Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2010 |
Outros Autores: | |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFBA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/22707 |
Resumo: | Foram simulados mapeamentos genéticos utilizando diferentes níveis de saturação por marcadores para estimar os parâmetros: valor fenotípico, endogamia, alelos favoráveis fixados e frequência de alelos da característica, na seleção assistida por marcadores (MAS). Procedeu-se àanálise de agrupamento com os valores fenotípicos, com a finalidade de se obterem densidades que otimizassem os incrementos fenotípicos. O sistema de simulação genética Genesys foi utilizado para simular o genoma, constituído de uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10, e as populações base e inicial. A população inicial foi submetida à MAS por vinte gerações consecutivas. Ela foi conduzida em diferentes níveis de saturação, representados pela distância, em centiMorgan (cM), entre marcadores adjacentes. Foram praticadas 15 MAS, cada qual correspondendo às densidades: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 e 30 cM. O mapeamento, empregando de média a alta densidade de marcadores, assinalou eficiência nos progressos fenotípicos ao longo das gerações sob seleção. Essa alta saturação também beneficiou a fixação de alelos favoráveis, elevando a frequência de alelos relacionados à característica, apesar do acréscimo mais eminente na endogamia. A análise de agrupamento indicou otimização e correspondência nos valores fenotípicos ao admitir as densidades de 4 e 6 cM, além de ganhos expressivos para a saturação de 2, 8, 10, 12 e 14 cM. |
id |
UFBA-2_7a2309836a1e9969ccccb683e214a188 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufba.br:ri/22707 |
network_acronym_str |
UFBA-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFBA |
repository_id_str |
1932 |
spelling |
Jangarelli, MarceloEuclydes, Ricardo FredericoJangarelli, MarceloEuclydes, Ricardo Frederico2017-06-01T19:20:42Z2017-06-01T19:20:42Z2010-01R. Ci. méd. biol., v. 9, Supl.1, p. 22-28, 2010.1677-5090http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/22707v.9, n.1Foram simulados mapeamentos genéticos utilizando diferentes níveis de saturação por marcadores para estimar os parâmetros: valor fenotípico, endogamia, alelos favoráveis fixados e frequência de alelos da característica, na seleção assistida por marcadores (MAS). Procedeu-se àanálise de agrupamento com os valores fenotípicos, com a finalidade de se obterem densidades que otimizassem os incrementos fenotípicos. O sistema de simulação genética Genesys foi utilizado para simular o genoma, constituído de uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10, e as populações base e inicial. A população inicial foi submetida à MAS por vinte gerações consecutivas. Ela foi conduzida em diferentes níveis de saturação, representados pela distância, em centiMorgan (cM), entre marcadores adjacentes. Foram praticadas 15 MAS, cada qual correspondendo às densidades: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 e 30 cM. O mapeamento, empregando de média a alta densidade de marcadores, assinalou eficiência nos progressos fenotípicos ao longo das gerações sob seleção. Essa alta saturação também beneficiou a fixação de alelos favoráveis, elevando a frequência de alelos relacionados à característica, apesar do acréscimo mais eminente na endogamia. A análise de agrupamento indicou otimização e correspondência nos valores fenotípicos ao admitir as densidades de 4 e 6 cM, além de ganhos expressivos para a saturação de 2, 8, 10, 12 e 14 cM.Submitted by ROBERTO PAULO CORREIA DE ARAÚJO (ppgorgsistem@ufba.br) on 2017-06-01T19:20:42Z No. of bitstreams: 1 5_v.9_1.pdf: 2672660 bytes, checksum: 9d6cfa97b3b702309118018e0760a75e (MD5)Made available in DSpace on 2017-06-01T19:20:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5_v.9_1.pdf: 2672660 bytes, checksum: 9d6cfa97b3b702309118018e0760a75e (MD5) Previous issue date: 2010-01SalvadorInstituto de Ciências da Saúde/ Universidade Federal da BahiaBrasilhttp://www.portalseer.ufba.br/index.php/cmbio/article/view/4636/3468reponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAMapeamento genéticoDensidade de marcadoresAnálise de agrupamentoeleção assistida por marcadores – QTL.Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômicoRevista de Ciências Médicas e Biológicasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessporORIGINAL5_v.9_1.pdf5_v.9_1.pdfapplication/pdf2672660https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/1/5_v.9_1.pdf9d6cfa97b3b702309118018e0760a75eMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1383https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/2/license.txt05eca2f01d0b3307819d0369dab18a34MD52TEXT5_v.9_1.pdf.txt5_v.9_1.pdf.txtExtracted texttext/plain26215https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/3/5_v.9_1.pdf.txt684ad0ccc81a78c26f180484d63ab113MD53ri/227072022-08-08 13:18:18.738oai:repositorio.ufba.br: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ório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322022-08-08T16:18:18Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Revista de Ciências Médicas e Biológicas |
