Epidemiologia molecular dos vírus da dengue em uma cidade de médio porte do estado de São Paulo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Carmo, Andréia Moreira dos Santos
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFABC
Texto Completo: http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537
Resumo: Orientadora: Profa. Dra. Márcia Aparecida Sperança
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spelling Epidemiologia molecular dos vírus da dengue em uma cidade de médio porte do estado de São PauloDENGUEEPIDEMIOLOGIA MOLECULARSEVERE DENGUEMOLECULAR EPIDEMIOLOGYPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOSSISTEMAS - UFABCOrientadora: Profa. Dra. Márcia Aparecida SperançaTese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2017.A dengue, causada por quatro diferentes sorotipos do vírus (DENV1-4), é a arbovirose de maior prevalência em humanos no mundo. Estudos moleculares são necessários para melhor entendimento de doenças causadas por diferentes sorotipos e variantes genéticas. Em relação á sua origem e história evolucionária, análises filogenéticas e epidemiológicas sugerem que genótipos mais virulentos estão substituindo os de menor virulência. Este trabalho teve como objetivo a caracterização da dinâmica de transmissão e epidemiologia molecular dos DENV circulantes na cidade de médio porte do Estado de São Paulo, Marília, com 233.639 habitantes, durante uma epidemia de dengue ocorrida no ano de 2007. Para tanto foram obtidas amostras de pacientes com diagnóstico clínico e epidemiológico (sem confirmação laboratorial) durante ocorrência de epidemia de dengue. O estudo comparativo de características hematológicas e demográficas dos pacientes com a presença de antígeno NS1 de DENV nas amostras revelou associação significante com leucopenia e plaquetopenia (medianas: DENV+= 3.715 células/mL e DENV- = 6.760 células/mL; e medianas: DENV+ = 134.896 células/mL e DENV- = 223.872 células/mL, respectivamente), e aumento de linfócitos atípicos. Esse padrão hematológico foi mantido durante o longo período da epidemia, permitindo que, com a determinação do padrão conservado nas primeiras fases de uma epidemia, este possa ser usado para implementar medidas de diagnóstico de novos casos, bem como no controle e tratamento dos doentes em todo o restante do período. A detecção e identificação do sorotipo viral, por PCR e Nested-PCR, respectivamente, utilizando como alvo o gene que codifica a junção das proteínas estruturais do capsídeo e pré-membrana (C/prM), confirmou a co-circulação de DENV1 (33%) e DENV3 (67%) em 2007. A partir das sequências obtidas da junção C/prM dos DENV1 e DENV3 dessas amostras, foi feita a reconstrução filogenética. Os resultados indicaram que a população de DENV1 provavelmente se originou da região norte do Brasil, por apresentar pouca variabilidade genética e alta similaridade com amostras de DENV1 de pacientes de Belém do Pará isoladas no mesmo ano. A população de DENV3 apresentou variabilidade genética, provavelmente, devido à microevolução na própria região, visto que as amostras de Marília-SP apresentaram alta similaridade com amostras de vírus isoladas de pacientes da Venezuela, em 2001. Os dois sorotipos mostraram padrões hematológicos distintos, nos quais, com o aumento de linfócitos atípicos houve uma significante maior leucopenia na população de DENV3 e uma tendência a maior diminuição de plaquetas em DENV1. Os estudos realizados demonstram que a dengue é uma doença com características regionais específicas. Portanto, a implementação das atividades de manejo das epidemias dependem da caracterização das variantes genéticas dos DENV e sua relação com a população acometida.Dengue, caused by four different serotypes of the virus (DENV1-4), is the most prevalent arbovirose in humans in the world. Molecular studies are needed to better understand diseases caused by different serotypes and genetic variants. In relation to its origin and evolutionary history, phylogenetic and epidemiological analyzes suggest that more virulent genotypes are replacing those of less virulence. This work aimed to characterize the transmission dynamics and molecular epidemiology of DENV circulating in the medium-sized city of the State of São Paulo, Marília, with 233,639 inhabitants, during a dengue epidemic occurred in 2007. For this purpose, samples were obtained of patients with clinical and epidemiological diagnosis (without laboratory confirmation) during the occurrence of a dengue epidemic. The comparative study of the hematological and demographic characteristics of patients with the presence of DENV NS1 antigen in the samples revealed a significant association with leukopenia and thrombocytopenia (median: DENV + = 3,715 cells / mL and DENV- = 6,760 cells / mL; 134,896 cells / mL and DENV- = 223,872 cells / mL, respectively), and increase of atypical lymphocytes. This hematological pattern was maintained during the long period of the epidemic, allowing the determination of the pattern preserved in the first stages of an epidemic, to be used to implement measures for the diagnosis of new cases, as well as for the control and treatment of patients in the remainder of the period. Detection and identification of the viral serotype by PCR and Nested-PCR, respectively, targeting the gene coding for the junction of the capsid and premembrane (C / prM) structural proteins, confirmed the co-circulation of DENV1 (33 %) and DENV3 (67%) in 2007. From the sequences obtained from the C / prM junction of the DENV1 and DENV3 of these samples, the phylogenetic reconstruction was performed. The results indicated that the DENV1 population probably originated from the northern region of Brazil, as it presents little genetic variability and high similarity with DENV1 samples from patients from Belém do Pará isolated in the same year. The DENV3 population showed genetic variability, probably due to the microevolution in the region itself, since the Marília-SP samples presented high similarity with virus samples isolated from patients from Venezuela in 2001. The two serotypes showed different hematological patterns in the which, with the increase of atypical lymphocytes, there was a significant greater leucopenia in the DENV3 population and a tendency to a greater decrease of platelets in DENV1. Preliminary data from another epidemic were obtained in 2015, from which we tested 100 positive samples to date, with 87% belonging to serotype 1 by means of molecular typing using the gene coding for the C / prM junction. Studies show that dengue is a disease with specific regional characteristics. Therefore, the the implementation of epidemic management activities depend on the characterization of genetic variants of DENV and its relationship with the affected population.Sperança, Márcia AparecidaSasaki, Sergio DaishiPuzer, LucianoTanaka, HarkiGregori, FábioCarmo, Andréia Moreira dos Santos2017info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf144 f. : il.http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537&midiaext=74703http://biblioteca.ufabc.edu.br/index.php?codigo_sophia=106537&midiaext=74704Cover: http://biblioteca.ufabc.edu.br/php/capa.php?obra=106537porreponame:Repositório Institucional da UFABCinstname:Universidade Federal do ABC (UFABC)instacron:UFABCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2022-03-18T15:59:20Zoai:BDTD:106537Repositório InstitucionalPUBhttp://www.biblioteca.ufabc.edu.br/oai/oai.phpopendoar:2022-03-18T15:59:20Repositório Institucional da UFABC - Universidade Federal do ABC (UFABC)false
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