Análise in silico das proteínas referentes ao estresse salino em espécies do gênero do algodoeiro (Gossypium spp.)

• Autor(a) principal: SANTOS, Débora Souza dos.
• Data de Publicação: 2024
• Outros Autores: NASCIMENTO, Ana Verônica Silva do., JIMENEZ, Horace José.
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCG
• Texto Completo: http://dspace.sti.ufcg.edu.br:8080/jspui/handle/riufcg/36178
• topic: Genética Vegetal.; Cotonicultura; Estresse salino - algodoeiro; Gossypium spp.; Análise in silico - proteínas; Salinidade - algodoeiro; Melhoramento genético vegetal; Algodoeiro - melhoramento genético; Bioinformática; Tolerância à salinidade - algodoeiro; Análise taxonômica - proteínas de algodoeiro; Análise físico-química - proteínas de algodoeiro; Cotton farming; Salt stress - cotton; Physicochemical analysis - cotton proteins; In silico analysis - proteins; Salinity - cotton; Plant genetic improvement; Cotton - genetic improvement; Bioinformatics; Salinity tolerance - cotton; Taxonomic analysis - cotton proteins

A cotonicultura é uma plantação muito importante no Brasil, detentora do quinto lugar de maior produtora mundial. Nacionalmente, o plantio de algodão herbáceo concentra-se no centro-oeste e nordeste, onde é majoritariamente cultivado por irrigação, seguido da técnica de sequeiro sem rega. Os fatores climáticos, alta evaporação e baixa pluviosidade, qualidade da água de irrigação, manejo, características do solo e espécie, são determinantes para existência e agravamento do estresse salino no plantio, sendo um dos mais importantes estresses abióticos, juntamente com o hídrico, a afetar o crescimento, produtividade e qualidade da fibra. Para isto, o melhoramento genético vegetal é a alternativa mais viável para redução das consequências geradas na planta pelo excesso de sais, como uso de produtos químicos na lavoura e perda de quantitativa e econômica da produção. Com desenho de primers in silico que reconhecerão os domínios conservados no gene relacionados com a tolerância e/ou resistência, viabilizando a manipulação genética para criação de cultivares mais adaptadas a este fator. Assim, a partir da bioinformática, o presente trabalho, analisou taxonomicamente e físico-quimicamente três proteínas de interesse selecionadas, segundo triagem prévia, realizando desenho dos primers, validação destes e seleção dos dez primers mais estáveis, seis das proteínas e quatro degenerados, os quais são seguros, específicos e estão de acordo com padrões qualitativos de referência. De extrema relevância para área experimental, o conhecimento do perfil, ação das proteínas e desenhos dos marcadores moleculares realizados, o caminho para se minimizar os problemas gerados pela salinidade ou cultivo é palpável.