Análise da interação entre o inibidor DM43 e a metaloendopeptidase de veneno de serpente BAP1
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2024 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) |
Texto Completo: | http://app.uff.br/riuff/handle/1/32505 |
Resumo: | O envenenamento por serpentes é uma condição de saúde negligenciada que apresenta altas taxas de mortalidade e morbidade. A administração do soro antiofídico, quando feita rapidamente, consegue neutralizar os efeitos sistêmicos, mas os efeitos locais são parcialmente neutralizados, podendo levar à amputação do membro afetado. Logo, novas abordagens terapêuticas são necessárias para reduzirmos os elevados índices de morbidade associados aos acidentes ofídicos e o estudo dos inibidores naturais de venenos de serpentes apresenta-se promissor para o desenvolvimento de fármacos complementares à soroterapia. Neste trabalho, analisamos a interação entre a proteína anti-hemorrágica DM43 isolada do soro do gambá Didelphis aurita e a metaloendopeptidase BaP1, utilizando duas abordagens de cross-linking (BS3 e XPlex) associadas à espectrometria de massas de alta resolução. Através da análise dos intra-links de DM43, foi possível inferir que o posicionamento espacial relativo dos domínios do inibidor DM43 proposto pelo modelo do AlphaFold não corresponde ao observado em solução. Por outro lado, a modelagem dos domínios individuais do inibidor se mostrou coerente com os dados experimentais coletados. Quanto à interação entre as proteínas, a análise do padrão bidimensional dos links inter-proteínas determinados experimentalmente indicou que a interação da DM43 com a BaP1 envolve principalmente os domínios 1 e 3 do inibidor. O entendimento estrutural da inibição de metaloendopeptidases pela DM43 pode levar ao desenvolvimento racional de peptídeos inibitórios com alta afinidade por metaloendopeptidases de venenos de serpentes. |
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Análise da interação entre o inibidor DM43 e a metaloendopeptidase de veneno de serpente BAP1Veneno de Serpente; Metaloendopeptidase; Cross-linking; Espectrometria de massas de alta resoluçãoAnimal venenoso, Cobra, Enzima, Espectrometria de massaSnake venoms; Metalloendopeptidases; Cross-linking; High-resolution mass spectrometryO envenenamento por serpentes é uma condição de saúde negligenciada que apresenta altas taxas de mortalidade e morbidade. A administração do soro antiofídico, quando feita rapidamente, consegue neutralizar os efeitos sistêmicos, mas os efeitos locais são parcialmente neutralizados, podendo levar à amputação do membro afetado. Logo, novas abordagens terapêuticas são necessárias para reduzirmos os elevados índices de morbidade associados aos acidentes ofídicos e o estudo dos inibidores naturais de venenos de serpentes apresenta-se promissor para o desenvolvimento de fármacos complementares à soroterapia. Neste trabalho, analisamos a interação entre a proteína anti-hemorrágica DM43 isolada do soro do gambá Didelphis aurita e a metaloendopeptidase BaP1, utilizando duas abordagens de cross-linking (BS3 e XPlex) associadas à espectrometria de massas de alta resolução. Através da análise dos intra-links de DM43, foi possível inferir que o posicionamento espacial relativo dos domínios do inibidor DM43 proposto pelo modelo do AlphaFold não corresponde ao observado em solução. Por outro lado, a modelagem dos domínios individuais do inibidor se mostrou coerente com os dados experimentais coletados. Quanto à interação entre as proteínas, a análise do padrão bidimensional dos links inter-proteínas determinados experimentalmente indicou que a interação da DM43 com a BaP1 envolve principalmente os domínios 1 e 3 do inibidor. O entendimento estrutural da inibição de metaloendopeptidases pela DM43 pode levar ao desenvolvimento racional de peptídeos inibitórios com alta afinidade por metaloendopeptidases de venenos de serpentes.Snake envenomation is a neglected health condition with high mortality and morbidity rates. The administration of antivenom, when done quickly, can neutralize the systemic effects, but the local effects are only partially neutralized and may lead to amputation of the affected limb. Therefore, new therapeutic approaches are needed to reduce the high rates of morbidity associated with snakebites. The study of natural inhibitors of snake venoms is promising for developing complementary drugs to serum therapy. In this work, we analyzed the interaction between the antihemorrhagic protein DM43 isolated from the serum of the opossum Didelphis aurita and the metalloendopeptidase BaP1, using two cross-linking approaches (BS3 and XPlex) associated with high-resolution mass spectrometry. Through the analysis of intra-DM43 links, it was possible to infer that the relative spatial positioning of the domains of the DM43 inhibitor proposed by the AlphaFold model does not correspond to that observed in the solution. On the other hand, the modeling of the individual domains of the inhibitor proved to be consistent with the experimental data collected. Regarding the interaction between both proteins, the two-dimensional pattern of the experimentally determined inter-protein links indicated that DM43 binds to BaP1 mainly through its first and third domains. Understanding the structure-function relationship of the complex DM43-BaP1 may lead to the rational development of inhibitory peptides with a high affinity for snake venom.47 p.Ribeiro, Manuel Gustavo LeitãoFerreira, Ana Gisele da Costa NevesSoares, Barbara da SilvaFuly, André LopesNogueira, Fábio César SousaCabral, Luiz MorsPinho, Yago Inocencio Vieira de2024-02-29T18:16:26Z2024-02-29T18:16:26Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfPINHO, Yago Inocencio Vieira de. Análise da interação entre o inibidor DM43 e a metaloendopeptidase de veneno de serpente BAP1. 2022. 47 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto de Biologia, Universidade Federal Fluminense, Niterói, 2022.http://app.uff.br/riuff/handle/1/32505CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2024-02-29T18:16:30Zoai:app.uff.br:1/32505Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202024-08-19T11:04:38.927741Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false |
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