Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sánchez, Liliana Torcoroma García
Data de Publicação: 2001
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSCAR
Texto Completo: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5367
Resumo: The parasitic Trypanosoma brucei is the causative agent of African Trypanosomiasis (sleeping sickness) in humans, and nagana in animals and is responsible for heavy socioeconomic losses in most countries of sub-Saharan Africa. Therapy against sleeping sickness is unsatisfactory because the toxicity and arising of the drug resistant parasites. Trypanosomatids contain a single mitochondrion, the kinetoplast, whose genetic code deviates from the universal code where a UGA stop codon is used as a Trp codon. A single nuclear-encoded tRNATrp(CCA), that can decode the canonical Trp codon, is used by both the nucleus and mitochondria genes. A C to U editing event at position 34 of tRNATrp(CCA) changes the anticodon from CCA to UCA allowing the decoding of the UGA stop codon to Trp from the mitochondrial genes. We have identified two different nuclear-encoded tryptophanyl-tRNA-synthetase (WARSs) genes (one cytoplasmic (WARS1) and the other to the kinetoplast (WARS2)) in both Leishmania and Trypanosoma cells. With the purpose to validate the mitochondrial WARS enzymes of trypanosomatids, as potential drug targets, we performed gene silencing (RNAi) experiments with both WARSs forms from T. brucei. In the conditions tested, the expression of dsRNA from a dual promoter system generated potent RNA silencing, leading to clear phenotypes characterized by morphologic alterations, severe growth inhibition, reduction in the levels of oxygen consumed (only TbWARS2) and cellular death. The efficiency and specificity of silencing were estimated by quantitative PCR and significant modifications of the specific amount of TbWARSs mRNA were evidenced.
id SCAR_b761e103ce931b9966b08ec8facc4512
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5367
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str 4322
spelling Sánchez, Liliana Torcoroma GarcíaThiemann, Otávio Henriquehttp://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4788564Y171459005-ce86-4d26-bb31-cd53a70dff9a2016-06-02T20:20:27Z2009-02-192016-06-02T20:20:27Z2001-06-21SÁNCHEZ, Liliana Torcoroma García. Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência.. 2001. 145 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2001.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5367The parasitic Trypanosoma brucei is the causative agent of African Trypanosomiasis (sleeping sickness) in humans, and nagana in animals and is responsible for heavy socioeconomic losses in most countries of sub-Saharan Africa. Therapy against sleeping sickness is unsatisfactory because the toxicity and arising of the drug resistant parasites. Trypanosomatids contain a single mitochondrion, the kinetoplast, whose genetic code deviates from the universal code where a UGA stop codon is used as a Trp codon. A single nuclear-encoded tRNATrp(CCA), that can decode the canonical Trp codon, is used by both the nucleus and mitochondria genes. A C to U editing event at position 34 of tRNATrp(CCA) changes the anticodon from CCA to UCA allowing the decoding of the UGA stop codon to Trp from the mitochondrial genes. We have identified two different nuclear-encoded tryptophanyl-tRNA-synthetase (WARSs) genes (one cytoplasmic (WARS1) and the other to the kinetoplast (WARS2)) in both Leishmania and Trypanosoma cells. With the purpose to validate the mitochondrial WARS enzymes of trypanosomatids, as potential drug targets, we performed gene silencing (RNAi) experiments with both WARSs forms from T. brucei. In the conditions tested, the expression of dsRNA from a dual promoter system generated potent RNA silencing, leading to clear phenotypes characterized by morphologic alterations, severe growth inhibition, reduction in the levels of oxygen consumed (only TbWARS2) and cellular death. The efficiency and specificity of silencing were estimated by quantitative PCR and significant modifications of the specific amount of TbWARSs mRNA were evidenced.O parasita Trypanosoma brucei é o agente causal da Tripanossomíases Africana (doença do sono) em humanos e nagana em animais, cujo impacto socioeconômico é devastador nos paises sub-Saharianos da África. Atualmente, as terapias existentes contra esta doença são insatisfatórias, devido a sua toxicidade e ao surgimento de linhagens resistentes. Tripanosomatídeos contem uma simples mitocôndria, o kinetoplasto, cujo código genético desvia do código universal, onde o códon de parada UGA é usado como códon para Trp. Um simples tRNATrp(CCA) codificado no núcleo, decodifica o códon canônico Trp, usado para a tradução dos genes nucleares e mitocondriais. O evento de editoramento C por U na posição 34 do tRNATrp(CCA) muda o anticódon de CCA para UCA, permitindo a decodificação do códon de parada UGA para Trp, nos genes mitocondriais. No genoma de Leishmania e Trypanosoma, foram identificados dois genes nucleares para Triptofanil-tRNA sintetases (WARSs), uma citoplasmática (WARS1) e outra mitocondrial (WARS2). Com o propósito de validar a WARS mitocondrial de tripanosomatídeos, como um potencial alvo farmacológico, foi realizado o silenciamento gênico (RNAi) de ambos genes WARSs de T. brucei. Nas condições testadas, a expressão do dsRNA gerou um potente silenciamento, levando ao desenvolvimento de um fenótipo