Análise de ligação entre as regiões cromossômicas 1q21-23 e 11q12-13 e densidade mineral óssea em pares de irmãs adolescentes

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Borges, Paula Lopes
Data de Publicação: 2008
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12310
Resumo: A baixa densidade mineral óssea (DMO) é um fator determinante para o desenvolvimento da osteoporose. Vários fatores estão diretamente relacionados à DMO, sendo o fator genético um dos principais. Estima-se que a genética explique 60 a 80% da variação no fenótipo DMO. O objetivo do estudo foi analisar a ligação das regiões cromossômicas 1q21-23 e 11q12-13 com as variações da DMO em 44 pares de irmãs no Distrito Federal. A densidade mineral óssea da coluna lombar (L2-L4) e do fêmur proximal (colo do fêmur e quadril total) foi mensurada por um aparelho de absortometria por Raios - X de dupla energia (DXA), com o equipamento modelo Lunar DPX-IQ (Software versão 4.7e). Foram selecionados dezessete marcadores indicadores de ligação com a densidade mineral óssea, nove ao longo do loco 1q21-23 (D1S2635, D1S484, D1S2844, D1S2878, D1S196, D1S452, D1S218, D1S2640, D1S2623) e oito ao longo do loco 11q12-13 (D11S935, D11S4102, D11S905, D11S1313, D11S4191, D11S987, D11S1314, D11S937). Os microssatélites foram amplificados simultaneamente em duas reações de PCR, cada uma para um conjunto de microssatélites referentes a uma região cromossômica. Os alelos foram identificados pela eletroforese em um seqüenciador automático de DNA ABI3130. Em seguida, valores de LOD score para a ligação de cada loco microssatélite com o fenótipo DMO da coluna lombar e do colo do fêmur foram calculados por métodos implementados no pacote MERLIN. Os valores de LOD gerados para todos os marcadores foram menores que 1.0, indicando que as evidências de ligação são baixas ou nulas ou que o número de pares de irmãs foi insuficiente para detectar sinal de ligação. Para a região 1q21-23 o maior valor de LOD foi de 0.04 no marcador D1S196, enquanto que para a região 11q12-13 o maior valor de LOD foi de -0.9 no marcador D11S987. A idade, a estatura e o peso corporal foram utilizados como covariáveis nas análises. Para o conjunto amostral utilizado neste estudo não há evidências de que as regiões 1q21-23 e 11q12-13 estejam ligadas ao fenótipo DMO em adolescente brasileiras.
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spelling Pereira, Rinaldo WellersonBorges, Paula Lopes2019-10-22T13:44:26Z2019-09-272019-10-22T13:44:26Z2008-11BORGES, Paula Lopes. Análise de ligação entre as regiões cromossômicas 1q21-23 e 11q12-13 e densidade mineral óssea em pares de irmãs adolescentes. 2008. 55 f. Monografia (Graduação em Ciências Biológicas) – Universidade Católica de Brasília, Brasília, 2008.https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12310A baixa densidade mineral óssea (DMO) é um fator determinante para o desenvolvimento da osteoporose. Vários fatores estão diretamente relacionados à DMO, sendo o fator genético um dos principais. Estima-se que a genética explique 60 a 80% da variação no fenótipo DMO. O objetivo do estudo foi analisar a ligação das regiões cromossômicas 1q21-23 e 11q12-13 com as variações da DMO em 44 pares de irmãs no Distrito Federal. 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Em seguida, valores de LOD score para a ligação de cada loco microssatélite com o fenótipo DMO da coluna lombar e do colo do fêmur foram calculados por métodos implementados no pacote MERLIN. Os valores de LOD gerados para todos os marcadores foram menores que 1.0, indicando que as evidências de ligação são baixas ou nulas ou que o número de pares de irmãs foi insuficiente para detectar sinal de ligação. Para a região 1q21-23 o maior valor de LOD foi de 0.04 no marcador D1S196, enquanto que para a região 11q12-13 o maior valor de LOD foi de -0.9 no marcador D11S987. A idade, a estatura e o peso corporal foram utilizados como covariáveis nas análises. Para o conjunto amostral utilizado neste estudo não há evidências de que as regiões 1q21-23 e 11q12-13 estejam ligadas ao fenótipo DMO em adolescente brasileiras.The low bone mineral density (BMD) is a major determinant factor for the development of osteoporosis. Several factors are directly related to BMD variability, but the genetics is one of the main contributors. It is estimated that genetics explain around 60 to 80% of BMD variability. The aim of this study was to analyze the potential linkage among chromosomal regions 1q21-23 and 11q12-13 with BMD variation in 44 teenagers female sibpairs from Distrito Federal region. Areal BMDs (g/cm2) at the lumbar spine (L2–L4) and hip (femoral) were measured by dual energy X-ray absorptiometry (DXA) scanners. Linkage for both regions was investigated genotyping seventeen microsatellites selected from literature. At loci 1q21-23 were selected the following nine microsatellites: D1S2635, D1S484, D1S2844, D1S2878, D1S196, D1S452, D1S218, D1S2640, D1S2623. At 11q12- 13 were selected the following eight loci: D11S935, D11S4102, D11S905, D11S1313, D11S4191, D11S987, D11S1314, D11S937). Microsatellites were amplified in two multiplex PCRs, each one with loci from each chromosomal region. Alleles and genotypes were determined after electrophoresis in the automated sequencer ABI3130. LOD scores for the linkage of each microsatellite