Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFBA |
Texto Completo: | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38370 |
Resumo: | A dengue é uma das doenças virais transmitida pelo mosquito do gênero Aedes, que ocupa lugar significativo em campanhas de saúde pública no Brasil. São conhecidos atualmente quatro sorotipos, antigenicamente distintos, fatores como mutações, recombinações, suscetibilidade do hospedeiro e fluxo gênico dos sorotipos do DENV têm causado maior predisposição dos mesmos a essa diversidade. Com o objetivo de investigar a existência de variantes do DENV-1 no estado da Bahia, foram utilizadas, além da técnica de RT-qPCR para a detecção do DENV-1, a técnica de sequenciamento e análise filogenética das regiões sequenciadas. A análise das sequências alinhadas mostrou diversos novos SNPs, não presentes em qualquer das outras cepas analisadas. |
id |
UFBA-2_02139ceae6f861b36a15236ecf886278 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufba.br:ri/38370 |
network_acronym_str |
UFBA-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFBA |
repository_id_str |
1932 |
spelling |
2023-11-09T11:26:13Z2023-11-09T11:26:13Z2022-12-14MENEZES, Aline Dórea Luz. Caracterização genotípica do Dengue vírus tipo 1 no Estado da Bahia. 2022. 54 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Salvador, 2022.https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38370A dengue é uma das doenças virais transmitida pelo mosquito do gênero Aedes, que ocupa lugar significativo em campanhas de saúde pública no Brasil. São conhecidos atualmente quatro sorotipos, antigenicamente distintos, fatores como mutações, recombinações, suscetibilidade do hospedeiro e fluxo gênico dos sorotipos do DENV têm causado maior predisposição dos mesmos a essa diversidade. Com o objetivo de investigar a existência de variantes do DENV-1 no estado da Bahia, foram utilizadas, além da técnica de RT-qPCR para a detecção do DENV-1, a técnica de sequenciamento e análise filogenética das regiões sequenciadas. A análise das sequências alinhadas mostrou diversos novos SNPs, não presentes em qualquer das outras cepas analisadas.Dengue is one of the viral diseases transmitted by mosquitoes of the Aedes genus, which occupies a significant place in public health campaigns in Brazil. Four antigenically distinct serotypes are currently known. Factors such as mutations, recombinations, host susceptibility and gene flow of DENV serotypes have caused a greater predisposition to this diversity. In order to investigate the existence of DENV-1 variants in the state of Bahia, in addition to the RT-qPCR technique for the detection of DENV-1, the sequencing technique and phylogenetic analysis of the sequenced regions were used. Analysis of the aligned sequences showed several new SNPs, not present in any of the other strains analyzed.Submitted by Aline Menezes (alinedorea93@gmail.com) on 2023-11-06T22:45:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5) Aline-Dissertacao. publi.pdf: 1982787 bytes, checksum: da4eff3a1856987612272a2f1d632aea (MD5)Approved for entry into archive by Marly Santos (marly@ufba.br) on 2023-11-09T11:26:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Aline-Dissertacao. publi.pdf: 1982787 bytes, checksum: da4eff3a1856987612272a2f1d632aea (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5)Made available in DSpace on 2023-11-09T11:26:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Aline-Dissertacao. publi.pdf: 1982787 bytes, checksum: da4eff3a1856987612272a2f1d632aea (MD5) license_rdf: 805 bytes, checksum: c4c98de35c20c53220c07884f4def27c (MD5) Previous issue date: 2022-12-14porUniversidade Federal da BahiaPrograma de Pós-graduação em Biotecnologia (PPGBiotec) UFBABrasilInstituto de Ciências da Saúde - ICSAttribution-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessDENVPhylogenetic analysisRT-qPCRVariantsDengue VirusPhylogenyCNPQ::CIENCIAS DA SAUDEDENVAnálise filogenéticaRT-qPCRVariantesVírus da DengueFilogeniaCaracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da BahiaMestrado Acadêmicoinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionCampos, Gúbio Soareshttps://orcid.org/0000-0002-1700-2462http://lattes.cnpq.br/4553891428822702Sardi, Silvia Inêshttps://orcid.org/0000-0002-2002-8436http://lattes.cnpq.br/9961410205186433Monte Alegre, Adriano Figueiredohttps://orcid.org/0000-0003-0225-4613http://lattes.cnpq.br/9831551145105266Tigre, Dellane Martinshttps://orcid.org/0000-0002-7435-9986http://lattes.cnpq.br/1274658898656184Campos, Gúbio Soareshttps://orcid.org/0000-0002-1700-2462http://lattes.cnpq.br/4553891428822702https://orcid.org/0000-0002-1416-2874https://lattes.cnpq.br/2073042955248663Menezes, Aline Dórea Luzreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBATEXTAline-Dissertacao. publi.pdf.txtAline-Dissertacao. publi.pdf.txtExtracted texttext/plain75555https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/4/Aline-Dissertacao.%20publi.pdf.txt90fe6d4ee9899d8c61548311b7f0576aMD54ORIGINALAline-Dissertacao. publi.pdfAline-Dissertacao. publi.pdfapplication/pdf1982787https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/1/Aline-Dissertacao.%20publi.pdfda4eff3a1856987612272a2f1d632aeaMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/2/license_rdfc4c98de35c20c53220c07884f4def27cMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1715https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/3/license.txt67bf4f75790b0d8d38d8f112a48ad90bMD53ri/383702023-11-11 02:05:49.293oai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322023-11-11T05:05:49Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
