Computação em Grid usando o MyGrid como plataforma de execução para o BLAST

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ferrari, Fabiano Mussi
Data de Publicação: 2004
Outros Autores: Almeida, Leila Raquel S.
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/10164
Resumo: A melhoria do desempenho das redes de computadores e a capacidade de processamentos dos dispositivos computacionais trouxeram a idéia de agregá-los como recursos para o provimento de “poder computacional” e conseqüentemente permitir a execução de aplicações que consomem recursos de forma intensa. Tal recurso utilizado em grande escala gera uma infra-estrutura de hardware e software que permite o acesso a grande capacidade computacional geograficamente distribuída. Conceituando assim o que se chama de Grid Computacional. O objetivo desse trabalho é analisar um ambiente de processamento distribuído em um conjunto de máquinas em rede, utilizando o BLAST como aplicação e o MyGrid como plataforma de execução paralela. Para tanto, se dividiu a pesquisa em três etapas: a primeira consistiu em cumprir o já referido objetivo em um único microcomputador para retirar os dados que pudessem ser comparados com as demais etapas. A segunda etapa consistiu em ampliar o número de máquinas configuradas em uma rede local e a terceira e última etapa da pesquisa foi agregar máquinas dispersas geograficamente à segunda fase da pesquisa, para tanto, foram utilizados dois microcomputadores da Universidade Federal de Campina Grande (UFCG). Como principal resultado obteve-se a melhoria de desempenho da aplicação, levando em consideração o tempo gasto para obtenção dos resultados da análise de seqüências de DNA. Como principal conclusão, além da redução do tempo de execução do BLAST, a pesquisa possibilitou a instalação, manuseio e execução da plataforma MyGrid.
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spelling Coelho, FláviaFerrari, Fabiano MussiAlmeida, Leila Raquel S.2017-11-07T10:59:39Z2017-10-262017-11-07T10:59:39Z2004FERRARI, Fabiano Mussi; ALMEIDA, Leila Raquel S. Computação em Grid usando o MyGrid como plataforma de execução para o BLAST. 2004. 87 f. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, 2004.https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/10164A melhoria do desempenho das redes de computadores e a capacidade de processamentos dos dispositivos computacionais trouxeram a idéia de agregá-los como recursos para o provimento de “poder computacional” e conseqüentemente permitir a execução de aplicações que consomem recursos de forma intensa. Tal recurso utilizado em grande escala gera uma infra-estrutura de hardware e software que permite o acesso a grande capacidade computacional geograficamente distribuída. Conceituando assim o que se chama de Grid Computacional. O objetivo desse trabalho é analisar um ambiente de processamento distribuído em um conjunto de máquinas em rede, utilizando o BLAST como aplicação e o MyGrid como plataforma de execução paralela. Para tanto, se dividiu a pesquisa em três etapas: a primeira consistiu em cumprir o já referido objetivo em um único microcomputador para retirar os dados que pudessem ser comparados com as demais etapas. A segunda etapa consistiu em ampliar o número de máquinas configuradas em uma rede local e a terceira e última etapa da pesquisa foi agregar máquinas dispersas geograficamente à segunda fase da pesquisa, para tanto, foram utilizados dois microcomputadores da Universidade Federal de Campina Grande (UFCG). Como principal resultado obteve-se a melhoria de desempenho da aplicação, levando em consideração o tempo gasto para obtenção dos resultados da análise de seqüências de DNA. Como principal conclusão, além da redução do tempo de execução do BLAST, a pesquisa possibilitou a instalação, manuseio e execução da plataforma MyGrid.The improvement of the performance of the computer networks and the capacity of processing of the computational devices had brought the idea of add them as resources for the provisions of "being able computational" and consequently to allow the execution of applications that consume resources of intense form. Such used resource large-scale generates a infrastructure of the hardware and software that allows to the access the great computational capacity geographically distributed. Thus appraising what flame of Computational Grid. The objective of this work is to analyze an environment of processing distributed in a set of schemes in net, using the BLAST as application and the MyGrid as platform of parallel execution. For in such a way the research in three stages was divided: the first one consisted of executing the objective in an only microcomputer to remove given that they could be compared with the too much stages. The second stage consisted of extending the number of machines configured in a local net and the third and last stage of the research was to add dispersed machines geographically the second phase of the research, for had been in such a way used two microcomputers of the Federal University of Campina Grande (UFCG). As main result got it improvement of performance of the application, leading in consideration the time expense for attainment of the results of the analysis of DNA sequences. As main conclusion, beyond the reduction of the time of execution of the BLAST, the research it made possible the installation, manuscript and execution of the MyGrid platform.Submitted by Franciene Aguiar (franciene.aguiar@ucb.br) on 2017-10-26T17:02:50Z No. of bitstreams: 1 FabianoMussiFerrariTCCGRADUACAO2004.pdf: 818152 bytes, checksum: 341d580b940464d29c84f981ca15f4de (MD5)Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-11-07T10:59:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FabianoMussiFerrariTCCGRADUACAO2004.pdf: 818152 bytes, checksum: 341d580b940464d29c84f981ca15f4de (MD5)Made available in DSpace on 2017-11-07T10:59:39Z (GMT). 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