Sistema embarcado para contagem de células do Ttpo fibroblastos NIH/3T3 por processamento digital de imagens da câmara de Neubauer
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel |
Texto Completo: | http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/882 |
Resumo: | A contagem de células é um ramo da citometria que possui um vasto uso na medicina e biologia. Equipamentos utilizados em laboratórios de análises clínicas para contagem automática de células, como o citômetro de fluxo, possuem alto custo. Portanto, é raro ter estes equipamentos à disposição em laboratórios de pesquisa, especialmente no Brasil. A contagem das células do tipo fibroblastos NIH/3T3 na maioria dos casos é realizada de forma visual por especialistas com auxílio de microscópios óticos, onde as células são contadas usando como guia a Câmara de Neubauer. Fibroblastos NIH/3T3 são células grandes que se depositam nos quadrantes mais externos da Câmara de Neubauer. Alguns trabalhos anteriores propõem algoritmos e sistemas para contagem de células da Câmara de Neubauer por meio de imagens digitais. Porém, a grande maioria do sistemas propostos na literatura foca na contagem de células pequenas, que se depositam no quadrante central da Câmara de Neubauer. O objetivo deste trabalho é propor um sistema embarcado para a contagem de células do tipo fibroblastos NIH/3T3 por meio de processamento digital de imagens da Câmara de Neubauer. Foi proposto um sistema embarcado que utiliza a plataforma Raspberry Pi 3, uma câmera digital e um display compatíveis com esta plataforma. O software embarcado na plataforma Raspberry foi desenvolvido na linguagem Python com uso da biblioteca de processamento de imagens OpenCV. O sistema foi proposto testado com imagens reais tiradas de experimentos de contagem de células e apresentou uma média erro de 3,33% em comparação com uma avaliação visual realizada por um especialista. |
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Sistema embarcado para contagem de células do Ttpo fibroblastos NIH/3T3 por processamento digital de imagens da câmara de NeubauerPalavras-chavcontagem de células; processamento digital de imagens; sistemas embarcados; câmara de Neubauercell counting; digital Image processing; embedded systems; Neubauer chamberCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAOA contagem de células é um ramo da citometria que possui um vasto uso na medicina e biologia. Equipamentos utilizados em laboratórios de análises clínicas para contagem automática de células, como o citômetro de fluxo, possuem alto custo. Portanto, é raro ter estes equipamentos à disposição em laboratórios de pesquisa, especialmente no Brasil. A contagem das células do tipo fibroblastos NIH/3T3 na maioria dos casos é realizada de forma visual por especialistas com auxílio de microscópios óticos, onde as células são contadas usando como guia a Câmara de Neubauer. Fibroblastos NIH/3T3 são células grandes que se depositam nos quadrantes mais externos da Câmara de Neubauer. Alguns trabalhos anteriores propõem algoritmos e sistemas para contagem de células da Câmara de Neubauer por meio de imagens digitais. Porém, a grande maioria do sistemas propostos na literatura foca na contagem de células pequenas, que se depositam no quadrante central da Câmara de Neubauer. O objetivo deste trabalho é propor um sistema embarcado para a contagem de células do tipo fibroblastos NIH/3T3 por meio de processamento digital de imagens da Câmara de Neubauer. Foi proposto um sistema embarcado que utiliza a plataforma Raspberry Pi 3, uma câmera digital e um display compatíveis com esta plataforma. O software embarcado na plataforma Raspberry foi desenvolvido na linguagem Python com uso da biblioteca de processamento de imagens OpenCV. O sistema foi proposto testado com imagens reais tiradas de experimentos de contagem de células e apresentou uma média erro de 3,33% em comparação com uma avaliação visual realizada por um especialista.Cell counting is a branch of cytometry that has wide use in medicine and biology. Equipment used in clinical analysis laboratories for automatic counting of cells, like the flow cytometer, have a high cost. Therefore, it is rare to have this equipment available in research laboratories, especially in Brazil. The cell count of the type NIH / 3T3 fibroblasts in most cases performed visually by specialists with the aid of optical microscopes, where cells are counted using the Camera as a guide of Neubauer. NIH / 3T3 fibroblasts are large cells that are deposited in the lower quadrants outside the Neubauer Chamber. Some previous work proposes algorithms and systems for counting cells in the Neubauer Chamber using digital images. However, the vast majority of the systems proposed in the literature focus on cell counting, which are deposited in the central quadrant of the Chamber of Neubauer. The objective of this work is to propose an embedded system for counting NIH / 3T3 fibroblast cells using digital image processing from the Neubauer Chamber. An embedded system has been proposed that uses a Raspberry Pi 3 platform, a digital camera and a display compatible with this platform. The software embedded on the Raspberry platform was developed in the language Python using the OpenCV image processing library. The system was proposed tested with real custom images of cell counting experiments and presentations an average error of 3.33% compared to a visual count performed by a specialist.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Catolica de PelotasCentro de Ciencias Sociais e TecnologicasBrasilUCPelMestrado em Engenharia Eletronica e ComputacaoDINIZ, Cláudio MachadoYAMIN, Adenauer CorrêaMONTEIRO, Eduarda RodriguesMUNIZ, Augusto da Rosa2021-09-01T17:40:38Z2020-12-08info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfMUNIZ, Augusto da Rosa. Sistema embarcado para contagem de células do Ttpo fibroblastos NIH/3T3 por processamento digital de imagens da câmara de Neubauer. 2020.55 f. Dissertação( Mestrado em Engenharia Eletronica e Computacao) - Universidade Catolica de Pelotas, Pelotas.http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/882porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpelinstname:Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)instacron:UCPEL2021-09-03T04:00:09Zoai:tede.ucpel.edu.br:jspui/882Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www2.ufpel.edu.br/tede/http://tede.ucpel.edu.br:8080/oai/requestbiblioteca@ucpel.edu.br||cristiane.chim@ucpel.tche.bropendoar:2021-09-03T04:00:09Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel - Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)false |
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