Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFSCAR |
Texto Completo: | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/336 |
Resumo: | This work presents a computer aided system for automated counting of colony formation units in Petri dishes. The method implemented uses digital image processing, and among them Hough transform for circular objects and Match for correlation with objects having different forms. The method was developed based on the visual Borland Builderr C++ environment, and for the image acquisition a luminance equalization system was used to allow stabilized and continuous 1,200 lux. For the validation of the method, samples containing Acidithiobacillus ferrooxidans, Escherichia Coli, and Staphylococcus aureus were analyzed. Results have shown the potentiality of the methodology, which is applied for laboratory applications that involved the quantification of bacterial colonies in a solid culture environment. |
id |
SCAR_77dc7e54c514b4845a73fa286ac834b4 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/336 |
network_acronym_str |
SCAR |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
repository_id_str |
4322 |
spelling |
Alves, Gabriel MarcelinoCruvinel, Paulo Estevãohttp://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4788587J6http://lattes.cnpq.br/5710041471208439290a0133-8553-4dd7-8204-e92a85217ba32016-06-02T19:05:22Z2006-12-202016-06-02T19:05:22Z2006-08-17ALVES, Gabriel Marcelino. Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias.. 2006. 125 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/336This work presents a computer aided system for automated counting of colony formation units in Petri dishes. The method implemented uses digital image processing, and among them Hough transform for circular objects and Match for correlation with objects having different forms. The method was developed based on the visual Borland Builderr C++ environment, and for the image acquisition a luminance equalization system was used to allow stabilized and continuous 1,200 lux. For the validation of the method, samples containing Acidithiobacillus ferrooxidans, Escherichia Coli, and Staphylococcus aureus were analyzed. Results have shown the potentiality of the methodology, which is applied for laboratory applications that involved the quantification of bacterial colonies in a solid culture environment.Este trabalho apresenta um sistema, assistido por computador, para a contagem automática de Unidades Formadoras de Colônias bacterianas em placas de Petri. O método implementado no sistema utiliza-se de técnicas do processamento digital de imagens, dentre elas a transformada de Hough adaptada para objetos circulares e Match por correlação para objetos de natureza diversa. O sistema computacional foi desenvolvido em ambiente visual Borland Builderr C++ e para a aquisição das imagens das amostras foi elaborado um sistema de iluminação, o qual viabilizou a equalização do nível de iluminância para 1.200 lux e melhorou a formação das imagens. Para a validação do método foram ensaiadas amostras de Acidithiobacillus ferrooxidans, Escherichia Coli e Staphylococcus aureus. Resultados mostram a potencialidade da metodologia desenvolvida para aplicações laboratoriais que envolvam a quantificação de colônias bacterianas em meios de cultivo sólido.application/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Ciência da Computação - PPGCCUFSCarBRProcessamento de imagensTransformada de HoughMatch por correlaçãoMicroorganismos - contagemCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOMétodo fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colôniasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-1-1d6a8fce8-6aad-4994-aa24-bf1c60ccbaccinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALDissGMA.pdfapplication/pdf4202044https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/1/DissGMA.pdfbea6c57857111bd0f8123ccd46b6a280MD51TEXTDissGMA.pdf.txtDissGMA.pdf.txtExtracted texttext/plain182911https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/2/DissGMA.pdf.txtffa3f3da64a36bc5c0fc33ddfe92479cMD52THUMBNAILDissGMA.pdf.jpgDissGMA.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6354https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/3/DissGMA.pdf.jpg05c67e78d659066f610d73077b32fb37MD53ufscar/3362023-09-18 18:30:37.188oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/336Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222023-09-18T18:30:37Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
title |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
spellingShingle |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias Alves, Gabriel Marcelino Processamento de imagens Transformada de Hough Match por correlação Microorganismos - contagem CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO |
title_short |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
title_full |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
title_fullStr |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
title_full_unstemmed |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
title_sort |
Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias |
author |
Alves, Gabriel Marcelino |
author_facet |
Alves, Gabriel Marcelino |
author_role |
author |
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/5710041471208439 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Alves, Gabriel Marcelino |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Cruvinel, Paulo Estevão |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4788587J6 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
290a0133-8553-4dd7-8204-e92a85217ba3 |
contributor_str_mv |
Cruvinel, Paulo Estevão |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Processamento de imagens Transformada de Hough Match por correlação Microorganismos - contagem |
topic |
Processamento de imagens Transformada de Hough Match por correlação Microorganismos - contagem CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO |
description |
This work presents a computer aided system for automated counting of colony formation units in Petri dishes. The method implemented uses digital image processing, and among them Hough transform for circular objects and Match for correlation with objects having different forms. The method was developed based on the visual Borland Builderr C++ environment, and for the image acquisition a luminance equalization system was used to allow stabilized and continuous 1,200 lux. For the validation of the method, samples containing Acidithiobacillus ferrooxidans, Escherichia Coli, and Staphylococcus aureus were analyzed. Results have shown the potentiality of the methodology, which is applied for laboratory applications that involved the quantification of bacterial colonies in a solid culture environment. |
publishDate |
2006 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2006-12-20 2016-06-02T19:05:22Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2006-08-17 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-06-02T19:05:22Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
ALVES, Gabriel Marcelino. Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias.. 2006. 125 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/336 |
identifier_str_mv |
ALVES, Gabriel Marcelino. Método fundamentado em processamento digital de imagens para contagem automática de unidades formadoras de colônias.. 2006. 125 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006. |
url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/336 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
-1 -1 |
dc.relation.authority.fl_str_mv |
d6a8fce8-6aad-4994-aa24-bf1c60ccbacc |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação - PPGCC |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
instacron_str |
UFSCAR |
institution |
UFSCAR |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/1/DissGMA.pdf https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/2/DissGMA.pdf.txt https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/336/3/DissGMA.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
bea6c57857111bd0f8123ccd46b6a280 ffa3f3da64a36bc5c0fc33ddfe92479c 05c67e78d659066f610d73077b32fb37 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1813715501918978048 |