TAMANHO EFETIVO E FLUXO GÊNICO EM POPULAÇÕES DE Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart. USANDO TEORIA DA COALESCÊNCIA
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Resumo: | Acrocomia aculeata is a tropical palm tree native to Central and South America, which has significant economic, social, and environmental potential. It has several applications and is used mainly as a source of raw material for biofuels, as well as in the culinary, pharmaceutical, and cosmetics industries. However, land encroachment due to the expansion of agribusiness, together with urban growth and other factors have resulted in the fragmentation and destruction of its habitat, leading to the loss of genes and genotypes in local A. aculeata populations. These deleterious genetic processes restrict genetic variability, affecting productivity, and the capacity of A. aculeata populations to respond to climate change and other biotic and abiotic stresses. As such, these processes can compromise the continuation of not only the species, but also its dependent flora and fauna. In this context, the objective of this study was to estimate the gene flow and effective population size using an approach based on coalescence theory. Four subpopulations located in the municipalities of Teodoro Sampaio (TSI and TSII), Rosana (RA), and Amparo (AP), São Paulo State, Brazil, were evaluated with nine microsatellite loci. In order to evaluate the effective size and gene flow, the Bayesian inference method was used, based on the coalescence theory implemented in the MIGRATE-N software. The effective population size (Ne) was obtained considering a mutation rate of 5x10-5. Gene flow (Nm) for pairs of populations ranged from 0.28 to 1.17, with higher levels of migration between the three geographically proximal locations (TSI, TSII, and RA). The estimates of effective population size (Ne) were 444, 835, 838, and 874 for AP, TSII, RA, and TSI, respectively. The results obtained add to our understanding of A. aculeata population genetics and show that some traditional methods may be unsatisfactory in making inferences about gene flow and historical evolutionary processes. |
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However, land encroachment due to the expansion of agribusiness, together with urban growth and other factors have resulted in the fragmentation and destruction of its habitat, leading to the loss of genes and genotypes in local A. aculeata populations. These deleterious genetic processes restrict genetic variability, affecting productivity, and the capacity of A. aculeata populations to respond to climate change and other biotic and abiotic stresses. As such, these processes can compromise the continuation of not only the species, but also its dependent flora and fauna. In this context, the objective of this study was to estimate the gene flow and effective population size using an approach based on coalescence theory. Four subpopulations located in the municipalities of Teodoro Sampaio (TSI and TSII), Rosana (RA), and Amparo (AP), São Paulo State, Brazil, were evaluated with nine microsatellite loci. In order to evaluate the effective size and gene flow, the Bayesian inference method was used, based on the coalescence theory implemented in the MIGRATE-N software. The effective population size (Ne) was obtained considering a mutation rate of 5x10-5. Gene flow (Nm) for pairs of populations ranged from 0.28 to 1.17, with higher levels of migration between the three geographically proximal locations (TSI, TSII, and RA). The estimates of effective population size (Ne) were 444, 835, 838, and 874 for AP, TSII, RA, and TSI, respectively. The results obtained add to our understanding of A. aculeata population genetics and show that some traditional methods may be unsatisfactory in making inferences about gene flow and historical evolutionary processes.Acrocomia aculeata é uma palmeira nativa da América Central e do Sul, que possui significativo potencial econômico, social e ambiental. Possui diversas aplicações, sendo usada principalmente como fonte de matéria-prima para biocombustíveis, bem como nas indústrias alimentícias, farmacêuticas e cosmética. Entretanto, os avanços territoriais do agronegócio, juntamente com a expansão urbana e outros fatores que causam a fragmentação e destruição de seu habitat, acabam levando à perda de genes e genótipos em populações locais de A. aculeata. Esses processos restringem a variabilidade genética, afetando a produtividade e a capacidade das populações de A. aculeata em responder às mudanças climáticas e outros estresses bióticos e abióticos. Dessa forma, estes processos podem comprometer a perpetuação