Divergência genética entre cultivares de morangueiro por meio de marcadores moleculares e caracteres morfoagronômicos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Morales, Rafael Gustavo Ferreira
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO
Texto Completo: http://localhost:8080/tede/handle/tede/199
Resumo: The aim of this study was to evaluate the genetic divergence of 11 strawberry cultivars (Aromas, Camarosa, Camino Real, Campinas, Diamante, Dover, Oso Grande, Sweet Charlie, Toyonoka, Tudla e Ventana) using morphological characters and RAPD and ISSR markers, indicating the most promising crosses. For molecular analysis, ADN extraction in both methods followed the modified CTAB protocol, and made the amplification by PCR and then separated by gel agorose (RAPD) and polyacrylamide (ISSR). From the reading of the gels, each marker, generated is a binary matrix, calculating from it the genetic similarity by the coefficient of Jaccard. The cultivars were grouped based on genetic similarity matrix using UPGMA. For the evaluation of morphological characteristics were selected 29 traits related to plant, leaf, flower, fruit and achenes of strawberries, using a range of marks for evaluation. Among the molecular markers, the ISSR was more efficient than the markers RAPD in the study of genetic diversity in strawberry, showing greater consistency with the origin and genealogy of the cultivars. Regarding grouping, ISSR method was more consistent with the origin and genealogy of the cultivars than the RAPD. The morphological characteristics were inefficient to study genetic diversity, not found a direct relationship between the values of similarity or dendrogram, with the origin and genealogy of the cultivars. Among the three techniques evaluated, the ISSR markers are more suitable for study of genetic diversity in strawberry. The most promising crosses, based on data and ISSR molecular markers, are among cultivars Tudla and Ventana, and Oso Grande and Ventana, respectively.
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For molecular analysis, ADN extraction in both methods followed the modified CTAB protocol, and made the amplification by PCR and then separated by gel agorose (RAPD) and polyacrylamide (ISSR). From the reading of the gels, each marker, generated is a binary matrix, calculating from it the genetic similarity by the coefficient of Jaccard. The cultivars were grouped based on genetic similarity matrix using UPGMA. For the evaluation of morphological characteristics were selected 29 traits related to plant, leaf, flower, fruit and achenes of strawberries, using a range of marks for evaluation. Among the molecular markers, the ISSR was more efficient than the markers RAPD in the study of genetic diversity in strawberry, showing greater consistency with the origin and genealogy of the cultivars. Regarding grouping, ISSR method was more consistent with the origin and genealogy of the cultivars than the RAPD. The morphological characteristics were inefficient to study genetic diversity, not found a direct relationship between the values of similarity or dendrogram, with the origin and genealogy of the cultivars. Among the three techniques evaluated, the ISSR markers are more suitable for study of genetic diversity in strawberry. The most promising crosses, based on data and ISSR molecular markers, are among cultivars Tudla and Ventana, and Oso Grande and Ventana, respectively.O objetivo do presente trabalho foi avaliar a divergência genética entre 11 cultivares de morangueiro (Aromas, Camarosa, Camino Real, Campinas, Diamante, Dover, Oso Grande, Sweet Charlie, Toyonoka, Tudla e Ventana) utilizando caracteres morfoagronômicos e os marcadores moleculares RAPD e ISSR, indicando os cruzamentos mais promissores. Para avaliação molecular, a extração de DNA nos dois métodos seguiu o protocolo CTAB modificado, sendo as amplificações feitas por PCR e em seguida separados em gel de agarose (RAPD) e poliacrilamida (ISSR). A partir da leitura dos géis, para cada marcador, gerou-se uma matriz binária, calculando-se a partir dela a similaridade genética pelo coeficiente de Jaccard. As cultivares foram agrupadas com base na matriz de similaridade genética usando UPGMA. Foram avaliados 29 caracteres morfoagronômicos relacionados à planta, folha, flor, fruto e aquênios do morangueiro, utilizando-se de uma escala de nota para a avaliação. Entre os marcadores moleculares, o ISSR foi mais eficiente que o RAPD no estudo de divergência genética do morangueiro, apresentando maior coerência com a origem e a genealogia das cultivares. Os caracteres morfoagronômicos foram menos eficientes para estudo de divergência genética, não sendo encontrada relação direta entre os valores de similaridade ou o dendograma, com a origem e a genealogia das cultivares. Entre as três técnicas avaliadas, os marcadores ISSR são os mais indicados para estudo de divergência genética em morangueiro. Os cruzamentos mais promissores, com base na divergência genética estimada a partir de dados moleculares RAPD e ISSR, são entre as cultivares Tudla e Ventana e entre Oso Grande e Ventana, respectivamente.Made available in DSpace on 2016-09-20T12:12:46Z (GMT). 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