title |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
spellingShingle |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia Menezes, Aline Dórea Luz CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE DENV Análise filogenética RT-qPCR Variantes Vírus da Dengue Filogenia DENV Phylogenetic analysis RT-qPCR Variants Dengue Virus Phylogeny |
title_short |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
title_full |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
title_fullStr |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
title_full_unstemmed |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
title_sort |
Caracterização genotípica do dengue vírus tipo 1 no estado da Bahia |
author |
Menezes, Aline Dórea Luz |
author_facet |
Menezes, Aline Dórea Luz |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Campos, Gúbio Soares |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-1700-2462 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4553891428822702 |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Sardi, Silvia Inês |
dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-2002-8436 |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/9961410205186433 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Monte Alegre, Adriano Figueiredo |
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0003-0225-4613 |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/9831551145105266 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Tigre, Dellane Martins |
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-7435-9986 |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1274658898656184 |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
Campos, Gúbio Soares |
dc.contributor.referee3ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-1700-2462 |
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4553891428822702 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-1416-2874 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
https://lattes.cnpq.br/2073042955248663 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Menezes, Aline Dórea Luz |
contributor_str_mv |
Campos, Gúbio Soares Sardi, Silvia Inês Monte Alegre, Adriano Figueiredo Tigre, Dellane Martins Campos, Gúbio Soares |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE |
topic |
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE DENV Análise filogenética RT-qPCR Variantes Vírus da Dengue Filogenia DENV Phylogenetic analysis RT-qPCR Variants Dengue Virus Phylogeny |
dc.subject.por.fl_str_mv |
DENV Análise filogenética RT-qPCR Variantes Vírus da Dengue Filogenia |
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv |
DENV Phylogenetic analysis RT-qPCR Variants Dengue Virus Phylogeny |
description |
A dengue é uma das doenças virais transmitida pelo mosquito do gênero Aedes, que ocupa lugar significativo em campanhas de saúde pública no Brasil. São conhecidos atualmente quatro sorotipos, antigenicamente distintos, fatores como mutações, recombinações, suscetibilidade do hospedeiro e fluxo gênico dos sorotipos do DENV têm causado maior predisposição dos mesmos a essa diversidade. Com o objetivo de investigar a existência de variantes do DENV-1 no estado da Bahia, foram utilizadas, além da técnica de RT-qPCR para a detecção do DENV-1, a técnica de sequenciamento e análise filogenética das regiões sequenciadas. A análise das sequências alinhadas mostrou diversos novos SNPs, não presentes em qualquer das outras cepas analisadas. |
publishDate |
2022 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2022-12-14 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2023-11-09T11:26:13Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2023-11-09T11:26:13Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
Mestrado Acadêmico info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
MENEZES, Aline Dórea Luz. Caracterização genotípica do Dengue vírus tipo 1 no Estado da Bahia. 2022. 54 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Salvador, 2022. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38370 |
identifier_str_mv |
MENEZES, Aline Dórea Luz. Caracterização genotípica do Dengue vírus tipo 1 no Estado da Bahia. 2022. 54 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Salvador, 2022. |
url |
https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38370 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Bahia |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-graduação em Biotecnologia (PPGBiotec) |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFBA |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Instituto de Ciências da Saúde - ICS |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Bahia |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFBA instname:Universidade Federal da Bahia (UFBA) instacron:UFBA |
instname_str |
Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
instacron_str |
UFBA |
institution |
UFBA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFBA |
collection |
Repositório Institucional da UFBA |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/4/Aline-Dissertacao.%20publi.pdf.txt https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/1/Aline-Dissertacao.%20publi.pdf https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/2/license_rdf https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/38370/3/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
90fe6d4ee9899d8c61548311b7f0576a da4eff3a1856987612272a2f1d632aea c4c98de35c20c53220c07884f4def27c 67bf4f75790b0d8d38d8f112a48ad90b |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1808459684167811072 |