Identificação molecular de fungo dimórfico e seus contaminantes

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sena, Ana Luiza dos Santos
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12162
Resumo: Aureobasidium pullulans é um fungo que pode ser encontrado em diversos ambientes, geralmente nos mais úmidos, podendo ser isolado, inclusive, como endófitos de diversas espécies de plantas. Esta espécie apresenta variantes, que compreendem: A. pullulans var. pullulans, A. pullulans var. aubasidani, A. pullulans var. namibiae, A. pullulans var. subglaciale, e A. pullulans var. melanogenum, todas produtoras de biopolímero. O presente trabalho é a etapa inicial de um projeto mais amplo, que tem o intuito de realizar a produção de pululana, um importante biopolímero que apresenta diversas aplicações industriais (biotecnológica, alimentícia, farmacêutica, petrolífera, de plásticos, cosméticos entre outros). Levando em consideração que o principal micro-organismo produtor, Aureobasidium pullulans, apresenta variações com baixa (ou até mesmo ausência) capacidade de produzir pululana, este projeto visa avaliar taxonomicamente uma linhagem de A. pullulans IOC 3011 obtida da Coleção de Fungos Filamentosos da Fiocruz/RJ. Com a caracterização desta, será possível avaliar a continuidade do projeto, que propõe a produção deste biopolímero utilizando matérias primas de baixo custo. Neste trabalho, portanto, foram utilizadas técnicas moleculares de extração de DNA fúngico e de sequenciamento utilizando marcadores moleculares da região espaçadora interna transcrita (ITS), e a segunda a região 5’ do gene do RNAr 28S, conhecida como região (D1/D2) do gene do RNAr 28S. No decorrer da identificação foi detectada na amostra de A. pullulans a presença de agentes contaminantes (fungos e bactérias), sendo, portanto, demandadas etapas adicionais para descontaminação e obtenção de cultura pura, como técnicas de cultura monospórica e utilização de antibióticos. Não houve o isolamento de colônias características de A. pullulans em consequência de contaminação por Penicillium e por bactérias que, até o presente momento, não foram identificadas.
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spelling Oliveira, Juliana Davies deSena, Ana Luiza dos Santos2019-07-12T18:43:23Z2019-07-102019-07-12T18:43:23Z2016SENA, Ana Luiza dos Santos. Identificação molecular de fungo dimórfico e seus contaminantes. 2016. 45 f. Artigo (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, 2016.https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12162Aureobasidium pullulans é um fungo que pode ser encontrado em diversos ambientes, geralmente nos mais úmidos, podendo ser isolado, inclusive, como endófitos de diversas espécies de plantas. Esta espécie apresenta variantes, que compreendem: A. pullulans var. pullulans, A. pullulans var. aubasidani, A. pullulans var. namibiae, A. pullulans var. subglaciale, e A. pullulans var. melanogenum, todas produtoras de biopolímero. O presente trabalho é a etapa inicial de um projeto mais amplo, que tem o intuito de realizar a produção de pululana, um importante biopolímero que apresenta diversas aplicações industriais (biotecnológica, alimentícia, farmacêutica, petrolífera, de plásticos, cosméticos entre outros). Levando em consideração que o principal micro-organismo produtor, Aureobasidium pullulans, apresenta variações com baixa (ou até mesmo ausência) capacidade de produzir pululana, este projeto visa avaliar taxonomicamente uma linhagem de A. pullulans IOC 3011 obtida da Coleção de Fungos Filamentosos da Fiocruz/RJ. Com a caracterização desta, será possível avaliar a continuidade do projeto, que propõe a produção deste biopolímero utilizando matérias primas de baixo custo. Neste trabalho, portanto, foram utilizadas técnicas moleculares de extração de DNA fúngico e de sequenciamento utilizando marcadores moleculares da região espaçadora interna transcrita (ITS), e a segunda a região 5’ do gene do RNAr 28S, conhecida como região (D1/D2) do gene do RNAr 28S. No decorrer da identificação foi detectada na amostra de A. pullulans a presença de agentes contaminantes (fungos e bactérias), sendo, portanto, demandadas etapas adicionais para descontaminação e obtenção de cultura pura, como técnicas de cultura monospórica e utilização de antibióticos. Não houve o isolamento de colônias características de A. pullulans em consequência de contaminação por Penicillium e por bactérias que, até o presente momento, não foram identificadas.Aureobasidium pullulans is a fungus that can be found in several environments, usually in the most humid, and can be isolated, even in endophytes of various species of plants. This species presents variants, which include: A. pullulans var. pullulans, A. pullulans var. aubasidani, A. pullulans var. namibiae, A. pullulans var. subglaciale, and A. pullulans var. melanogenum, all producing biopolymer. The present work is the initial stage of a bigger project with the aim of producing pullulan, an important biopolymer that presents several industrial applications (biotechnology, food, pharmaceutical, oil, plastics, cosmetics among others). Taking into account that the main producing microorganism, Aureobasidium pullulans, presents variations with low (or even absence) ability to produce pullulan, this project aims to taxonomically evaluate a strain of A. pullulans