Impacto de variantes no gene MTOR na gravidade da COVID-19 em uma população brasileira
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Data de Publicação: | 2023 |
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Texto Completo: | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/36795 |
Resumo: | Introdução: A pandemia de SARS-CoV-2 causou milhares de mortes em todo o mundo. A gravidade da doença está associada à idade, sexo, comorbidades, e uma resposta inflamatória sistêmica exacerbada e descontrolada resultante da tempestade de citocinas. As tempestades de citocinas são caracterizadas por uma grande liberação desregulada de citocinas que podem ser desencadeadas por infecções virais e moduladas por várias vias de sinalização. A proteína alvo da rapamicina em mamíferos (mTOR) é uma serina treonina quinase capaz de modular a ativação celular e a resposta inflamatória inata das células, que é a primeira linha de defesa contra os vírus. A via mTORC1 mostrou ser afetada pelo SARS-CoV-2 e hiperativa em pacientes graves de COVID-19, o que sugere que a desregulação desta via pode desempenhar um papel importante no mau prognóstico da doença. Além disso, a genética dos pacientes poderia contribuir para esse desfecho. Objetivos: Investigar o envolvimento de variantes no gene MTOR com a gravidade da COVID-19 na população brasileira. Métodos: Indivíduos com COVID-19 grave e leve foram recrutados e amostras de sangue periférico e dados sociodemográficos foram coletados. Os SNVs rs1057079 e rs2536 do gene MTOR foram genotipados através de RT-qPCR. Realizamos análise de regressão logística e curvas de sobrevivência Kaplan-Meier. Aplicamos um escore de risco genético para estimar a contribuição cumulativa dos alelos de risco. Os níveis de plasma das citocinas TNF e IL-6 foram medidos através de ELISA e analisados. Resultados e Conclusões: O alelo T de rs1057079 foi associado ao risco de gravidade e a COVID-19 crítica, bem como ao aumento dos níveis plasmáticos de TNF. Enquanto isso, o genótipo TT de rs2536 foi associado com o óbito por COVID-19. Os alelos de risco das variantes mostraram um risco cumulativo quando herdados juntos e podem ser úteis para prever um resultado mais grave da COVID-19. |
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2023-03-31T11:02:55Z2023-03-31T11:02:55Z2023-02-03https://repositorio.ufba.br/handle/ri/36795Introdução: A pandemia de SARS-CoV-2 causou milhares de mortes em todo o mundo. A gravidade da doença está associada à idade, sexo, comorbidades, e uma resposta inflamatória sistêmica exacerbada e descontrolada resultante da tempestade de citocinas. As tempestades de citocinas são caracterizadas por uma grande liberação desregulada de citocinas que podem ser desencadeadas por infecções virais e moduladas por várias vias de sinalização. A proteína alvo da rapamicina em mamíferos (mTOR) é uma serina treonina quinase capaz de modular a ativação celular e a resposta inflamatória inata das células, que é a primeira linha de defesa contra os vírus. A via mTORC1 mostrou ser afetada pelo SARS-CoV-2 e hiperativa em pacientes graves de COVID-19, o que sugere que a desregulação desta via pode desempenhar um papel importante no mau prognóstico da doença. Além disso, a genética dos pacientes poderia contribuir para esse desfecho. Objetivos: Investigar o envolvimento de variantes no gene MTOR com a gravidade da COVID-19 na população brasileira. Métodos: Indivíduos com COVID-19 grave e leve foram recrutados e amostras de sangue periférico e dados sociodemográficos foram coletados. Os SNVs rs1057079 e rs2536 do gene MTOR foram genotipados através de RT-qPCR. Realizamos análise de regressão logística e curvas de sobrevivência Kaplan-Meier. Aplicamos um escore de risco genético para estimar a contribuição cumulativa dos alelos de risco. Os níveis de plasma das citocinas TNF e IL-6 foram medidos através de ELISA e analisados. Resultados e Conclusões: O alelo T de rs1057079 foi associado ao risco de gravidade e a COVID-19 crítica, bem como ao aumento dos níveis plasmáticos de TNF. Enquanto isso, o genótipo TT de rs2536 foi associado com o óbito por COVID-19. Os alelos de risco das variantes mostraram um risco cumulativo quando herdados juntos e podem ser úteis para prever um resultado mais grave da COVID-19.Introduction: SARS-CoV-2’s pandemic has caused thousands of deaths worldwide. The disease’s severity is associated with age, sex, ongoing comorbidities along with exacerbated and uncontrolled systemic inflammatory response resulting from cytokine storm. Cytokine storms are characterized by a large dysregulated release of cytokines that can be triggered by viral infections and modulated by various signaling pathways. The target protein of rapamycin in mammals (mTOR) is a serine threonine kinase capable of shaping cellular activation and inflammatory innate response of cells, which is the first line of defense against viruses. The mTORC1 pathway has been shown to be affected by SARS-CoV-2 and hyperactivated in COVID-19’s severe patients which suggest that dysregulation of this pathway might play an important role in poor prognosis of disease. In addition, the genetic background of patients could possibly contribute to this outcome. Objectives: To investigate the involvement of variants in the MTOR gene with the severity of COVID-19 in the Brazilian population. Methods: Individuals with severe and mild COVID-19 were recruited and peripheral blood samples and sociodemographic data were collected. The SNVs rs1057079 and rs2536 of the MTOR gene were genotyped by RT-qPCR. We performed logistic regression analysis and Kaplan-Meier survival curves. We applied a genetic risk score to estimate the cumulative contribution of risk alleles. Plasma levels of the cytokines TNF and IL-6 were measured by ELISA and analyzed. Results and Conclusions: The T allele of rs1057079 was associated with risk of severity and critical COVID-19, as well as increased plasma levels of TNF. Meanwhile, the TT genotype of rs2536 was associated with death from COVID-19. The variant risk alleles showed a cumulative risk when inherited together and may be useful in predicting a more severe outcome of COVID-19.Submitted by Bruna Ramos Tosta (br.bruna.ramos@gmail.com) on 2023-03-29T16:37:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação_Bruna 29.03 - Repositório ufba.pdf: 642489 bytes, checksum: 6dfbadab9507ed8fceb90751a6fe2205 (MD5)Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2023-03-31T11:02:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação_Bruna 29.03 - Repositório ufba.pdf: 642489 bytes, checksum: 6dfbadab9507ed8fceb90751a6fe2205 (MD5) license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)Made available in DSpace on 2023-03-31T11:02:55Z (GMT). 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