title |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
spellingShingle |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico Jangarelli, Marcelo Mapeamento genético Densidade de marcadores Análise de agrupamento eleção assistida por marcadores – QTL. |
title_short |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
title_full |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
title_fullStr |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
title_full_unstemmed |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
title_sort |
Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico |
author |
Jangarelli, Marcelo |
author_facet |
Jangarelli, Marcelo Euclydes, Ricardo Frederico |
author_role |
author |
author2 |
Euclydes, Ricardo Frederico |
author2_role |
author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Jangarelli, Marcelo Euclydes, Ricardo Frederico Jangarelli, Marcelo Euclydes, Ricardo Frederico |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Mapeamento genético Densidade de marcadores Análise de agrupamento eleção assistida por marcadores – QTL. |
topic |
Mapeamento genético Densidade de marcadores Análise de agrupamento eleção assistida por marcadores – QTL. |
description |
Foram simulados mapeamentos genéticos utilizando diferentes níveis de saturação por marcadores para estimar os parâmetros: valor fenotípico, endogamia, alelos favoráveis fixados e frequência de alelos da característica, na seleção assistida por marcadores (MAS). Procedeu-se àanálise de agrupamento com os valores fenotípicos, com a finalidade de se obterem densidades que otimizassem os incrementos fenotípicos. O sistema de simulação genética Genesys foi utilizado para simular o genoma, constituído de uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10, e as populações base e inicial. A população inicial foi submetida à MAS por vinte gerações consecutivas. Ela foi conduzida em diferentes níveis de saturação, representados pela distância, em centiMorgan (cM), entre marcadores adjacentes. Foram praticadas 15 MAS, cada qual correspondendo às densidades: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 e 30 cM. O mapeamento, empregando de média a alta densidade de marcadores, assinalou eficiência nos progressos fenotípicos ao longo das gerações sob seleção. Essa alta saturação também beneficiou a fixação de alelos favoráveis, elevando a frequência de alelos relacionados à característica, apesar do acréscimo mais eminente na endogamia. A análise de agrupamento indicou otimização e correspondência nos valores fenotípicos ao admitir as densidades de 4 e 6 cM, além de ganhos expressivos para a saturação de 2, 8, 10, 12 e 14 cM. |
publishDate |
2010 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2010-01 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-06-01T19:20:42Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2017-06-01T19:20:42Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
R. Ci. méd. biol., v. 9, Supl.1, p. 22-28, 2010. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/22707 |
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv |
1677-5090 |
dc.identifier.number.pt_BR.fl_str_mv |
v.9, n.1 |
identifier_str_mv |
R. Ci. méd. biol., v. 9, Supl.1, p. 22-28, 2010. 1677-5090 v.9, n.1 |
url |
http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/22707 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Instituto de Ciências da Saúde/ Universidade Federal da Bahia |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Instituto de Ciências da Saúde/ Universidade Federal da Bahia |
dc.source.pt_BR.fl_str_mv |
http://www.portalseer.ufba.br/index.php/cmbio/article/view/4636/3468 |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFBA instname:Universidade Federal da Bahia (UFBA) instacron:UFBA |
instname_str |
Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
instacron_str |
UFBA |
institution |
UFBA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFBA |
collection |
Repositório Institucional da UFBA |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/1/5_v.9_1.pdf https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/2/license.txt https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/22707/3/5_v.9_1.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
9d6cfa97b3b702309118018e0760a75e 05eca2f01d0b3307819d0369dab18a34 684ad0ccc81a78c26f180484d63ab113 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1808459509673230336 |