Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFBA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/33502 |
Resumo: | Os ácaros Blomia tropicalis e Dermatophagoides pteronyssinus desempenham um papel importante no desencadeamento de manifestações alérgicas. A identificação de ácaros é principalmente baseada na morfologia, uma técnica demorada e ambígua. O ácaro Glycycometus malaysiensis é alergênico e morfologicamente semelhante a B. tropicalis, o que torna crucial a identificação precisa dessas espécies. Neste estudo, projetamos um ensaio de reação em cadeia da polimerase multiplex (mPCR) baseado em DNA ribossomal (rDNA) para identificar os ácaros B. tropicalis, D. pteronyssinus e G. malaysiensis. Para isso, a região do espaçador transcrito interno 2 (ITS2), flanqueada por sequências parciais dos genes 5.8S e 28S, foi amplificada e sequenciada. As sequências obtidas foram alinhadas com sequências co-específicas disponíveis na base de dados Genbank visando o desenho de primers e estudos filogenéticos. Os resultados obtidos suportam que a região ITS2 apresenta uma boa resolução para identificação de espécies. Três pares de primers foram escolhidos para compor o mPCR, que foi utilizado para verificar a frequência dos ácaros estudados em vinte amostras de poeira domiciliar de residências na cidade de Salvador, nordeste do Brasil. Os dados mostraram que B. tropicalis foi o ácaro mais prevalente, encontrado em 95% das amostras, seguido por G. malaysiensis (70%) e D. pteronyssinus (60%), sendo que 55% das amostras abrigaram os três ácaros. Além disso, foi a primeira vez que G. malaysiensis foi identificado no Brasil e sua sequência ITS2 foi disponibilizada. O ensaio mPCR provou ser uma ferramenta rápida, confiável e simples para identificar esses ácaros e poderá ser aplicado em futuros estudos epidemiológicos ou diagnósticos, bem como para o controle de qualidade de produção de extratos de ácaros para serem usados em ensaios clínicos. |
id |
UFBA-2_ac53513e330495c280119562b21da9fa |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufba.br:ri/33502 |
network_acronym_str |
UFBA-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFBA |
repository_id_str |
1932 |
spelling |
Alves, Vitor dos SantosAlves, Vitor dos SantosPinheiro, Carina da SilvaNeves, Neuza Maria AlcantaraPortela, Ricardo Wagner DiasFigueiredo, Barbara de Castro Pimentel2021-05-27T15:39:04Z2021-05-272021-04-22http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/33502Os ácaros Blomia tropicalis e Dermatophagoides pteronyssinus desempenham um papel importante no desencadeamento de manifestações alérgicas. A identificação de ácaros é principalmente baseada na morfologia, uma técnica demorada e ambígua. O ácaro Glycycometus malaysiensis é alergênico e morfologicamente semelhante a B. tropicalis, o que torna crucial a identificação precisa dessas espécies. Neste estudo, projetamos um ensaio de reação em cadeia da polimerase multiplex (mPCR) baseado em DNA ribossomal (rDNA) para identificar os ácaros B. tropicalis, D. pteronyssinus e G. malaysiensis. Para isso, a região do espaçador transcrito interno 2 (ITS2), flanqueada por sequências parciais dos genes 5.8S e 28S, foi amplificada e sequenciada. As sequências obtidas foram alinhadas com sequências co-específicas disponíveis na base de dados Genbank visando o desenho de primers e estudos filogenéticos. Os resultados obtidos suportam que a região ITS2 apresenta uma boa resolução para identificação de espécies. Três pares de primers foram escolhidos para compor o mPCR, que foi utilizado para verificar a frequência dos ácaros estudados em vinte amostras de poeira domiciliar de residências na cidade de Salvador, nordeste do Brasil. Os dados mostraram que B. tropicalis foi o ácaro mais prevalente, encontrado em 95% das amostras, seguido por G. malaysiensis (70%) e D. pteronyssinus (60%), sendo que 55% das amostras abrigaram os três ácaros. Além disso, foi a primeira vez que G. malaysiensis foi identificado no Brasil e sua sequência ITS2 foi disponibilizada. O ensaio mPCR provou ser uma ferramenta rápida, confiável e simples para identificar esses ácaros e poderá ser aplicado em futuros estudos epidemiológicos ou diagnósticos, bem como para o controle de qualidade de produção de extratos de ácaros para serem usados em ensaios clínicos.Submitted by Vítor Alves (vitor.alves.10@hotmail.com) on 2021-05-14T02:34:57Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_VSA_Final.pdf: 1060184 bytes, checksum: ce59caa63c62dc79c1dc9af674ebf847 (MD5)Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2021-05-27T15:39:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_VSA_Final.pdf: 1060184 bytes, checksum: ce59caa63c62dc79c1dc9af674ebf847 (MD5)Made available in DSpace on 2021-05-27T15:39:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_VSA_Final.pdf: 1060184 bytes, checksum: ce59caa63c62dc79c1dc9af674ebf847 (MD5)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB) e Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).Biologia MolecularAlergiaMultiplex PCRIdentificação de espéciesBlomiaGlycycometusDermatophagoidesEnsaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientaisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis10000-01-01Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da SaúdePrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaUFBAbrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFBAinstname:Universidade Federal da Bahia (UFBA)instacron:UFBAORIGINALDissertação_VSA_Final.pdfDissertação_VSA_Final.pdfDissertação de mestrado contendo artigo a ser publicado.application/pdf1060184https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o_VSA_Final.pdfce59caa63c62dc79c1dc9af674ebf847MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1442https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/2/license.txt817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1aMD52TEXTDissertação_VSA_Final.pdf.txtDissertação_VSA_Final.pdf.txtExtracted texttext/plain97345https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_VSA_Final.pdf.txt58e49700965453ea0e6f77468e51bc18MD53ri/335022023-07-18 13:10:41.014oai:repositorio.ufba.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://192.188.11.11:8080/oai/requestopendoar:19322023-07-18T16:10:41Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
