Analise filogenética e de expressão de genes envolvidos na produção de carotenoides em acidobacteria

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Moraes, Eduardo Antero de
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12096
Resumo: Acidobacteria é um dos filos bacterianos mais abundantes no solo foi isolada há um bom tempo de uma amostra de drenagem ácida de mina. São encontradas diferentes locais como tundra, solos geotermais, solo oligotrófico de savanas, solos ricos de florestas e solos agrícolas. Conhecer o genoma, transcriptoma, proteoma e metaboloma dos organismos para obter os conhecimentos fisiológicos, ecológicos e também para utilização na biotecnologia é de extrema importância. Sabe-se que a luz branca é um dos estimuladores na produção de carotenoides em microrganismos fotossintéticos e não-fotossintéticos. Para obter o transcriptoma Occallatibacter savannae AB23 foi cultivado com exposição à luz e com ou ausência de luz, extraiu o RNA, realizou o sequenciamento de RNA- e também houve a construção de árvores filogenéticas dos genes ligados a biossíntese de carotenoides. A análise da expressão gênica de apenas 3 genes não possibilitou observar grandes diferenças entre o tratamento ausência e presença de luz. Em relação as árvores filogenéticas obtidas, as sequências de O.savannae AB23 revelou proximidade principalmente a sequências de seu próprio filo Acidobacteria, porém também apresentou proximidade aos filos Planctomycetes, Chloroflexi e ao domínio Archaea.
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Para obter o transcriptoma Occallatibacter savannae AB23 foi cultivado com exposição à luz e com ou ausência de luz, extraiu o RNA, realizou o sequenciamento de RNA- e também houve a construção de árvores filogenéticas dos genes ligados a biossíntese de carotenoides. A análise da expressão gênica de apenas 3 genes não possibilitou observar grandes diferenças entre o tratamento ausência e presença de luz. Em relação as árvores filogenéticas obtidas, as sequências de O.savannae AB23 revelou proximidade principalmente a sequências de seu próprio filo Acidobacteria, porém também apresentou proximidade aos filos Planctomycetes, Chloroflexi e ao domínio Archaea.porUniversidade Católica de BrasíliaCiências Biológicas (Graduação)UCBBrasilEscola de Exatas, Arquitetura e Meio AmbienteCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASCiências biológicasFilogenia de genesCarotenoidesRNA-seqAnalise filogenética e de expressão de genes envolvidos na produção de carotenoides em acidobacteriainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UCBinstname:Universidade Católica de Brasília (UCB)instacron:UCBTEXTEduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdf.txtEduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdf.txtExtracted texttext/plain43911https://200.214.135.178:9443/jspui/bitstream/123456789/12096/3/EduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdf.txt4532d8308379a56fcdada5a3ef53a4c8MD53ORIGINALEduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdfEduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdfArtigoapplication/pdf1050797https://200.214.135.178:9443/jspui/bitstream/123456789/12096/1/EduardoAnteroDeMoraesTCCGraduacao2018.pdfd16bf246951c67ead377f440e251f759MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866https://200.214.135.178:9443/jspui/bitstream/123456789/12096/2/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD52123456789/120962020-06-09 03:42:05.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ório de Publicaçõeshttps://repositorio.ucb.br:9443/jspui/
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description Acidobacteria é um dos filos bacterianos mais abundantes no solo foi isolada há um bom tempo de uma amostra de drenagem ácida de mina. São encontradas diferentes locais como tundra, solos geotermais, solo oligotrófico de savanas, solos ricos de florestas e solos agrícolas. Conhecer o genoma, transcriptoma, proteoma e metaboloma dos organismos para obter os conhecimentos fisiológicos, ecológicos e também para utilização na biotecnologia é de extrema importância. Sabe-se que a luz branca é um dos estimuladores na produção de carotenoides em microrganismos fotossintéticos e não-fotossintéticos. Para obter o transcriptoma Occallatibacter savannae AB23 foi cultivado com exposição à luz e com ou ausência de luz, extraiu o RNA, realizou o sequenciamento de RNA- e também houve a construção de árvores filogenéticas dos genes ligados a biossíntese de carotenoides. A análise da expressão gênica de apenas 3 genes não possibilitou observar grandes diferenças entre o tratamento ausência e presença de luz. Em relação as árvores filogenéticas obtidas, as sequências de O.savannae AB23 revelou proximidade principalmente a sequências de seu próprio filo Acidobacteria, porém também apresentou proximidade aos filos Planctomycetes, Chloroflexi e ao domínio Archaea.
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