Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rocha, Rafael dos Santos
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
Texto Completo: http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/20014
Resumo: ROCHA, Rafael dos Santos. Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas. 2016. 105 f. Tese (Doutorado em Engenharia de Pesca)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016.
id UFC-7_4ee703f532ee6c7ef4a2c64e58cb5e64
oai_identifier_str oai:repositorio.ufc.br:riufc/20014
network_acronym_str UFC-7
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository_id_str
spelling Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinasPolyphasic characterization of heterotrophic bacteria from shrimp farm environments to tetracyclinesCarciniculturaAntibacterianosVibrionaceaeShimp farmAntibacterial agentsVibrionaceaeROCHA, Rafael dos Santos. Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas. 2016. 105 f. Tese (Doutorado em Engenharia de Pesca)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016.Antimicrobial agents of tetracycline class has been extensively used in aquaculture for disease control and growth promotion. Thus, the aim of this study was to evaluate the polyphase profile of the bacterial community in shrimp farming environment front antimicrobial classes of tetracyclines, focusing on Vibrio genus. Water and sediment samples were collected four (4) shrimp farms: two (2) in the state of Ceará and two (2) in the state of Rio Grande do Norte, of points: estuary, supply channel, pond and drainage channel. Cultivable heterotrophic bacteria (CHB), with resistance to tetracycline (CHB+TET) and oxytetracycline (CHB+OTC), total Vibrio, positive sucrose Vibrio and sucrose negative Vibrio were surveyed by Standard Plate Count method (SPC). The strains isolated from CHB, CHB+TET, CHB+OTC and Vibrio underwent phenotypic identification. The phenotypic profile of antimicrobial susceptibility of strains of Vibrio and other BHC was compared between the disk diffusion techniques and macrodilution by determining the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC) for tetracycline and oxytetracycline antimicrobials. Resistance genes tet(M), tet(S) otr(A) and otr(B) were investigated in strains characterized as phenotypically resistant. Diversity of heterotrophic bacteria is influenced by wet and rainy seasons and also by the different collection points within the shrimp farms. Overall, the CHB, CHB+TET and CHB+OTC and Vibrio counts differ between the collection seasons, with higher measurements during the rainy season to the points of pond and drainage channel. 146 strains of CHB, 57 of CHB+TET and 45 of CHB+OTC were isolated, of which the most representative genera were Vibrio and Enterobacter. A total of 100 strains of Vibrio were isolated, which V. coralliilyticus was the most representative species. Antimicrobial profile of Vibrio and other CHB differed between disk-diffusion and macrodilution techniques, being the macrodilution the most efficient in the characterization of resistance among isolates. All strains of Vibrio and other CHB, phenotypically resistant, presented the tet(M) gene as a determinant of resistance determinat, but tet(S) otr(A) and otr(B) genes were not observed. Thus, it proves that Vibrio genus is most abundant among herotrotrophic bacteria with resistance to tetracyclines, with the bacterial diversity strongly influenced by seasons.Antimicrobianos da classe das tetraciclinas têm sido extensivamente usados em aquicultura para o controle de doenças e como promotores de crescimento. Dessa forma, foi traçado como objetivo geral avaliar o perfil polifásico da comunidade bacteriana de ambiente de criação de camarão frente aos antimicrobianos das classes das tetraciclinas, com enfoque no gênero Vibrio. Amostras de água e sedimento foram coletadas de quatro (4) fazendas de carcinicultura: duas (2) no estado do Ceará e duas (2) no estado do Rio Grande do Norte, dos pontos: estuário, canal de abastecimento, viveiro e canal de drenagem. Foram pesquisadas bactérias heterotróficas cultiváveis (BHC), com resistência à tetraciclina (BHC+TET) e oxitetraciclina (BHC+OTC), Vibrio total, sacarose positivos e negativos pelo método de Contagem Padrão em Placas (CPP). As cepas isoladas de BHC, BHC+TET, BHC+OTC e Vibrio foram submetidas à identificação fenotípica. O perfil fenotípico de susceptibilidade antimicrobiana