Algoritmo para contagem de células do tipo fibroblastos NIH/3T3 em câmara de Neubauer utilizando processamento digital de imagens
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2017 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel |
Texto Completo: | http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/732 |
Resumo: | Na perspectiva de biologia de sistemas, a célula é o elemento principal da integração de informações. Portanto, compreender a célula no seu contexto é a chave para desvendar muitos dos mecanismos ainda desconhecidos da vida e de certas patologias. Apesar da crescente automatização nos laboratórios de análises clínicas, muitos deles ainda empregam microscópios óticos para algumas análises específicas. Quando se trabalha com microorganismos, na maioria das vezes deseja-se determinar a concentração de células da suspensão preparada. Uma das formas mais comuns de se obter esta estimativa é através da contagem ao microscópio, utilizando-se uma Câmara de Neubauer, também conhecida como Hemacitômetro ou Câmara de Contagem. Cada imagem de microscópio pode conter centenas de células a serem contadas. Realizar a contagem de forma visual acarreta em uma imprecisão muito grande e requer tempo elevado, o que também aumenta o tempo para obter a estimativa final. A situação atual da pesquisa científica no Brasil e em outros países de terceiro mundo reflete a necessidade de um dispositivo de fácil acesso e baixo custo aos pesquisadores. Assim, diante dos motivos supracitados, o desenvolvimento de um mecanismo que corresponda essas expectativas, faz-se indispensável. Frente a essa perspectiva, o objetivo desse estudo consolidou-se no desenvolvimento de um algoritmo para contagem celular através da captura de imagens da câmara de Neubauer. Este algoritmo resulta em uma precisão na contagem superior a 90% quando comparado a contagem manual, como também, reduzir o tempo de aproximadamente dois minutos para menos de um segundo do algoritmo. |
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Algoritmo para contagem de células do tipo fibroblastos NIH/3T3 em câmara de Neubauer utilizando processamento digital de imagenscâmara de Neubauer; microscópio; processamento digital de imagensNeubauer chamber; microscope; digital image processingENGENHARIASNa perspectiva de biologia de sistemas, a célula é o elemento principal da integração de informações. Portanto, compreender a célula no seu contexto é a chave para desvendar muitos dos mecanismos ainda desconhecidos da vida e de certas patologias. Apesar da crescente automatização nos laboratórios de análises clínicas, muitos deles ainda empregam microscópios óticos para algumas análises específicas. Quando se trabalha com microorganismos, na maioria das vezes deseja-se determinar a concentração de células da suspensão preparada. Uma das formas mais comuns de se obter esta estimativa é através da contagem ao microscópio, utilizando-se uma Câmara de Neubauer, também conhecida como Hemacitômetro ou Câmara de Contagem. Cada imagem de microscópio pode conter centenas de células a serem contadas. Realizar a contagem de forma visual acarreta em uma imprecisão muito grande e requer tempo elevado, o que também aumenta o tempo para obter a estimativa final. A situação atual da pesquisa científica no Brasil e em outros países de terceiro mundo reflete a necessidade de um dispositivo de fácil acesso e baixo custo aos pesquisadores. Assim, diante dos motivos supracitados, o desenvolvimento de um mecanismo que corresponda essas expectativas, faz-se indispensável. Frente a essa perspectiva, o objetivo desse estudo consolidou-se no desenvolvimento de um algoritmo para contagem celular através da captura de imagens da câmara de Neubauer. Este algoritmo resulta em uma precisão na contagem superior a 90% quando comparado a contagem manual, como também, reduzir o tempo de aproximadamente dois minutos para menos de um segundo do algoritmo.From the perspective of systems biology, the cell is the main element of information integration. Therefore, understanding the cell in its context is the key to unraveling many of the still unknown mechanisms of life and certain pathologies. Despite increasing automation in clinical analysis laboratories, many of them still employ optical microscopes for some specific analyzes. When working with microorganisms, it is most often desired to determine the cell concentration of the prepared suspension. One of the most common ways of obtaining this estimate is by counting under the microscope, using a Neubauer Chamber, also known as a Hemacytometer or Count Chamber. Each microscope image can contain hundreds of cells to be counted. Performing the counting visually entails a very large inaccuracy and requires high time, which also increases the time to obtain the final estimate. The current state of scientific research in Brazil and other third world countries reflects the need for a device that is easily accessible and inexpensive for researchers. Thus, in view of the aforementioned reasons, the development of a mechanism that matches these expectations becomes indispensable. In view of this perspective, the objective of this study was consolidated in the development of an algorithm for cellular counting through the capture of images from the Neubauer chamber. This algorithm results in counting accuracy greater than 90 % when compared to manual counting, as well as reducing the time from approximately two minutes to less than one second of the algorithm.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Catolica de PelotasCentro de Ciencias Sociais e TecnologicasBrasilUCPelMestrado em Engenharia Eletronica e ComputacaoDiniz, Cláudio Machadohttp://lattes.cnpq.br/3726715175711775Rosa, Vagner Santos dahttp://lattes.cnpq.br/4599170539959463Oses, Jean Pierrehttp://lattes.cnpq.br/5472512244993546Costa, Lucas Soares da2018-08-30T12:05:38Z2017-03-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfCosta, Lucas Soares da. Algoritmo para contagem de células do tipo fibroblastos NIH/3T3 em câmara de Neubauer utilizando processamento digital de imagens. 2017. 56 f. Dissertação( Mestrado em Engenharia Eletrônica e Computação) - Universidade Católica de Pelotas, Pelotas.http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/732porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpelinstname:Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)instacron:UCPEL2020-09-29T21:40:08Zoai:tede.ucpel.edu.br:jspui/732Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www2.ufpel.edu.br/tede/http://tede.ucpel.edu.br:8080/oai/requestbiblioteca@ucpel.edu.br||cristiane.chim@ucpel.tche.bropendoar:2020-09-29T21:40:08Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel - Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)false |
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