caracterizado por alterações morfológicas, drástica inibição do crescimento, redução nos níveis de oxigênio consumido (somente na TbWARS2) e morte celular. A eficiência e especificidade do silenciamento foram estimadas por PCR quantitativo e foram evidenciadas significativas modificações na quantidade de mRNA específico para as TbWARSs.Financiadora de Estudos e Projetosapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRGenéticaEvoluçãoTripanosomíase africanaKinetoplastídeosCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAEfeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferênciainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis-1-1cc6c7897-1c5e-41af-8e84-9c960b60ad3binfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALTeseLTGS.pdfapplication/pdf4761977https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5367/1/TeseLTGS.pdffd63c5cb5025f3d28cda158a969b6afdMD51THUMBNAILTeseLTGS.pdf.jpgTeseLTGS.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8201https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5367/2/TeseLTGS.pdf.jpga369c86d25b99ce670a730d4c97cffcbMD52ufscar/53672023-09-18 18:31:06.745oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5367Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222023-09-18T18:31:06Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
title Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
spellingShingle Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
Sánchez, Liliana Torcoroma García
Genética
Evolução
Tripanosomíase africana
Kinetoplastídeos
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
title_short Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
title_full Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
title_fullStr Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
title_full_unstemmed Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
title_sort Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência
author Sánchez, Liliana Torcoroma García
author_facet Sánchez, Liliana Torcoroma García
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Sánchez, Liliana Torcoroma García
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Thiemann, Otávio Henrique
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4788564Y1
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 71459005-ce86-4d26-bb31-cd53a70dff9a
contributor_str_mv Thiemann, Otávio Henrique
dc.subject.por.fl_str_mv Genética
Evolução
Tripanosomíase africana
Kinetoplastídeos
topic Genética
Evolução
Tripanosomíase africana
Kinetoplastídeos
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
description The parasitic Trypanosoma brucei is the causative agent of African Trypanosomiasis (sleeping sickness) in humans, and nagana in animals and is responsible for heavy socioeconomic losses in most countries of sub-Saharan Africa. Therapy against sleeping sickness is unsatisfactory because the toxicity and arising of the drug resistant parasites. Trypanosomatids contain a single mitochondrion, the kinetoplast, whose genetic code deviates from the universal code where a UGA stop codon is used as a Trp codon. A single nuclear-encoded tRNATrp(CCA), that can decode the canonical Trp codon, is used by both the nucleus and mitochondria genes. A C to U editing event at position 34 of tRNATrp(CCA) changes the anticodon from CCA to UCA allowing the decoding of the UGA stop codon to Trp from the mitochondrial genes. We have identified two different nuclear-encoded tryptophanyl-tRNA-synthetase (WARSs) genes (one cytoplasmic (WARS1) and the other to the kinetoplast (WARS2)) in both Leishmania and Trypanosoma cells. With the purpose to validate the mitochondrial WARS enzymes of trypanosomatids, as potential drug targets, we performed gene silencing (RNAi) experiments with both WARSs forms from T. brucei. In the conditions tested, the expression of dsRNA from a dual promoter system generated potent RNA silencing, leading to clear phenotypes characterized by morphologic alterations, severe growth inhibition, reduction in the levels of oxygen consumed (only TbWARS2) and cellular death. The efficiency and specificity of silencing were estimated by quantitative PCR and significant modifications of the specific amount of TbWARSs mRNA were evidenced.
publishDate 2001
dc.date.issued.fl_str_mv 2001-06-21
dc.date.available.fl_str_mv 2009-02-19
2016-06-02T20:20:27Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-06-02T20:20:27Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SÁNCHEZ, Liliana Torcoroma García. Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência.. 2001. 145 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2001.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5367
identifier_str_mv SÁNCHEZ, Liliana Torcoroma García. Efeitos do silenciamento de duas Triptofanil-tRNA sintetases de Trypanosoma brucei mediante RNA de interferência.. 2001. 145 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2001.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5367
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.confidence.fl_str_mv -1
-1
dc.relation.authority.fl_str_mv cc6c7897-1c5e-41af-8e84-9c960b60ad3b
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5367/1/TeseLTGS.pdf
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5367/2/TeseLTGS.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv fd63c5cb5025f3d28cda158a969b6afd
a369c86d25b99ce670a730d4c97cffcb
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813715543253843968