Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cunha, Luana Karen Holanda da
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/9440108630259083
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
Texto Completo: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2239
Resumo: O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) é caracterizado por uma ampla diversidade genética. Dois tipos de HIV são reconhecidos atualmente: HIV-1 e HIV-2. O HIV-1, responsável pela maioria dos casos de aids no mundo, é dividido em três grupos denominados M (Major), O (Outlier) e N (Non-M/Non-O). Para o grupo M, nove subtipos foram identificados até o momento: A-D, F-H, J, K. Além desses subtipos, o HIV-1 também tem sido classificado em formas recombinantes circulantes (CRFs) e formas recombinantes únicas (URFs). No Brasil, um complexo padrão de distribuição desses subtipos tem sido descrito em suas diferentes regiões geográficas. Buscando esclarecer a distribuição dos subtipos de HIV-1 predominantes na cidade de Manaus, este estudo teve como objetivo analisar amostras de sangue de indivíduos candidatos a doadores de sangue que apresentaram resultados positivo ou indeterminado para HIV-1, na triagem sistemática para doação de sangue da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas (HEMOAM). Na ocasião da coleta, os doadores registraram a sua autorização através da assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido e responderam a um questionário utilizado para investigação de dados epidemiológicos. O DNA proviral extraído das amostras com resultados indeterminado/positivo no Wersten Blot foi submetido a uma Reação em Cadeia da Polimerase em duas etapas (Nested PCR) para a confirmação da infecção pelo HIV-1. Os produtos amplificados (regiões gag, pol e env) das 31 amostras reativas por PCR foram seqüenciados e analisados por métodos filogenéticos usando o programa Phylip. Todas as amostras indeterminadas para o teste confirmatório apresentaram padrão de amplificação negativo. Das amostras reativas para HIV-I no teste confirmatório e PCR, observou-se predominância do sexo masculino (77,4%) e de doadores de primeira vez (67,7%). Entre os doadores de repetição, 60 % apresentaram soroconversão em até 20 meses. Do total de amostras, identificou-se a predominância do subtipo B (87,1%), seguida do subtipo C (6,5%), F (3,2%) e recombinante BF (3,2%). As seqüências de aminoácidos de 19 isolados foram analisadas para a caracterização da variabilidade genética da região da alça V3. Dentre os isolados do subtipo B, o tetrapeptídeo mais prevalente foi o GPGR (68,4%), seguido pelo variante brasileiro B GWGR (15,8%). A ocorrência do Subtipo C na região Norte, ainda não foi relatada na literatura. As análises de similaridade dos isolados do subtipo C nesse estudo demonstraram maior semelhança destes com outros isolados brasileiros, em relação a isolados de outras partes do mundo. Nossos resultados contribuem para uma melhor compreensão das características dos isolados do HIV-1 circulantes no Brasil, informações que poderão ser utilizados em benefício do diagnóstico, tratamento, controle da doença e preparação de vacinas.
id UFAM_f384643e29a88a9f9ec3c897438b4e85
oai_identifier_str oai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/2239
network_acronym_str UFAM
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository_id_str 6592
spelling Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.HIV-1SubtiposPCRGenotipagemHIV-1SubtypesPCRGenotypingCIÊNCIAS BIOLÓGICASO Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) é caracterizado por uma ampla diversidade genética. Dois tipos de HIV são reconhecidos atualmente: HIV-1 e HIV-2. O HIV-1, responsável pela maioria dos casos de aids no mundo, é dividido em três grupos denominados M (Major), O (Outlier) e N (Non-M/Non-O). Para o grupo M, nove subtipos foram identificados até o momento: A-D, F-H, J, K. Além desses subtipos, o HIV-1 também tem sido classificado em formas recombinantes circulantes (CRFs) e formas recombinantes únicas (URFs). No Brasil, um complexo padrão de distribuição desses subtipos tem sido descrito em suas diferentes regiões geográficas. Buscando esclarecer a distribuição dos subtipos de HIV-1 predominantes na cidade de Manaus, este estudo teve como objetivo analisar amostras de sangue de indivíduos candidatos a doadores de sangue que apresentaram resultados positivo ou indeterminado para HIV-1, na triagem sistemática para doação de sangue da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas (HEMOAM). Na ocasião da coleta, os doadores registraram a sua autorização através da assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido e responderam a um questionário utilizado para investigação de dados epidemiológicos. O DNA proviral extraído das amostras com resultados indeterminado/positivo no Wersten Blot foi submetido a uma Reação em Cadeia da Polimerase em duas etapas (Nested PCR) para a confirmação da infecção pelo HIV-1. Os produtos amplificados (regiões gag, pol e env) das 31 amostras reativas por PCR foram seqüenciados e analisados por métodos filogenéticos usando o programa Phylip. Todas as amostras indeterminadas para o teste confirmatório apresentaram padrão de amplificação negativo. Das amostras reativas para HIV-I no teste confirmatório e PCR, observou-se predominância do sexo masculino (77,4%) e de doadores de primeira vez (67,7%). Entre os doadores de repetição, 60 % apresentaram