Análise filogenética de heteroconcha (Mollusca: Bivalvia) a partir do genoma mitocondrial
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2024 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
Texto Completo: | http://app.uff.br/riuff/handle/1/32234 |
Resumo: | A classe Bivalvia é uma das mais diversas do filo Mollusca, atrás somente de Gastropoda, e possui grande importância econômica e ecológica. A infraclasse Heteroconchia possui organismos tanto marinhos quanto de águas dulcícolas. Assim como boa parte da classe, são em maioria sésseis quando adultos. Por conta da sua alta diversidade é um clado com algumas questões filogenéticas dúbias. Atualmente, muitos estudos de filogenia têm sido realizados a partir do genoma mitocondrial, que possui uma evolução rápida, e mesmo assim os arranjos gênicos muitas vezes permanecem inalterados, o que pode ser uma fonte de informações filogenias relevantes. O trabalho teve como objetivo analisar e inferir as relações filogenéticas dentro de Heteroconchia. O estudo filogenético foi realizado a partir de dados coletados no Genbank (NCBI) utilizando análise de máxima verossimilhança e inferência bayesiana para as sequências de gene mitocondriais codificantes de proteínas (OXPHOS), tanto nucleotídeos quanto aminoácidos. Nas análises dentre as quatro árvores construídas a partir dos dados, tiveram entre si algumas topologias distintas, porém muitas condizentes com trabalhos realizados para Heteroconchia. Os métodos escolhidos obtiveram algumas divergências dentre as quais, o resultado pode ser por conta dos seus tipos de critérios e algoritmos. |
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Análise filogenética de heteroconcha (Mollusca: Bivalvia) a partir do genoma mitocondrialFilogenéticaGenoma mitocondrialEvolução molecularMoluscosBivalveFilogeniaGenomaMitocôndriaPhylogeneticsMitochondrial genomeMolecular evolutionA classe Bivalvia é uma das mais diversas do filo Mollusca, atrás somente de Gastropoda, e possui grande importância econômica e ecológica. A infraclasse Heteroconchia possui organismos tanto marinhos quanto de águas dulcícolas. Assim como boa parte da classe, são em maioria sésseis quando adultos. Por conta da sua alta diversidade é um clado com algumas questões filogenéticas dúbias. Atualmente, muitos estudos de filogenia têm sido realizados a partir do genoma mitocondrial, que possui uma evolução rápida, e mesmo assim os arranjos gênicos muitas vezes permanecem inalterados, o que pode ser uma fonte de informações filogenias relevantes. O trabalho teve como objetivo analisar e inferir as relações filogenéticas dentro de Heteroconchia. O estudo filogenético foi realizado a partir de dados coletados no Genbank (NCBI) utilizando análise de máxima verossimilhança e inferência bayesiana para as sequências de gene mitocondriais codificantes de proteínas (OXPHOS), tanto nucleotídeos quanto aminoácidos. Nas análises dentre as quatro árvores construídas a partir dos dados, tiveram entre si algumas topologias distintas, porém muitas condizentes com trabalhos realizados para Heteroconchia. Os métodos escolhidos obtiveram algumas divergências dentre as quais, o resultado pode ser por conta dos seus tipos de critérios e algoritmos.The Bivalvia class is one of the most diverse of the Mollusca phylum, second only to Gastropoda, and has great economic and ecological importance. The Heteroconchia infraclass has both marine and freshwater organisms. Like most of the class, they are mostly sessile as adults. Due to its high diversity, it is a clade with some dubious phylogenetic issues. Currently, many phylogeny studies have been carried out from the mitochondrial genome, which has a rapid evolution, and even so the gene arrangements often remain unchanged, which can be a source of relevant phylogenetic information. The work aimed to analyze and infer the phylogenetic relationships within Heteroconchia. The phylogenetic study was performed from data collected at Genbank (NCBI) using maximum likelihood analysis and Bayesian inference for the mitochondrial gene sequences encoding proteins (OXPHOS), both nucleotides and amino acids. In the analyzes among the four trees built from the data, they had some distinct topologies, but many consistent with works carried out for Heteroconchia. The chosen methods had some divergences among which, the result may be due to their types of criteria and algorithms.45 f.Seixas, Victor CorrêaCosta, Caroline Leonor Ambrózio da2024-02-07T15:12:22Z2024-02-07T15:12:22Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfCOSTA, Caroline Leonor Ambrózio da. Análise filogenética de heteroconcha (Mollusca: Bivalvia) a partir do genoma mitocondrial. 2022. 45 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biologia, Universidade Federal Fluminense, Niterói, 2022.http://app.uff.br/riuff/handle/1/32234CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2024-02-07T15:12:26Zoai:app.uff.br:1/32234Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-02-07T15:12:26Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
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