Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Patty Karina dos
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSCAR
Texto Completo: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5511
Resumo: Universidade Federal de Sao Carlos
id SCAR_2057e29bc292f1224cb376f2a83451f7
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5511
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str 4322
spelling Santos, Patty Karina dosAraújo, Heloísa Sobreiro Selistre dehttp://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4787059Y2http://lattes.cnpq.br/18592949871661626ea59125-b4d6-47f9-93d5-69fc2953153c2016-06-02T20:21:30Z2013-04-182016-06-02T20:21:30Z2013-02-25SANTOS, Patty Karina dos. Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata. 2013. 117 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5511Universidade Federal de Sao CarlosA serpente Lachesis muta rhombeata (Viperidae), popularmente conhecida como surucucu pico-de-jaca, é uma subespécie de Lachesis muta endêmica na Mata Atlântica brasileira, podendo ser encontrada do Ceará até o Rio de Janeiro. O gênero Lachesis apresenta uma peçonha complexa que engloba diferentes proteínas que possuem uma ampla variedade de atividades biológicas, como por exemplo, aquelas que afetam os fatores da coagulação sanguínea, agem na fibrinólise, provocam uma ação inflamatória no local da picada, e induzem um choque hipotensivo. Com o auxílio de técnicas proteômicas e de Bioinformática, este projeto teve como objetivo principal analisar o proteoma da peçonha de L. m. rhombeata, identificando as principais famílias proteicas presentes. Para isso, 200μg da peçonha desta serpente foram aplicados em géis bidimensionais-2D. As proteínas obtidas foram extraídas dos géis, tratadas, e posteriormente identificadas e analisadas por meio de espectrometria de massas (MALDI-TOF/TOF). Os arquivos brutos provenientes dessas análises foram aplicados no programa MASCOT utilizando para a identificação proteica o banco de dados SwissProt e como especificação taxonômica o banco de dados SNAKES contido no site do NCBI. Foram identificadas 11 famílias proteicas: PLA2s (37,93%), inibidores de proteases (22,41%), proteínas de sinalização intracelular (13,79%), NGFs (5,17%), metaloproteases (3,45%), fatores associados à DDB1 e CUL4 (3,45%), oxidorredutases (3,45%), proteínas de transdução de sinal (1,72%), componentes do complemento (1,72%), proteínas NipSnap (1,72%) e proteínas lin-7 (1,72%), das quais a grande maioria é de função metabólica e ajuda na difusão/entrada dos componentes tóxicos no organismo da vítima/presa. Cerca de 1-5mg da mesma peçonha também foram analisados por meio de FPLC e sequenciamento proteico e as proteínas obtidas foram identificadas por meio de busca no banco de dados nr (nonredundant protein sequences) do NCBI utilizando a ferramenta blast-p. As seguintes famílias proteicas foram encontradas: serinoproteases (30,03%), metaloproteases (24,17%), BPPs (19,64%), PLA2s (14,95%), lectinas tipo C (1,94%), LAAOs (1,40%) e metaloendopeptidases (0,73%), ressaltando a toxicidade da peçonha. Os dois resultados obtidos foram comparados com proteomas de outras serpentes do gênero Lachesis encontrados na literatura. Observou-se que há uma grande similaridade entre os proteomas das peçonhas deste gênero, mas que alguns componentes proteicos são diferenciais e assim, podem ajudar na taxonomia destas serpentes, mantendo-as em suas respectivas espécies e subespécies. Além disso, a peçonha também foi analisada por eletroforese unidimensional (SDS-PAGE) para avaliar se o espécime em estudo era um neonato, um juvenil ou um adulto. A presença de uma proteína similar à mutalisina II (metaloprotease) confirmou que a L. m. rhombeata utilizada neste estudo era uma adulta. O conhecimento do proteoma da peçonha de L. m. rhombeata auxiliará (1) os estudos envolvendo a Sistemática do gênero e (2) a produção de novos fármacos que poderão ser desenvolvidos para o tratamento de diversas doenças.application/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRBiologia molecularProteômicaLachesis muta rhombeataPeçonhaEspectrometria de massasSequenciamento proteicoblast-pPeçonha de serpenteCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAProteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeatainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-1-1b61211db-d955-45b7-886e-a0cefb89980finfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINAL5001.pdfapplication/pdf2740278https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/1/5001.pdf9d646e9df12b2864a43bac973517db51MD51TEXT5001.pdf.txt5001.pdf.txtExtracted texttext/plain0https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/2/5001.pdf.txtd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD52THUMBNAIL5001.pdf.jpg5001.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5639https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/3/5001.pdf.jpgaa6bb96671c672acfcaf153afdefbbf6MD53ufscar/55112023-09-18 18:31:08.637oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5511Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222023-09-18T18:31:08Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
title Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
spellingShingle Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
Santos, Patty Karina dos
Biologia molecular
Proteômica
Lachesis muta rhombeata
Peçonha
Espectrometria de massas
Sequenciamento proteico
blast-p
Peçonha de serpente
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
title_short Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
title_full Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
title_fullStr Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
title_full_unstemmed Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
title_sort Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata
author Santos, Patty Karina dos
author_facet Santos, Patty Karina dos
author_role author
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1859294987166162
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Patty Karina dos
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Araújo, Heloísa Sobreiro Selistre de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4787059Y2
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 6ea59125-b4d6-47f9-93d5-69fc2953153c
contributor_str_mv Araújo, Heloísa Sobreiro Selistre de
dc.subject.por.fl_str_mv Biologia molecular
Proteômica
Lachesis muta rhombeata
Peçonha
Espectrometria de massas
Sequenciamento proteico
blast-p
Peçonha de serpente
topic Biologia molecular
Proteômica
Lachesis muta rhombeata
Peçonha
Espectrometria de massas
Sequenciamento proteico
blast-p
Peçonha de serpente
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
description Universidade Federal de Sao Carlos
publishDate 2013
dc.date.available.fl_str_mv 2013-04-18
2016-06-02T20:21:30Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2013-02-25
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-06-02T20:21:30Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SANTOS, Patty Karina dos. Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata. 2013. 117 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5511
identifier_str_mv SANTOS, Patty Karina dos. Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata. 2013. 117 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2013.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5511
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.confidence.fl_str_mv -1
-1
dc.relation.authority.fl_str_mv b61211db-d955-45b7-886e-a0cefb89980f
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/1/5001.pdf
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/2/5001.pdf.txt
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5511/3/5001.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 9d646e9df12b2864a43bac973517db51
d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e
aa6bb96671c672acfcaf153afdefbbf6
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813715544666275840