MÃtodos computacionais no estudo de fÃrmacos
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC |
Texto Completo: | http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=6508 |
Resumo: | Nesse trabalho realizamos cÃlculos ab initio em dois fÃrmacos, benzonidazol e mebendazol, usados no combate de infecÃÃes por parasitas. Os cÃlculos foram divididos em obtenÃÃo dos espectros vibracionais Raman e infravermelho, dinÃmica molecular e cÃlculo da distribuiÃÃo da energia potencial. Desenvolvemos o software PEDCALC para calcular a distribuiÃÃo da energia potencial e classificar os modos de vibraÃÃo. A classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo à realizada pela comparaÃÃo dos espectros calculados com espectros experimentais e a distribuiÃÃo da energia potencial. Mostramos que o software PEDCALC pode produzir resultados exatos da distribuiÃÃo da energia potencial, e, à ferramenta essencial na classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo de qualquer molÃcula. Realizamos cÃlculo de dinÃmica molecular no dÃmero de mebendazol para mostrar a troca de Ãtomos de hidrogÃnio entre seus monÃmeros, observamos assim a dinÃmica do tautomerismo dessa molÃcula. |
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info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisMÃtodos computacionais no estudo de fÃrmacosComputational methods in the study of drugs2011-09-16Alejandro Pedro Ayala01222997606http://lattes.cnpq.br/0589484713269268 80058981349Daniel de Matos AlvesUniversidade Federal do CearÃPrograma de PÃs-GraduaÃÃo em FÃsicaUFCBRespectroscopia Raman espectroscopia infravermelho drogasRaman spectroscopy infrared spectroscopy drugsFISICA DA MATERIA CONDENSADANesse trabalho realizamos cÃlculos ab initio em dois fÃrmacos, benzonidazol e mebendazol, usados no combate de infecÃÃes por parasitas. Os cÃlculos foram divididos em obtenÃÃo dos espectros vibracionais Raman e infravermelho, dinÃmica molecular e cÃlculo da distribuiÃÃo da energia potencial. Desenvolvemos o software PEDCALC para calcular a distribuiÃÃo da energia potencial e classificar os modos de vibraÃÃo. A classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo à realizada pela comparaÃÃo dos espectros calculados com espectros experimentais e a distribuiÃÃo da energia potencial. Mostramos que o software PEDCALC pode produzir resultados exatos da distribuiÃÃo da energia potencial, e, à ferramenta essencial na classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo de qualquer molÃcula. Realizamos cÃlculo de dinÃmica molecular no dÃmero de mebendazol para mostrar a troca de Ãtomos de hidrogÃnio entre seus monÃmeros, observamos assim a dinÃmica do tautomerismo dessa molÃcula.In this work we performed ab initio calculations on two drugs, benzonidazole and mebendazole, used on the treatment of parasitic infections. The calculations were divided into obtaining the vibrational modes Raman and infrared spectra, molecular dynamics and calculation of the potential energy distribution. We developed the software PEDCALC to calculate the potential energy distribution and classify the vibrational modes. The classification of the vibrational modes is done by comparing the calculated spectra with experimental spectra and the potential energy distribution. We showed that software PEDCALC can produce accurate results of the potential energy distribution, and it is essential tool in the classification of vibrational modes of any molecule. We performed molecular dynamics calculations in the dimer of mebendazole to show the exchange of hydrogen atoms between its monomers, so we observed the dynamics of the tautomerism of this molecule.Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgicohttp://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=6508application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCinstname:Universidade Federal do Cearáinstacron:UFC2019-01-21T11:19:46Zmail@mail.com - |
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In this work we performed ab initio calculations on two drugs, benzonidazole and mebendazole, used on the treatment of parasitic infections. The calculations were divided into obtaining the vibrational modes Raman and infrared spectra, molecular dynamics and calculation of the potential energy distribution. We developed the software PEDCALC to calculate the potential energy distribution and classify the vibrational modes. The classification of the vibrational modes is done by comparing the calculated spectra with experimental spectra and the potential energy distribution. We showed that software PEDCALC can produce accurate results of the potential energy distribution, and it is essential tool in the classification of vibrational modes of any molecule. We performed molecular dynamics calculations in the dimer of mebendazole to show the exchange of hydrogen atoms between its monomers, so we observed the dynamics of the tautomerism of this molecule. |
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Nesse trabalho realizamos cÃlculos ab initio em dois fÃrmacos, benzonidazol e mebendazol, usados no combate de infecÃÃes por parasitas. Os cÃlculos foram divididos em obtenÃÃo dos espectros vibracionais Raman e infravermelho, dinÃmica molecular e cÃlculo da distribuiÃÃo da energia potencial. Desenvolvemos o software PEDCALC para calcular a distribuiÃÃo da energia potencial e classificar os modos de vibraÃÃo. A classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo à realizada pela comparaÃÃo dos espectros calculados com espectros experimentais e a distribuiÃÃo da energia potencial. Mostramos que o software PEDCALC pode produzir resultados exatos da distribuiÃÃo da energia potencial, e, à ferramenta essencial na classificaÃÃo dos modos de vibraÃÃo de qualquer molÃcula. Realizamos cÃlculo de dinÃmica molecular no dÃmero de mebendazol para mostrar a troca de Ãtomos de hidrogÃnio entre seus monÃmeros, observamos assim a dinÃmica do tautomerismo dessa molÃcula. |
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