das cepas de Vibrio e demais BHC foi comparado entre as técnicas de disco-difusão e macrodiluição, pela determinação da Concentração Inibitória Mínima (CIM) e Concentração Bactericida Mínima (CBM) para os antimicrobianos tetraciclina e oxitetraciclina. Os genes de resistência tet(M), tet(S), otr(A) e otr(B) foram pesquisados nas cepas fenotipicamente caracterizadas como resistentes. A diversidade de bactérias heterotróficas foi influenciada pelos períodos de estio e chuvoso e também pelos diferentes pontos de coleta dentro das fazendas de carcinicultura. No geral, as contagens de BHC, BHC+TET e BHC+OTC e Vibrio e demais BHC diferiram entre os períodos de coleta, com quantificações superiores no período chuvoso para os pontos de coleta viveiro e canal de drenagem. Foram isoladas 146 cepas de BHC, 57 de BHC+TET, 25 de BHC+OTC, das quais os gêneros mais representativos foram Vibrio e Enterobacter. Foi possível o isolamento de 100 cepas de Vibrio, das quais V. coralliilyticus foi a espécie mais representativa. O perfil antimicrobiano diferiu entre as cepas de Vibrio e demais BHC entre as técnicas de disco-difusão e macrodiluição, sendo a de macrodiluição a mais eficiente na caracterização de resistência dentre os isolados. Todas as cepas de Vibrio e demais BHC, fenotipicamente resistentes, apresentaram o gene tet(M) como determinante de resistência, no entanto os genes tet(S), otr(A) e otr(B) não foram verificados. Com isso, comprovou-se que Vibrio é gênero mais abundante dentre as bactérias heterotróficas com resistência às tetraciclinas, estando a diversidade bacteriana fortemente influenciada pelos períodos do ano.Vieira, Regine Helena Silva dos FernandesVieira, Regine Helena Silva dos FernandesRocha, Rafael dos Santos2016-10-05T23:19:54Z2016-10-05T23:19:54Z2016info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfROCHA, R. S. (2016)http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/20014porreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)instacron:UFCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2018-06-04T16:16:57Zoai:repositorio.ufc.br:riufc/20014Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufc.br/ri-oai/requestbu@ufc.br || repositorio@ufc.bropendoar:2018-06-04T16:16:57Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
Polyphasic characterization of heterotrophic bacteria from shrimp farm environments to tetracyclines
title Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
spellingShingle Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
Rocha, Rafael dos Santos
Carcinicultura
Antibacterianos
Vibrionaceae
Shimp farm
Antibacterial agents
Vibrionaceae
title_short Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
title_full Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
title_fullStr Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
title_full_unstemmed Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
title_sort Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas
author Rocha, Rafael dos Santos
author_facet Rocha, Rafael dos Santos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Vieira, Regine Helena Silva dos Fernandes
Vieira, Regine Helena Silva dos Fernandes
dc.contributor.author.fl_str_mv Rocha, Rafael dos Santos
dc.subject.por.fl_str_mv Carcinicultura
Antibacterianos
Vibrionaceae
Shimp farm
Antibacterial agents
Vibrionaceae
topic Carcinicultura
Antibacterianos
Vibrionaceae
Shimp farm
Antibacterial agents
Vibrionaceae
description ROCHA, Rafael dos Santos. Caracterização polifásica da comunidade bacteriana heterotrófica de ambiente de carcinicultura frente às tetraciclinas. 2016. 105 f. Tese (Doutorado em Engenharia de Pesca)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-10-05T23:19:54Z
2016-10-05T23:19:54Z
2016
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ROCHA, R. S. (2016)
http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/20014
identifier_str_mv ROCHA, R. S. (2016)
url http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/20014
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
instname:Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron:UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará (UFC)
instacron_str UFC
institution UFC
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal do Ceará (UFC) - Universidade Federal do Ceará (UFC)
repository.mail.fl_str_mv bu@ufc.br || repositorio@ufc.br
_version_ 1823806652603695104

Registros relacionados