soroconversão em até 20 meses. Do total de amostras, identificou-se a predominância do subtipo B (87,1%), seguida do subtipo C (6,5%), F (3,2%) e recombinante BF (3,2%). As seqüências de aminoácidos de 19 isolados foram analisadas para a caracterização da variabilidade genética da região da alça V3. Dentre os isolados do subtipo B, o tetrapeptídeo mais prevalente foi o GPGR (68,4%), seguido pelo variante brasileiro B GWGR (15,8%). A ocorrência do Subtipo C na região Norte, ainda não foi relatada na literatura. As análises de similaridade dos isolados do subtipo C nesse estudo demonstraram maior semelhança destes com outros isolados brasileiros, em relação a isolados de outras partes do mundo. Nossos resultados contribuem para uma melhor compreensão das características dos isolados do HIV-1 circulantes no Brasil, informações que poderão ser utilizados em benefício do diagnóstico, tratamento, controle da doença e preparação de vacinas.The Human Immunodeficiency Virus (HIV) is characterized by a wide genetic diversity. Two types of HIV are recognized at present: HIV-1 and HIV-2. The HIV-1, responsible for most of the cases of AIDS in the world, is divided in three groups denominated M (Major), O (Outlier) and N (Non-M/Non-O), and until this moment nine subtypes of the group M (A-D, F-H, J-K) were already identified. Beyond of those subtypes, the HIV-1 also have been classified in circulating recombinant forms (CRFs) and unique recombinant forms (URFs). In Brazil, a pattern complex of distribution of those subtypes has been described in their different geographical areas. In search of elucidating the predominant subtypes of HIV-1 in the city of Manaus, this study had as objective to analyze blood samples of subjects that presented results positive or indeterminate for HIV, in the systematic selection of blood donors of the Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas (HEMOAM). In the moment of the collect, the donors registered their authorization by the signature of the free consent and knowledge term and they answered a questionnaire used for epidemic data investigation. DNA proviral extracted of the samples with indeterminate/positive resulted in Western Blot was submitted a Polimerase Chain Reaction in two stages (Nested PCR) for the confirmation of the HIV-I infection. The amplified products (regions gag, pol and env) of the 31 samples reactivate for PCR were automatically sequencing and analyzed phylogenetically by the Phylip program. All of the indeterminate samples for the confirmatory test presented negative amplification pattern. Of the reactivates samples for HIV in the confirmatory test and PCR, it was observed male predominance (77,4%) and in the donors of first time (67,7%). Among the repetition donors, 60% presented seroconvertion in up to 20 months. Of the total of samples, was identified the predominance of the subtype B (87,1%), following by the subtype C (6,5%), F (3,2%) and recombinant BF (3,2%). The amino acids sequences of 19 isolated were analyzed for the genetic variability characterization of the region of the loop V3. Among the isolated of the subtype B, the tetrapeptide more prevalente was GPGR (68,4%), following by the Brazilian variant B" GWGR (15,8%). The Subtype C occurrence in the North Region still was not reported in the literature. The analyses of similarity of the isolated of the subtype C in this study demonstrated larger similarity of these with other isolated ones brazilian, in relation to isolated in other parts of the world. Our results can contribute to a better understanding of the characteristics of the lineages of the HIV-1 circulating in Brazil, information that can be used in benefit of the diagnosis, treatment, control of the disease and preparation of vaccines.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do AmazonasUniversidade Federal do AmazonasInstituto de Ciências BiológicasBRUFAMPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaMalheiro, Adrianahttp://lattes.cnpq.br/2627415957053194Cunha, Luana Karen Holanda dahttp://lattes.cnpq.br/94401086302590832015-04-11T13:38:39Z2015-04-082007-11-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfCUNHA, Luana Karen Holanda da. Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.. 2007. 82 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2007.http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2239porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAMinstname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)instacron:UFAM2016-04-22T14:23:24Zoai:https://tede.ufam.edu.br/handle/:tede/2239Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://200.129.163.131:8080/PUBhttp://200.129.163.131:8080/oai/requestddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.bropendoar:65922016-04-22T14:23:24Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
title Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
spellingShingle Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
Cunha, Luana Karen Holanda da
HIV-1
Subtipos
PCR
Genotipagem
HIV-1
Subtypes
PCR
Genotyping
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
title_short Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
title_full Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
title_fullStr Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
title_full_unstemmed Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
title_sort Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.
