Idade evolutiva e probabilidade de extinção

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Calderón del Cid, Carlos Roberto
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFBA
Texto Completo: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/38454
Resumo: Resolver se a idade das espécies está associada à probabilidade de extinção tem o potencial de ajudar nosso entendimento sobre as dinâmicas de extinção nos clados vivos ou extinctos. O estudo deste padrão é conhecido como extinção dependente da idade (ADE, siglas em inglês), e não há consenso teórico ou empírico sobre o sentido da relação. Nesta tese propomos, como primeiro capítulo, a teoria de substituição de clados (CRT, siglas em inglês) como uma estrutura teórica que considera aspectos ecológicos e evolutivos dos clados para gerar predições testáveis sobre o ADE. Durante o estudo de ADE percebemos que há uma diferença conceitual entre a idade definida pela paleontologia e pela neontologia. Além disso, esta última, já que é estimada por meio do comprimento dos ramos das filogenias, possui fontes de incerteza. Por consiguinte, como segundo capítulo, através de simulações, avaliamos as taxas de erro na estimação das idades filogenéticas associadas com modos de especiação e distintos cenários de extinção. Propomos também uma abordagem para corrigir as estimativas de idade sob a presuposição de uma especiação bifurcativa. Formalizamos o CRT com dois proposições. A primeira é efeito de incumbência por parte um clado antigo sobre o espaço de nicho, o que limita a diversificação e dominância dos clados novos. Devido à colonização e subsequente rápida diversificação do clado antigo sobre o espaço de nicho, particionando ele, nos hipotetizamos que essa trajetória de ocupação de nicho geraria uma tendência das espécies mais antigas a ocupar as posições de nicho mais centrais. Como terceiro capítulo, exploramos dita hipótese no contexto dos tetrápodes neotropicais. Encontramos, que para esses grupos, não há generalidade nesta relação, porém os grupos significativos, apoiaram nossa expectativa. A segunda proposição do CRT é uma mudança ecológica que afeta o fitness do clado antigo oferecendo uma oportunidade para o clado novo diversificar e virar dominante. A partir dessas duas proposições, nos hipotetizamos que o sentido do ADE estará definido pela mudança ecologica. Se esta não acontecer, o ADE será negativo, i.e., espécies mais antigas possuirão menor probabilidade de extinção. Se esta acontecer, o ADE será positivo, i.e., espécies mais novas possuirão menor probabilidade de extinção.
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Por consiguinte, como segundo capítulo, através de simulações, avaliamos as taxas de erro na estimação das idades filogenéticas associadas com modos de especiação e distintos cenários de extinção. Propomos também uma abordagem para corrigir as estimativas de idade sob a presuposição de uma especiação bifurcativa. Formalizamos o CRT com dois proposições. A primeira é efeito de incumbência por parte um clado antigo sobre o espaço de nicho, o que limita a diversificação e dominância dos clados novos. Devido à colonização e subsequente rápida diversificação do clado antigo sobre o espaço de nicho, particionando ele, nos hipotetizamos que essa trajetória de ocupação de nicho geraria uma tendência das espécies mais antigas a ocupar as posições de nicho mais centrais. Como terceiro capítulo, exploramos dita hipótese no contexto dos tetrápodes neotropicais. Encontramos, que para esses grupos, não há generalidade nesta relação, porém os grupos significativos, apoiaram nossa expectativa. A segunda proposição do CRT é uma mudança ecológica que afeta o fitness do clado antigo oferecendo uma oportunidade para o clado novo diversificar e virar dominante. A partir dessas duas proposições, nos hipotetizamos que o sentido do ADE estará definido pela mudança ecologica. Se esta não acontecer, o ADE será negativo, i.e., espécies mais antigas possuirão menor probabilidade de extinção. Se esta acontecer, o ADE será positivo, i.e., espécies mais novas possuirão menor probabilidade de extinção.Resolving whether species age is associated with extinction probability can help us understand the extinction dynamics of living and extinct clades. This pattern is called Age-dependent extinction (ADE), and there is no theoretical nor empirical consensus about its direction. In this thesis, as the first chapter, we propose the Clade Replacement Theory (CRT) as a framework that considers clades' evolutionary and ecological aspects for generating testable predictions on ADE patterns. During the ADE study, we realized a conceptual difference in species age definition between paleontology and neontology. Besides, because the branch lengths of phylogenies estimate it, the latter has substantial uncertainty sources. Therefore, in the second chapter, we evaluated the error rates of phylogenetic ages associated with speciation modes and different extinction scenarios through simulations. Complementarily, we proposed an approach to correct age estimates under the assumption of bifurcating speciation. We formalized CRT with two propositions. The first one is incumbency effects by the old clade over the niche space, limiting the diversification and dominance of new clades. Due to the colonization and subsequent rapid diversification of the old clade, we hypothesize that this niche occupation trajectory would generate a pattern of older species occupying central niche positions. In the third chapter, we explore this hypothesis in the context of Neotropical tetrapods. We found no generality in the relationship between species age and niche position for these groups. However, the relationships that were significant supported our expectations. The CRT's second proposition is an ecological shift that would select against the old clade, opening up an opportunity for the new clade to diversify and rise to dominance. From CRT's propositions, we developed the prediction that the ADE scenario would be defined by whether an ecological shift happens or not. If it does not happen, we expect a negative ADE; i.e., older species would be less extinction prone. On the other hand, if it does happen, we expect a positive ADE; i.e., younger species would be less extinction prone.Submitted by Carlos Calderón (caldecid@gmail.com) on 2023-11-13T16:29:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 701 bytes, checksum: 42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708c (MD5) tese_Calderon_2.pdf: 3748987 bytes, checksum: 42c9647491acbef2b83169f271d190f3 (MD5)Approved for entry into archive by Setor de Periódicos (per_macedocosta@ufba.br) on 2023-11-14T17:44:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 tese_Calderon_2.pdf: 3748987 bytes, checksum: 42c9647491acbef2b83169f271d190f3 (MD5) license_rdf: 701 bytes, checksum: 42fd4ad1e89814f5e4a476b409eb708c (MD5)Made available in DSpace on 2023-11-14T17:44:47Z (GMT). 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