title |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
spellingShingle |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais Alves, Vitor dos Santos Biologia Molecular Alergia Multiplex PCR Identificação de espécies Blomia Glycycometus Dermatophagoides |
title_short |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
title_full |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
title_fullStr |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
title_full_unstemmed |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
title_sort |
Ensaio de multiplex PCR para identificação de ácaros em cultura e amostras ambientais |
author |
Alves, Vitor dos Santos |
author_facet |
Alves, Vitor dos Santos |
author_role |
author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Alves, Vitor dos Santos Alves, Vitor dos Santos |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Pinheiro, Carina da Silva |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Neves, Neuza Maria Alcantara |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Portela, Ricardo Wagner Dias Figueiredo, Barbara de Castro Pimentel |
contributor_str_mv |
Pinheiro, Carina da Silva Neves, Neuza Maria Alcantara Portela, Ricardo Wagner Dias Figueiredo, Barbara de Castro Pimentel |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
Biologia Molecular |
topic |
Biologia Molecular Alergia Multiplex PCR Identificação de espécies Blomia Glycycometus Dermatophagoides |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Alergia Multiplex PCR Identificação de espécies Blomia Glycycometus Dermatophagoides |
description |
Os ácaros Blomia tropicalis e Dermatophagoides pteronyssinus desempenham um papel importante no desencadeamento de manifestações alérgicas. A identificação de ácaros é principalmente baseada na morfologia, uma técnica demorada e ambígua. O ácaro Glycycometus malaysiensis é alergênico e morfologicamente semelhante a B. tropicalis, o que torna crucial a identificação precisa dessas espécies. Neste estudo, projetamos um ensaio de reação em cadeia da polimerase multiplex (mPCR) baseado em DNA ribossomal (rDNA) para identificar os ácaros B. tropicalis, D. pteronyssinus e G. malaysiensis. Para isso, a região do espaçador transcrito interno 2 (ITS2), flanqueada por sequências parciais dos genes 5.8S e 28S, foi amplificada e sequenciada. As sequências obtidas foram alinhadas com sequências co-específicas disponíveis na base de dados Genbank visando o desenho de primers e estudos filogenéticos. Os resultados obtidos suportam que a região ITS2 apresenta uma boa resolução para identificação de espécies. Três pares de primers foram escolhidos para compor o mPCR, que foi utilizado para verificar a frequência dos ácaros estudados em vinte amostras de poeira domiciliar de residências na cidade de Salvador, nordeste do Brasil. Os dados mostraram que B. tropicalis foi o ácaro mais prevalente, encontrado em 95% das amostras, seguido por G. malaysiensis (70%) e D. pteronyssinus (60%), sendo que 55% das amostras abrigaram os três ácaros. Além disso, foi a primeira vez que G. malaysiensis foi identificado no Brasil e sua sequência ITS2 foi disponibilizada. O ensaio mPCR provou ser uma ferramenta rápida, confiável e simples para identificar esses ácaros e poderá ser aplicado em futuros estudos epidemiológicos ou diagnósticos, bem como para o controle de qualidade de produção de extratos de ácaros para serem usados em ensaios clínicos. |
publishDate |
2021 |
dc.date.submitted.none.fl_str_mv |
2021-04-22 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2021-05-27T15:39:04Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2021-05-27 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/33502 |
url |
http://repositorio.ufba.br/ri/handle/ri/33502 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da Saúde |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFBA |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal da Bahia, Instituto de Ciências da Saúde |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFBA instname:Universidade Federal da Bahia (UFBA) instacron:UFBA |
instname_str |
Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
instacron_str |
UFBA |
institution |
UFBA |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFBA |
collection |
Repositório Institucional da UFBA |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o_VSA_Final.pdf https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/2/license.txt https://repositorio.ufba.br/bitstream/ri/33502/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_VSA_Final.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
ce59caa63c62dc79c1dc9af674ebf847 817035eff4c4c7dda1d546e170ee2a1a 58e49700965453ea0e6f77468e51bc18 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFBA - Universidade Federal da Bahia (UFBA) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1808459627604475904 |