Análise in silico do gene LYS2 para identificação de fusarium Oxysporum f. sp. rapae.

• Autor(a) principal: SILVA, Pedro Victor da.
• Data de Publicação: 2024
• Outros Autores: NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do.
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
• Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36188
• topic: Genética Vegetal.; Batata doce; Primers; Kit diagnóstico; Gene LYS2; Fusarium Oxysporum f. sp. rapae; Sweet potato; Diagnostic kit; LYS2 gene; Fusarium Oxysporum f. sp. rapae

A batata-doce (Ipomoea batatas (L) Lam.) é uma hortaliça de importância nacional, uma vez que é a quarta hortaliça mais consumida no Brasil com grande adaptação aos diversos sistemas de climas e solos, possuindo baixo custo de produção. Nacionalmente, as regiões Sul e Nordeste destacam-se por serem responsáveis por grande parte da produção do país. Contudo, perdas signi{cativas na produção têm sido observadas decorrente da as infeções de patógenos fúngicos, em destaque a espécie Fusarium Oxysporum. Dessa forma,o presente trabalho teve por objetivo fazer um estudo in sílico do gene LYS2 Fusarium Oxysporum f. sp. rapae com o intuito de obter possível oligonucleotídeos especi{co para kit de diagnóstico molecular. As buscas das sequências gênicas foram realizadas utilizando a plataforma da plataforma do NCBI e ferramenta blast foram selecionadas 15 sequencias para em seguida gerar a árvore {logenética com as sequencias selecionadas e depois desenhar os marcadores para qPCR. Os resultados obtidos da arvore {logenética, com o método de inferência bootstrap, apresentaram bons resultados de similaridades entre as espécies. Os oligonucleotídeos desenhados com a plataforma primer3Plus demonstraram serem bons marcadores para diagnosticar o F. oxysporum na batata doce, sendo um protocolo para técnica qPCR.