author Cunha, Luana Karen Holanda da
author_facet Cunha, Luana Karen Holanda da
http://lattes.cnpq.br/9440108630259083
author_role author
author2 http://lattes.cnpq.br/9440108630259083
author2_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Malheiro, Adriana
http://lattes.cnpq.br/2627415957053194
dc.contributor.author.fl_str_mv Cunha, Luana Karen Holanda da
http://lattes.cnpq.br/9440108630259083
dc.subject.por.fl_str_mv HIV-1
Subtipos
PCR
Genotipagem
HIV-1
Subtypes
PCR
Genotyping
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
topic HIV-1
Subtipos
PCR
Genotipagem
HIV-1
Subtypes
PCR
Genotyping
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
description O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) é caracterizado por uma ampla diversidade genética. Dois tipos de HIV são reconhecidos atualmente: HIV-1 e HIV-2. O HIV-1, responsável pela maioria dos casos de aids no mundo, é dividido em três grupos denominados M (Major), O (Outlier) e N (Non-M/Non-O). Para o grupo M, nove subtipos foram identificados até o momento: A-D, F-H, J, K. Além desses subtipos, o HIV-1 também tem sido classificado em formas recombinantes circulantes (CRFs) e formas recombinantes únicas (URFs). No Brasil, um complexo padrão de distribuição desses subtipos tem sido descrito em suas diferentes regiões geográficas. Buscando esclarecer a distribuição dos subtipos de HIV-1 predominantes na cidade de Manaus, este estudo teve como objetivo analisar amostras de sangue de indivíduos candidatos a doadores de sangue que apresentaram resultados positivo ou indeterminado para HIV-1, na triagem sistemática para doação de sangue da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas (HEMOAM). Na ocasião da coleta, os doadores registraram a sua autorização através da assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido e responderam a um questionário utilizado para investigação de dados epidemiológicos. O DNA proviral extraído das amostras com resultados indeterminado/positivo no Wersten Blot foi submetido a uma Reação em Cadeia da Polimerase em duas etapas (Nested PCR) para a confirmação da infecção pelo HIV-1. Os produtos amplificados (regiões gag, pol e env) das 31 amostras reativas por PCR foram seqüenciados e analisados por métodos filogenéticos usando o programa Phylip. Todas as amostras indeterminadas para o teste confirmatório apresentaram padrão de amplificação negativo. Das amostras reativas para HIV-I no teste confirmatório e PCR, observou-se predominância do sexo masculino (77,4%) e de doadores de primeira vez (67,7%). Entre os doadores de repetição, 60 % apresentaram soroconversão em até 20 meses. Do total de amostras, identificou-se a predominância do subtipo B (87,1%), seguida do subtipo C (6,5%), F (3,2%) e recombinante BF (3,2%). As seqüências de aminoácidos de 19 isolados foram analisadas para a caracterização da variabilidade genética da região da alça V3. Dentre os isolados do subtipo B, o tetrapeptídeo mais prevalente foi o GPGR (68,4%), seguido pelo variante brasileiro B GWGR (15,8%). A ocorrência do Subtipo C na região Norte, ainda não foi relatada na literatura. As análises de similaridade dos isolados do subtipo C nesse estudo demonstraram maior semelhança destes com outros isolados brasileiros, em relação a isolados de outras partes do mundo. Nossos resultados contribuem para uma melhor compreensão das características dos isolados do HIV-1 circulantes no Brasil, informações que poderão ser utilizados em benefício do diagnóstico, tratamento, controle da doença e preparação de vacinas.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007-11-16
2015-04-11T13:38:39Z
2015-04-08
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv CUNHA, Luana Karen Holanda da. Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.. 2007. 82 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2007.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2239
identifier_str_mv CUNHA, Luana Karen Holanda da. Caracterização dos Genótipos do HIV em doadores de sangue soropositivos da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas.. 2007. 82 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2007.
url http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2239
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
BR
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Amazonas
Instituto de Ciências Biológicas
BR
UFAM
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
instname:Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron:UFAM
instname_str Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
instacron_str UFAM
institution UFAM
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM - Universidade Federal do Amazonas (UFAM)
repository.mail.fl_str_mv ddbc@ufam.edu.br||ddbc@ufam.edu.br
_version_ 1809731998849171456