Estudo teórico das hidratações dos íons Perclorato, Borohidreto e seus sais de sódio por meio da dinâmica molecular de Car-Parrinello

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Martins, Gabriel Rodrigues
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEG
Texto Completo: http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/232
Resumo: O método da Dinâmica Molecular de Car-Parrinello com pseudopotenciais de norma não-conservada de Vanderbilt foi usado para estudar os efeitos da hidratação sobre a estabilidade conformacional dos íons perclorato e borohidreto, e dos sais que esses íons formam com o sódio. Os cálculos foram realizados no ensemble canônico, com a temperatura controlada em 298 K por meio da inserção do termostato de Nosé-Hoover. Foram feitas simulações para a dinâmica molecular do NaClO4 e do NaBH4 no vácuo com o objetivo de investigar a coordenação do cátion Na+ com cada ânion que compõem estes sais. Foram construídas 6 caixas cúbicas para as simulações dos sais NaClO4 e NaBH4 no vácuo, para o perclorato e o borohidreto (cada ânion rodeado por 61 moléculas de água) e para os sais NaClO4 e NaBH4 rodeados por 85 moléculas de água cada. Os algoritmos steepest descent e damped descent foram usados na minimização das energias de Kohn-Sham e o algoritmo de Verlet foi usado na integração das equações de movimento. A energia de corte foi fixada em 25 Ry, a massa fictícia em 400 u. a. e as energias dos sistemas iônico e eletrônico foram controladas ao longo das simulações. As análises das propriedades dos solutos em meio aquoso foram feitas usando a função de distribuição radial, do número de coordenação, da variação temporal dos ângulos diedrais e distâncias de ligação, do coeficiente de difusão e do tempo médio de residência. Os resultados dos cálculos mostraram que o solvente modifica os parâmetros geométricos e eletrônicos dos solutos. Estes parâmetros são importantes na investigação das reações químicas entre os íons estudados e reagentes orgânicos e/ou inorgânicos. A metodologia discutida na presente dissertação pode ser aplicada em processos industriais e biotecnológicos.
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Foram construídas 6 caixas cúbicas para as simulações dos sais NaClO4 e NaBH4 no vácuo, para o perclorato e o borohidreto (cada ânion rodeado por 61 moléculas de água) e para os sais NaClO4 e NaBH4 rodeados por 85 moléculas de água cada. Os algoritmos steepest descent e damped descent foram usados na minimização das energias de Kohn-Sham e o algoritmo de Verlet foi usado na integração das equações de movimento. A energia de corte foi fixada em 25 Ry, a massa fictícia em 400 u. a. e as energias dos sistemas iônico e eletrônico foram controladas ao longo das simulações. As análises das propriedades dos solutos em meio aquoso foram feitas usando a função de distribuição radial, do número de coordenação, da variação temporal dos ângulos diedrais e distâncias de ligação, do coeficiente de difusão e do tempo médio de residência. Os resultados dos cálculos mostraram que o solvente modifica os parâmetros geométricos e eletrônicos dos solutos. Estes parâmetros são importantes na investigação das reações químicas entre os íons estudados e reagentes orgânicos e/ou inorgânicos. A metodologia discutida na presente dissertação pode ser aplicada em processos industriais e biotecnológicos.The Car-Parrinello Molecular Dynamics with ultrasoft pseudopotentials of Vanderbilt was used to study the solvation effects on the conformational stability in aqueous solution of the perchlorate and tetrahydroborate ions and their salts with sodium, respectively. The calculations were carried on the canonic ensemble, with temperature kept at 298 K using the Nosé-Hoover thermostat. The molecular dynamics were carried out in vacuum for NaClO4 and NaBH4 in order to establish the coordination of Na+ cation with the anions to form the respective salts. Six cubic boxes were built to simulate the NaClO4 and NaBH4 salts in vacuum, perchlorate and tetrahydroborate ions surrounded by 61 water molecules each one, and for NaClO4 and NaBH4 surround by 85 water molecules each one. The steepest descendent and damped algorithms were used to minimize the Kohn-Sham energy, and the Verlet algorithm was used to integrate the equations of motion. The energy cutoff was fixed at 25 Ry and the fictitious mass was kept at 400 u. a. The energies of the electronic and ionic systems were monitored throughout the simulations. The effect of solvent on the properties of the solutes was investigated using the radial pair distribution function, coordination number, temporal variation of the dihedral angles and the bond lengths, diffusion coefficient, and mean residence time. The calculation results show that the solvent modifies the electronic and geometrical parameters of the solutes. These parameters are important in the investigation of chemical reactions between the ions studied and organics and/or inorganics reactants. The methodology discussed in the present dissertation can be applied in industrial and biotechnology processes.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Estadual de GoiásUEG ::Coordenação de Mestrado Ciências MolecularesBrasilUEGPrograma de Pós-Graduação Stricto sensu em Ciências MolecularesCamargo, Ademir Joãohttps://orcid.org/0000-0001-9016-222Xhttp://lattes.cnpq.br/4703181040916099Oliveira, Anselmo Elcana deNapolitano, Hamilton BarbosaMartins, Gabriel Rodrigues2020-03-30T15:21:29Z2012-02-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfMARTINS, Gabriel Rodrigues. Estudo Teórico das Hidratações dos Íons Perclorato, Borohidreto e seus Sais de Sódio por Meio da Dinâmica Molecular de Car-Parrinello. 2012. 129 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Moleculares) - Câmpus Central - Sede: Anápolis - CET, Universidade Estadual de Goiás, Anápolis.http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/232porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEGinstname:Universidade Estadual de Goiás (UEG)instacron:UEG2020-12-02T19:21:24Zoai:tede2:tede/232Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://www.bdtd.ueg.br/PUBhttps://www.bdtd.ueg.br/oai/requestbibliotecaunucet@ueg.br||opendoar:2020-12-02T19:21:24Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEG - Universidade Estadual de Goiás (UEG)false
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