IOC 3011 obtained from the Filamentous Fungi Collection of Fiocruz/RJ. With its characterization, it will be possible to evaluate the continuity of the project with this strain, which proposes the production of this biopolymer using raw materials of low cost. In this work, therefore, molecular techniques of fungal DNA extraction and sequencing using molecular markers of the internal transcriptional spacer region (ITS) were used, and the second the 5 'region of the 28S rRNA gene, known as region (D1 / D2) Of the 28S RNA gene. During the identification, the presence of contaminating agents (fungi and bacteria) was detected in the sample of A. pullulans, and additional steps were required for decontamination and pure culture obtainment, such as monosporic culture techniques and antibiotics usage. It was not possible to isolate characteristic colonies of A. pullulans as consequence of Penicillium contamination and bacteria that have not been identified to date.Submitted by Franciene Aguiar (franciene.aguiar@ucb.br) on 2019-07-10T18:35:51Z No. of bitstreams: 1 AnaLuizaDosSantosSenaTCCGraduacao2016.pdf: 7143708 bytes, checksum: e331704f07740938c195549c57da9b52 (MD5)Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2019-07-12T18:43:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AnaLuizaDosSantosSenaTCCGraduacao2016.pdf: 7143708 bytes, checksum: e331704f07740938c195549c57da9b52 (MD5)Made available in DSpace on 2019-07-12T18:43:23Z (GMT). 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Aureobasidium pullulans is a fungus that can be found in several environments, usually in the most humid, and can be isolated, even in endophytes of various species of plants. This species presents variants, which include: A. pullulans var. pullulans, A. pullulans var. aubasidani, A. pullulans var. namibiae, A. pullulans var. subglaciale, and A. pullulans var. melanogenum, all producing biopolymer. The present work is the initial stage of a bigger project with the aim of producing pullulan, an important biopolymer that presents several industrial applications (biotechnology, food, pharmaceutical, oil, plastics, cosmetics among others). Taking into account that the main producing microorganism, Aureobasidium pullulans, presents variations with low (or even absence) ability to produce pullulan, this project aims to taxonomically evaluate a strain of A. pullulans IOC 3011 obtained from the Filamentous Fungi Collection of Fiocruz/RJ. With its characterization, it will be possible to evaluate the continuity of the project with this strain, which proposes the production of this biopolymer using raw materials of low cost. In this work, therefore, molecular techniques of fungal DNA extraction and sequencing using molecular markers of the internal transcriptional spacer region (ITS) were used, and the second the 5 'region of the 28S rRNA gene, known as region (D1 / D2) Of the 28S RNA gene. During the identification, the presence of contaminating agents (fungi and bacteria) was detected in the sample of A. pullulans, and additional steps were required for decontamination and pure culture obtainment, such as monosporic culture techniques and antibiotics usage. It was not possible to isolate characteristic colonies of A. pullulans as consequence of Penicillium contamination and bacteria that have not been identified to date.
description Aureobasidium pullulans é um fungo que pode ser encontrado em diversos ambientes, geralmente nos mais úmidos, podendo ser isolado, inclusive, como endófitos de diversas espécies de plantas. Esta espécie apresenta variantes, que compreendem: A. pullulans var. pullulans, A. pullulans var. aubasidani, A. pullulans var. namibiae, A. pullulans var. subglaciale, e A. pullulans var. melanogenum, todas produtoras de biopolímero. O presente trabalho é a etapa inicial de um projeto mais amplo, que tem o intuito de realizar a produção de pululana, um importante biopolímero que apresenta diversas aplicações industriais (biotecnológica, alimentícia, farmacêutica, petrolífera, de plásticos, cosméticos entre outros). Levando em consideração que o principal micro-organismo produtor, Aureobasidium pullulans, apresenta variações com baixa (ou até mesmo ausência) capacidade de produzir pululana, este projeto visa avaliar taxonomicamente uma linhagem de A. pullulans IOC 3011 obtida da Coleção de Fungos Filamentosos da Fiocruz/RJ. Com a caracterização desta, será possível avaliar a continuidade do projeto, que propõe a produção deste biopolímero utilizando matérias primas de baixo custo. Neste trabalho, portanto, foram utilizadas técnicas moleculares de extração de DNA fúngico e de sequenciamento utilizando marcadores moleculares da região espaçadora interna transcrita (ITS), e a segunda a região 5’ do gene do RNAr 28S, conhecida como região (D1/D2) do gene do RNAr 28S. No decorrer da identificação foi detectada na amostra de A. pullulans a presença de agentes contaminantes (fungos e bactérias), sendo, portanto, demandadas etapas adicionais para descontaminação e obtenção de cultura pura, como técnicas de cultura monospórica e utilização de antibióticos. Não houve o isolamento de colônias características de A. pullulans em consequência de contaminação por Penicillium e por bactérias que, até o presente momento, não foram identificadas.
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