Estudo de variantes no gene AKT1 e o seu papel na gravidade da COVID-19

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Ingrid Marins de
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFBA
Texto Completo: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38189
Resumo: Introdução: A pandemia da COVID-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2, foi uma crise global, sendo o Brasil um dos países com maior número de mortes ocorridas devido à COVID-19 no mundo, 701.494 mortes. Muitos fatores podem determinar a gravidade da doença, incluindo carga viral, fatores genéticos, presença de comorbidades, idade, sexo e inflamação descontrolada. Estima-se que aproximadamente 5% dos casos desenvolvem síndrome do desconforto respiratório agudo grave devido à tempestade de citocinas. Uma via de sinalização celular que pode estar envolvida nesse processo é a PI3K/AKT/MTOR. Estudos demonstram que a inibição de AKT pode potencialmente suprimir a inflamação patológica, tempestade de citocinas, fibroproliferação e ativação plaquetária associada a COVID-19. Objetivos: Investigar a associação entre as variantes, rs2494746 e rs1130214, do gene AKT1 com a gravidade da COVID-19. Métodos: Amostras de sangue periférico e dados sociodemográficos foram coletados de 508 indivíduos com COVID-19, 216 casos leves e 292 casos graves, de abril de 2020 a abril de 2021. As concentrações plasmáticas de citocinas foram dosadas por ELISA. A genotipagem dos SNPs, rs1130214 e rs2494746, e a expressão do gene AKT1 foram realizadas usando kits da Thermo Fisher e analisadas por qRT-PCR no QuantStudio 12K (Applied Biosystems). Resultados e Conclusões: O alelo rs2494746-C foi associado à gravidade, internação na UTI e morte por COVID-19. Enquanto isso, o alelo C de rs1130214 foi associado a níveis elevados de TNF-α e D-dímero. Além disso, as variantes demonstraram um risco cumulativo associado à gravidade, criticidade e morte por COVID-19. Na análise preditiva, o rs2494746 obteve acurácia de 71%, sugerindo alta probabilidade do teste determinar a gravidade da doença. Portanto, o presente estudo contribui para entender a influência do gene AKT1 e suas variantes no dano imunológico em indivíduos infectados com SARS-CoV-2, o que pode ser útil no futuro para auxiliar na previsão de um pior resultado do COVID- 19.
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Métodos: Amostras de sangue periférico e dados sociodemográficos foram coletados de 508 indivíduos com COVID-19, 216 casos leves e 292 casos graves, de abril de 2020 a abril de 2021. As concentrações plasmáticas de citocinas foram dosadas por ELISA. A genotipagem dos SNPs, rs1130214 e rs2494746, e a expressão do gene AKT1 foram realizadas usando kits da Thermo Fisher e analisadas por qRT-PCR no QuantStudio 12K (Applied Biosystems). Resultados e Conclusões: O alelo rs2494746-C foi associado à gravidade, internação na UTI e morte por COVID-19. Enquanto isso, o alelo C de rs1130214 foi associado a níveis elevados de TNF-α e D-dímero. Além disso, as variantes demonstraram um risco cumulativo associado à gravidade, criticidade e morte por COVID-19. Na análise preditiva, o rs2494746 obteve acurácia de 71%, sugerindo alta probabilidade do teste determinar a gravidade da doença. Portanto, o presente estudo contribui para entender a influência do gene AKT1 e suas variantes no dano imunológico em indivíduos infectados com SARS-CoV-2, o que pode ser útil no futuro para auxiliar na previsão de um pior resultado do COVID- 19.Introduction: The COVID-19 pandemic, caused by the SARS-CoV-2 virus, was a global crisis, with Brazil being one of the countries with the highest number of deaths due to COVID-19 in the world, 701,494 deaths. Many factors can determine the severity of COVID-19, including viral load, genetic factors, presence of comorbidities, age, gender, and uncontrolled inflammation. It is estimated that approximately 5% of cases develop severe acute respiratory distress syndrome due to cytokine storm. A cell signaling pathway that may be involved in this process is PI3K/AKT/MTOR. Studies demonstrate that AKT inhibition can potentially suppress pathologic inflammation, cytokine storm, fibroproliferation, and platelet activation associated with COVID-19. Objectives: To investigate the association between AKT1 gene variants and the severity of COVID-19. Methods: Peripheral blood samples and sociodemographic data were collected from 508 individuals with COVID-19, 216 mild cases and 292 severe cases, from April 2020 to April 2021. Plasma cytokine concentrations were measured by ELISA. Genotyping of the SNPs, rs1130214 and rs2494746, and AKT1 gene expression were performed using Thermo Fisher kits and analyzed by qRT-PCR in the QuantStudio 12K (Applied Biosystems). Results and Conclusions: The rs2494746-C allele was associated with severity, ICU admission, and death from COVID-19. Meanwhile, the C allele of rs1130214 was associated with elevated TNF-α and D-dimer levels. In addition, variants demonstrated a cumulative risk associated with severity, criticality, and death from COVID-19. In the predictive analysis, the rs2494746 obtained an accuracy of 71%, suggesting a high probability of the test determining the severity of the disease. Therefore, the present study contributes to understanding the influence of the AKT1 gene and its variants on immune damage in individuals infected with SARS-CoV-2, which may be useful in the future to help predict a worse outcome of COVID-19.Submitted by Ingrid Almeida (ingridalmeida694@gmail.com) on 2023-10-21T13:24:20Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 914 bytes, checksum: 4d2950bda3d176f570a9f8b328dfbbef (MD5) Dissertação Ingrid Marins de Almeida.pdf: 786451 bytes, checksum: c3b89701a2b32b03a29e4b8620579f12 (MD5) ATA DEFESA Ingrid Marins de Almeida.pdf: 2126721 bytes, checksum: 699b8f73e386dc7196455a6986d575e4 (MD5)Approved for entry into archive by Edvaldo Souza (edvaldosouza@ufba.br) on 2023-10-23T14:05:39Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação Ingrid Marins de Almeida.pdf: 786451 bytes, checksum: c3b89701a2b32b03a29e4b8620579f12 (MD5) ATA DEFESA Ingrid Marins de Almeida.pdf: 2126721 bytes, checksum: 699b8f73e386dc7196455a6986d575e4 (MD5) license_rdf: 914 bytes, checksum: 4d2950bda3d176f570a9f8b328dfbbef (MD5)Made available in DSpace on 2023-10-23T14:05:39Z (GMT). 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