with BMD from femur and lumbar spine were estimated using methods implemented in MERLIN package. During the analysis, age, height and body weight were used as covariates. The estimated LOD scores for all markers were smaller than 1.0, indicating that the evidence of connection are low or null or that our sample was not large enough to allow linkage signal to be detected. The higher value of LOD estimated for microsatellites in the region 1q21-23 were 0.04 for the marker D1S196. The higher value of LOD estimated for microsatellites in the region 11q12-13 were -0.9 for the marker D11S987. Based on our sample and study design there is no evidence for linkage between regions investigated and DMO in Brazilian teenagers female sibpairs.Submitted by Maria José Martins (mmartins@ucb.br) on 2019-09-27T12:12:29Z No. of bitstreams: 1 PaulaLopesBorgesTCCGraduacao2008.pdf: 872218 bytes, checksum: a43fca6039afb8034fd264580717ea51 (MD5)Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2019-10-22T13:44:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PaulaLopesBorgesTCCGraduacao2008.pdf: 872218 bytes, checksum: a43fca6039afb8034fd264580717ea51 (MD5)Made available in DSpace on 2019-10-22T13:44:26Z (GMT). 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The low bone mineral density (BMD) is a major determinant factor for the development of osteoporosis. Several factors are directly related to BMD variability, but the genetics is one of the main contributors. It is estimated that genetics explain around 60 to 80% of BMD variability. The aim of this study was to analyze the potential linkage among chromosomal regions 1q21-23 and 11q12-13 with BMD variation in 44 teenagers female sibpairs from Distrito Federal region. Areal BMDs (g/cm2) at the lumbar spine (L2–L4) and hip (femoral) were measured by dual energy X-ray absorptiometry (DXA) scanners. Linkage for both regions was investigated genotyping seventeen microsatellites selected from literature. At loci 1q21-23 were selected the following nine microsatellites: D1S2635, D1S484, D1S2844, D1S2878, D1S196, D1S452, D1S218, D1S2640, D1S2623. At 11q12- 13 were selected the following eight loci: D11S935, D11S4102, D11S905, D11S1313, D11S4191, D11S987, D11S1314, D11S937). Microsatellites were amplified in two multiplex PCRs, each one with loci from each chromosomal region. Alleles and genotypes were determined after electrophoresis in the automated sequencer ABI3130. LOD scores for the linkage of each microsatellite with BMD from femur and lumbar spine were estimated using methods implemented in MERLIN package. During the analysis, age, height and body weight were used as covariates. The estimated LOD scores for all markers were smaller than 1.0, indicating that the evidence of connection are low or null or that our sample was not large enough to allow linkage signal to be detected. The higher value of LOD estimated for microsatellites in the region 1q21-23 were 0.04 for the marker D1S196. The higher value of LOD estimated for microsatellites in the region 11q12-13 were -0.9 for the marker D11S987. Based on our sample and study design there is no evidence for linkage between regions investigated and DMO in Brazilian teenagers female sibpairs.
description A baixa densidade mineral óssea (DMO) é um fator determinante para o desenvolvimento da osteoporose. Vários fatores estão diretamente relacionados à DMO, sendo o fator genético um dos principais. Estima-se que a genética explique 60 a 80% da variação no fenótipo DMO. O objetivo do estudo foi analisar a ligação das regiões cromossômicas 1q21-23 e 11q12-13 com as variações da DMO em 44 pares de irmãs no Distrito Federal. A densidade mineral óssea da coluna lombar (L2-L4) e do fêmur proximal (colo do fêmur e quadril total) foi mensurada por um aparelho de absortometria por Raios - X de dupla energia (DXA), com o equipamento modelo Lunar DPX-IQ (Software versão 4.7e). Foram selecionados dezessete marcadores indicadores de ligação com a densidade mineral óssea, nove ao longo do loco 1q21-23 (D1S2635, D1S484, D1S2844, D1S2878, D1S196, D1S452, D1S218, D1S2640, D1S2623) e oito ao longo do loco 11q12-13 (D11S935, D11S4102, D11S905, D11S1313, D11S4191, D11S987, D11S1314, D11S937). Os microssatélites foram amplificados simultaneamente em duas reações de PCR, cada uma para um conjunto de microssatélites referentes a uma região cromossômica. Os alelos foram identificados pela eletroforese em um seqüenciador automático de DNA ABI3130. Em seguida, valores de LOD score para a ligação de cada loco microssatélite com o fenótipo DMO da coluna lombar e do colo do fêmur foram calculados por métodos implementados no pacote MERLIN. Os valores de LOD gerados para todos os marcadores foram menores que 1.0, indicando que as evidências de ligação são baixas ou nulas ou que o número de pares de irmãs foi insuficiente para detectar sinal de ligação. Para a região 1q21-23 o maior valor de LOD foi de 0.04 no marcador D1S196, enquanto que para a região 11q12-13 o maior valor de LOD foi de -0.9 no marcador D11S987. A idade, a estatura e o peso corporal foram utilizados como covariáveis nas análises. Para o conjunto amostral utilizado neste estudo não há evidências de que as regiões 1q21-23 e 11q12-13 estejam ligadas ao fenótipo DMO em adolescente brasileiras.
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