Implementação de novas funcionalidades para o portal IntergenicDB e povoamento do seu banco de dados
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2014 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UCS |
Texto Completo: | https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1271 |
Resumo: | Os recursos hoje disponíveis na área da informática e a necessidade de se trabalhar com os dados gerados por pesquisas na área de biologia molecular, como o projeto genoma humano, tornaram possível o surgimento de uma nova ciência chamada Bioinformática. Muitas ferramentas já foram criadas nessa área, portais que acessam informações geradas pelas pesquisas realizadas na área da biologia molecular são exemplos dessas ferramentas. O grupo de Bioinformática da Universidade de Caxias do Sul sentiu a necessidade de criar um banco de dados, denominado PromotoresDB, para armazenar sequências de nucleotídeos de regiões promotoras de organismos procariontes, já que os portais atualmente disponíveis não atendiam a esta demanda. Posteriormente, foi criado o Portal IntegenicDB para realizar consultas usando o banco de dados PromotoresDB. Contudo, é necessário que o portal seja verificado e validado quanto as suas funcionalidades, além de necessitar de uma ferramenta que seja capaz de buscar dados de outros bancos de dados para carregá-los constantemente. A partir desses requisitos, foi feita a modelagem e a geração dos artefatos necessários para o desenvolvimento do projeto. Depois de concluído o desenvolvimento da nova ferramenta e implementado os novos requisitos do portal, foram realizados testes utilizando as consultas do IntergenicDB para validar os dados importados. Com a conclusão do projeto, o portal IntergenicDB possuirá um ambiente mais ágil para navegação e população do banco de dados (sic). |
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Dalzochio, JovaniSilva, Scheila de Avila eRibeiro, Helena GraziottinNotari, Daniel Luís2016-08-17T17:53:42Z2016-08-17T17:53:42Z2014https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1271Os recursos hoje disponíveis na área da informática e a necessidade de se trabalhar com os dados gerados por pesquisas na área de biologia molecular, como o projeto genoma humano, tornaram possível o surgimento de uma nova ciência chamada Bioinformática. Muitas ferramentas já foram criadas nessa área, portais que acessam informações geradas pelas pesquisas realizadas na área da biologia molecular são exemplos dessas ferramentas. O grupo de Bioinformática da Universidade de Caxias do Sul sentiu a necessidade de criar um banco de dados, denominado PromotoresDB, para armazenar sequências de nucleotídeos de regiões promotoras de organismos procariontes, já que os portais atualmente disponíveis não atendiam a esta demanda. Posteriormente, foi criado o Portal IntegenicDB para realizar consultas usando o banco de dados PromotoresDB. Contudo, é necessário que o portal seja verificado e validado quanto as suas funcionalidades, além de necessitar de uma ferramenta que seja capaz de buscar dados de outros bancos de dados para carregá-los constantemente. A partir desses requisitos, foi feita a modelagem e a geração dos artefatos necessários para o desenvolvimento do projeto. Depois de concluído o desenvolvimento da nova ferramenta e implementado os novos requisitos do portal, foram realizados testes utilizando as consultas do IntergenicDB para validar os dados importados. Com a conclusão do projeto, o portal IntergenicDB possuirá um ambiente mais ágil para navegação e população do banco de dados (sic).Banco de dadosBioinformáticaBiologia molecularImplementação de novas funcionalidades para o portal IntergenicDB e povoamento do seu banco de dadosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UCSinstname:Universidade de Caxias do Sul (UCS)instacron:UCSinfo:eu-repo/semantics/openAccessUniversidade de Caxias do SulBacharelado em Sistemas de InformaçãoTEXTTCC Jovani Dalzochio.pdf.txtTCC Jovani Dalzochio.pdf.txtExtracted texttext/plain92758https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1271/3/TCC%20Jovani%20Dalzochio.pdf.txt810d83c1df9623f300599c59a9e9d769MD53THUMBNAILTCC Jovani Dalzochio.pdf.jpgTCC Jovani Dalzochio.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1199https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1271/4/TCC%20Jovani%20Dalzochio.pdf.jpgd607d23c14cda4765e376c326c2b3283MD54ORIGINALTCC Jovani Dalzochio.pdfTCC Jovani Dalzochio.pdfapplication/pdf3337702https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1271/1/TCC%20Jovani%20Dalzochio.pdfcd5c68d1ca087ece6e3015bc27940bccMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ucs.br/xmlui/bitstream/11338/1271/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5211338/12712018-09-28 16:38:29.671oai:repositorio.ucs.br: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Repositório de Publicaçõeshttp://repositorio.ucs.br/oai/requestopendoar:2024-05-06T10:03:13.418643Repositório Institucional da UCS - Universidade de Caxias do Sul (UCS)false |
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