Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Fernanda Dornelas Florentino
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Tonietti, Paloma Oliveira, Espinoza, Luis Ramiro Luna, Brandão, Paulo Eduardo, Richtzenhain, Leonardo José, Gregori, Fabio
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Semina. Ciências Agrárias (Online)
Texto Completo: https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/14814
Resumo: Rotavírus é responsável pela ocorrência de diarreia em humanos e em várias espécies animais. Oito pares de oligonucleotídeos iniciadores (primers) foram desenvolvidos e utilizados como estratégia para o sequenciamento do tipo Sanger da região codificadora dos genes NSP1, NSP3 e VP6 com base nas áreas conservadas do genoma dos rotavírus do grupo A de suínos. Um total de 3 amostras previamente triadas como positivas para rotavírus do grupo A, tiveram os respectivos genes amplificados e seqüenciados por estes oligonucleotídeos iniciadores, possibilitando a caracterização das amostras circulantes, cujo conhecimento é essencial para a compreensão da epidemiologia da doença.
id UEL-11_a117780a9622032ba3eab991c2bf14ca
oai_identifier_str oai:ojs.pkp.sfu.ca:article/14814
network_acronym_str UEL-11
network_name_str Semina. Ciências Agrárias (Online)
repository_id_str
spelling Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo ADevelopment of primers for sequencing the NSP1, NSP3, and VP6 genes of the group A porcine rotavirusDiarréiaPCRRotavírus grupo ASequenciamentoSuíno.Ciencias AgráriasDiarrheaPCRGroup A rotavirusesSequencingSwine.Rotavírus é responsável pela ocorrência de diarreia em humanos e em várias espécies animais. Oito pares de oligonucleotídeos iniciadores (primers) foram desenvolvidos e utilizados como estratégia para o sequenciamento do tipo Sanger da região codificadora dos genes NSP1, NSP3 e VP6 com base nas áreas conservadas do genoma dos rotavírus do grupo A de suínos. Um total de 3 amostras previamente triadas como positivas para rotavírus do grupo A, tiveram os respectivos genes amplificados e seqüenciados por estes oligonucleotídeos iniciadores, possibilitando a caracterização das amostras circulantes, cujo conhecimento é essencial para a compreensão da epidemiologia da doença.Rotavirus is the causative pathogen of diarrhea in humans and in several animal species. Eight pairs of primers were developed and used for Sanger sequencing of the coding region of the NSP1, NSP3, and VP6 genes based on the conserved regions of the genome of the group A porcine rotavirus. Three samples previously screened as positive for group A rotaviruses were subjected to gene amplification and sequencing to characterize the pathogen. The information generated from this study is crucial for the understanding of the epidemiology of the disease.UEL2014-04-28info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionAvaliado por paresapplication/pdfhttps://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/1481410.5433/1679-0359.2014v35n2p901Semina: Ciências Agrárias; Vol. 35 No. 2 (2014); 901-904Semina: Ciências Agrárias; v. 35 n. 2 (2014); 901-9041679-03591676-546Xreponame:Semina. Ciências Agrárias (Online)instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELenghttps://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/14814/pdf_290Silva, Fernanda Dornelas FlorentinoTonietti, Paloma OliveiraEspinoza, Luis Ramiro LunaBrandão, Paulo EduardoRichtzenhain, Leonardo JoséGregori, Fabioinfo:eu-repo/semantics/openAccess2015-11-19T18:35:55Zoai:ojs.pkp.sfu.ca:article/14814Revistahttp://www.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrariasPUBhttps://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/oaisemina.agrarias@uel.br1679-03591676-546Xopendoar:2015-11-19T18:35:55Semina. Ciências Agrárias (Online) - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false
dc.title.none.fl_str_mv Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
Development of primers for sequencing the NSP1, NSP3, and VP6 genes of the group A porcine rotavirus
title Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
spellingShingle Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
Silva, Fernanda Dornelas Florentino
Diarréia
PCR
Rotavírus grupo A
Sequenciamento
Suíno.
Ciencias Agrárias
Diarrhea
PCR
Group A rotaviruses
Sequencing
Swine.
title_short Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
title_full Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
title_fullStr Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
title_full_unstemmed Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
title_sort Desenvolvimento de oligonucleotídeos iniciadores para sequenciamento dos genes codificadores das proteínas NSP1, NSP3 e VP6 de rotavírus suíno do grupo A
author Silva, Fernanda Dornelas Florentino
author_facet Silva, Fernanda Dornelas Florentino
Tonietti, Paloma Oliveira
Espinoza, Luis Ramiro Luna
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
Gregori, Fabio
author_role author
author2 Tonietti, Paloma Oliveira
Espinoza, Luis Ramiro Luna
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
Gregori, Fabio
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Fernanda Dornelas Florentino
Tonietti, Paloma Oliveira
Espinoza, Luis Ramiro Luna
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
Gregori, Fabio
dc.subject.por.fl_str_mv Diarréia
PCR
Rotavírus grupo A
Sequenciamento
Suíno.
Ciencias Agrárias
Diarrhea
PCR
Group A rotaviruses
Sequencing
Swine.
topic Diarréia
PCR
Rotavírus grupo A
Sequenciamento
Suíno.
Ciencias Agrárias
Diarrhea
PCR
Group A rotaviruses
Sequencing
Swine.
description Rotavírus é responsável pela ocorrência de diarreia em humanos e em várias espécies animais. Oito pares de oligonucleotídeos iniciadores (primers) foram desenvolvidos e utilizados como estratégia para o sequenciamento do tipo Sanger da região codificadora dos genes NSP1, NSP3 e VP6 com base nas áreas conservadas do genoma dos rotavírus do grupo A de suínos. Um total de 3 amostras previamente triadas como positivas para rotavírus do grupo A, tiveram os respectivos genes amplificados e seqüenciados por estes oligonucleotídeos iniciadores, possibilitando a caracterização das amostras circulantes, cujo conhecimento é essencial para a compreensão da epidemiologia da doença.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-04-28
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Avaliado por pares
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/14814
10.5433/1679-0359.2014v35n2p901
url https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/14814
identifier_str_mv 10.5433/1679-0359.2014v35n2p901
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/14814/pdf_290
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UEL
publisher.none.fl_str_mv UEL
dc.source.none.fl_str_mv Semina: Ciências Agrárias; Vol. 35 No. 2 (2014); 901-904
Semina: Ciências Agrárias; v. 35 n. 2 (2014); 901-904
1679-0359
1676-546X
reponame:Semina. Ciências Agrárias (Online)
instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron:UEL
instname_str Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron_str UEL
institution UEL
reponame_str Semina. Ciências Agrárias (Online)
collection Semina. Ciências Agrárias (Online)
repository.name.fl_str_mv Semina. Ciências Agrárias (Online) - Universidade Estadual de Londrina (UEL)
repository.mail.fl_str_mv semina.agrarias@uel.br
_version_ 1799306069609021440