Análise metagenômica da rizosfera de Campomanesia adamantium (Cambess) O. Berg

• Autor(a) principal: Silva, Rafael Correia da
• Data de Publicação: 2016
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
• Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/3429
• topic: Campomanesia adamantium; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Ecologia microbiana; Microbial ecology

O objetivo do presente trabalho foi a análise de bactérias e arqueias da rizosfera através da análise metagenômica da rizosfera de Campomanesia adamantium (Cambess) O. Berg... O conhecimento da taxonomia dos micro-organismos mais abundantes presentes nesse ambiente pode nortear a formulação de bioinoculantes, que são compostos de células de micro- organismos capacitados a promover o crescimento de uma planta-alvo, através da fixação de nitrogênio, aquisição de nutrientes e competição. Além disto, o conhecimento da função dos micro-organismos nesse ambiente pode gerar dados para a obtenção de novas enzimas microbianas de interesse biotecnológico. Assim, o presente trabalho buscou a identificação taxonômica e funcional dos micro-organismos da rizosfera de C. adamantium através da tecnologia de sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática. Solos foram coletados no Horto Florestal da UFGD em Dourados – Mato Grosso do Sul, para extração do material genômico, que foi amplificado para a região hipervariável v4-v5 do RNA ribossomal 16S. O DNA foi sequenciado em parceria com o LMSeq da UNESP em Jaboticabal/SP, através do Ion Semiconductor – Personal Genome Machine (PGM). Os dados do sequenciamento foram analisados por dois parâmetros de qualidade através de duas metodologias devido a possíveis discrepâncias em análises de bioinformática – a primeira, sugerida pelo Brazilian Microbiome Project e a segunda, MICCA – Microbial Community Analysis e, por fim, foi feita a predição funcional através do pacote PICRUSt. Foram encontradas diferenças na comunidades de micro-organismos do solo rizosférico e não-rizosférico, elencando-se 15 gêneros únicos de micro-organismos superabundantes na região de rizosfera, dos quais 05 foram associados em literatura como fixadores de nitrogênio e 03 associados à promoção do crescimento em plantas. Foram preditas 04 proteínas associadas à fixação de nitrogênio e 03 proteínas de interesse biotecnológico abundantes na rizosfera de C. adamantium. As análises diferenciadas de bioinformática geraram diferenças na obtenção destes resultados. Espera-se que com estes novos dados sobre essa planta do Cerrado ainda inexplorada, possa se incentivar o estabelecimento de guavirais e a exploração mais intensa do potencial biotecnológico da guavira.