não só da espécie, mas também da sua flora e fauna dependentes. Neste contexto, o objetivo deste estudo foi estimar o fluxo gênico e o tamanho efetivo populacional utilizando uma abordagem baseada na teoria da coalescência. Quatro subpopulações localizadas nos municípios de Teodoro Sampaio (TSI e TSII), Rosana (RA) e Amparo (AP), no Estado de São Paulo, foram avaliadas com nove locos microssatélites. Para estimar o tamanho efetivo e o fluxo gênico, utilizou-se o método de inferência bayesiana, baseado na teoria de coalescência implementada no software MIGRATE-N. O tamanho efetivo populacional (Ne) foi obtido assumindo uma taxa de mutação de 5x10-5. O fluxo gênico (Nm) entre os pares de populações variou de 0,28 a 1,17, com níveis mais altos de migração entre os três locais geograficamente próximos (TSI, TSII e RA). As estimativas do tamanho efetivo populacional (Ne) foram 444, 835, 838 e 874 para AP, TSII, RA e TSI, respectivamente. Os resultados obtidos agregam conhecimento acerca da compreensão da genética de populações de A. aculeata e mostram que alguns métodos tradicionais podem ser insatisfatórios para fazer inferências sobre o fluxo gênico e processos evolutivos históricos.Submitted by Fabiano Jucá (fjuca@unicentro.br) on 2021-02-26T12:20:59Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Renan Marcelo Portela.pdf: 1982474 bytes, checksum: f71735ca58213657ce89371ac89df7c6 (MD5)Made available in DSpace on 2021-02-26T12:20:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Renan Marcelo Portela.pdf: 1982474 bytes, checksum: f71735ca58213657ce89371ac89df7c6 (MD5) Previous issue date: 2020-02-26Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESapplication/pdfhttp://tede.unicentro.br:8080/jspui/retrieve/5223/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Renan%20Marcelo%20Portela.pdf.jpghttp://tede.unicentro.br:8080/jspui/retrieve/5225/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Renan%20Marcelo%20Portela.pdf.jpgporUniversidade Estadual do Centro-OestePrograma de Pós-Graduação em Ciências Florestais (Mestrado)UNICENTROBrasilUnicentro::Departamento de Ciências Florestaismacaúbagenética de populaçõesconservaçãomelhoramentomigraçãomacaúbapopulation geneticsconservationgenetic improvementmigrationCIENCIAS AGRARIAS::RECURSOS FLORESTAIS E ENGENHARIA FLORESTALRECURSOS FLORESTAIS E ENGENHARIA FLORESTAL::MANEJO FLORESTALTAMANHO EFETIVO E FLUXO GÊNICO EM POPULAÇÕES DE Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart. USANDO TEORIA DA COALESCÊNCIAinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis6065515305966967648600500600600600-5938256993918186975-604049389552879283-76664982548871839512075167498588264571info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTROinstname:Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO)instacron:UNICENTROTHUMBNAILDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.jpgDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.jpgimage/jpeg1943http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/4/Disserta%C3%A7%C3%A3o+Renan+Marcelo+Portela.pdf.jpgcc73c4c239a4c332d642ba1e7c7a9fb2MD54TEXTDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.txtDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.txttext/plain116651http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/3/Disserta%C3%A7%C3%A3o+Renan+Marcelo+Portela.pdf.txt983764c5cbf9f0cc80f060c692e05d1aMD53THUMBNAILDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.jpgDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.jpgimage/jpeg1943http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/4/Disserta%C3%A7%C3%A3o+Renan+Marcelo+Portela.pdf.jpgcc73c4c239a4c332d642ba1e7c7a9fb2MD54TEXTDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.txtDissertação Renan Marcelo Portela.pdf.txttext/plain116651http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/3/Disserta%C3%A7%C3%A3o+Renan+Marcelo+Portela.pdf.txt983764c5cbf9f0cc80f060c692e05d1aMD53ORIGINALDissertação Renan Marcelo Portela.pdfDissertação Renan Marcelo Portela.pdfapplication/pdf1982474http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/2/Disserta%C3%A7%C3%A3o+Renan+Marcelo+Portela.pdff71735ca58213657ce89371ac89df7c6MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82003http://localhost:8080/tede/bitstream/jspui/1389/1/license.txt6544a715df32d52b08aa3def94c4dddeMD51jspui/13892021-04-07 14:29:14.9oai:localhost: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede.unicentro.br:8080/jspui/PUBhttp://tede.unicentro.br/tde_oai/oai3.phprepositorio@unicentro.br||fabianoqueiroz@yahoo.com.bropendoar:2021-04-07T17:29:14Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO)false |
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