmNlaXJvcyBlc3TDoSBjbGFyYW1lbnRlIAppZGVudGlmaWNhZG8gZSByZWNvbmhlY2lkbyBubyB0ZXh0byBvdSBubyBjb250ZcO6ZG8gZGEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvIG9yYSBkZXBvc2l0YWRhLgoKQ0FTTyBBIFRFU0UgT1UgRElTU0VSVEHDh8ODTyBPUkEgREVQT1NJVEFEQSBURU5IQSBTSURPIFJFU1VMVEFETyBERSBVTSBQQVRST0PDjU5JTyBPVSAKQVBPSU8gREUgVU1BIEFHw4pOQ0lBIERFIEZPTUVOVE8gT1UgT1VUUk8gT1JHQU5JU01PIFFVRSBOw4NPIFNFSkEgQSBTSUdMQSBERSAKVU5JVkVSU0lEQURFLCBWT0PDiiBERUNMQVJBIFFVRSBSRVNQRUlUT1UgVE9ET1MgRSBRVUFJU1FVRVIgRElSRUlUT1MgREUgUkVWSVPDg08gQ09NTyAKVEFNQsOJTSBBUyBERU1BSVMgT0JSSUdBw4fDlUVTIEVYSUdJREFTIFBPUiBDT05UUkFUTyBPVSBBQ09SRE8uCgpBIFNpZ2xhIGRlIFVuaXZlcnNpZGFkZSBzZSBjb21wcm9tZXRlIGEgaWRlbnRpZmljYXIgY2xhcmFtZW50ZSBvIHNldSBub21lIChzKSBvdSBvKHMpIG5vbWUocykgZG8ocykgCmRldGVudG9yKGVzKSBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgZGEgdGVzZSBvdSBkaXNzZXJ0YcOnw6NvLCBlIG7Do28gZmFyw6EgcXVhbHF1ZXIgYWx0ZXJhw6fDo28sIGFsw6ltIGRhcXVlbGFzIApjb25jZWRpZGFzIHBvciBlc3RhIGxpY2Vuw6dhLgo=Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://biblioteca.unisantos.br:8181/http://biblioteca.unisantos.br:8181/oai/requestmrita.biblio@unisantos.br||mrita.biblio@unisantos.bropendoar:47132021-10-04T21:29:44Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UNISANTOS - Universidade Católica de Santos (UNISANTOS)false |
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