Avaliação da assinatura transcricional de 3 genes do hospedeiro como ferramenta de diagnóstico e prognóstico para tuberculose ativa em populações de alto risco

• Autor(a) principal: Moreira, Flora Martinez Figueira
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
• Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4918
• topic: CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::MEDICINA::CLINICA MEDICA::DOENCAS INFECCIOSAS E PARASITARIAS; Tuberculose; Diagnóstico; Programas de rastreamento; Tuberculosis; Diagnosis; Mass screening

Introdução: A Organização Mundial da Saúde (OMS) identificou a necessidade do desenvolvimento de testes rápidos não baseados em escarro para rastreamento da tuberculose (TB) entre as populações de alto risco. O objetivo dessa tese foi investigar o desempenho da assinatura transcricional de 3 genes do hospedeiro como biomarcador sanguíneo de capacidade diagnóstica e prognóstica para TB ativa em populações de alto risco. Métodos: Foram realizados dois estudos (Estudos I e II) aninhados à coortes prospectivas. Estudo I: Foi validado a assinatura de 3 genes (GBP5 [Guanylate Binding Protein 5], DUSP3 [Dual Specificity Protein Phosphatase 3] and KLF2 [Kruppel-like factor 2]) em três coortes independentes: (coorte 1) adolescentes de uma comunidade rural da África do Sul, com infecção latente por Mycobacterium tuberculosis (ILTB); (coorte 2) triagem sistêmica da TB ativa em populações privadas de liberdade (PPL) de dois presídios do Brasil; e (coorte 3) monitoramento de resposta ao tratamento (1, 4 e 24 semanas) em adultos com cultura positiva para TB, atendidos em clínicas de atenção primária de saúde da África do Sul. Em todas as três coortes foram fornecidas amostras de sangue total para avaliar a expressão de RNA mensageiro (mRNA) dos 3 genes por meio da reação em cadeia da polimerase quantitativa por transcrição reversa (RTqPCR). Amostras de escarro para cultura em meio sólido ou líquido foram solicitados a todos os participantes para a confirmação da doença. Estudo II: Foi avaliado a acurácia da triagem diagnóstica de um novo teste protótipo de expressão rápida da assinatura de 3 genes XpertMTB-Host-Response (Xpert-MTB-HR) e comparamos ao desempenho da proteína-C reativa (CRP) usando um dispositivo point-of-care durante a triagem sistemática para TB ativa em PPL. Todos os indivíduos encarcerados foram triados por meio da coleta de escarro e confirmados pelo Xpert MTB/RIF e por cultura em meio sólido. Destes foram selecionados 100 casos confirmados de TB e 200 controles (sem TB) e comparamos o desempenho do XpertMTB-HR e da CRP. Avaliamos a curva característica de operação do receptor sob a curva (AUC), assumindo 90% de sensibilidade e 70% de especificidade, conforme os parâmetros de referência do perfil de produto alvo (TPP) proposto pela OMS. Resultados: Estudo I: Na coorte 1, o escore de 3 genes identificou progressão de ILTB para TB ativa 6 meses antes, com sensibilidade de 86% e especificidade de 84% (AUC, 0,86; 95% IC: 0,77-0,96). Na coorte 2, com sensibilidade de 90,91%, o escore de 3 genes atingiu 68,75% de especificidade para busca de casos ativos (AUC, 0,87; 95% IC: 0,79-0,94). Na coorte 3, com sensibilidade de 90,11%, o escore de 3 genes atingiu 89,19% de especificidade para distinguir TB ativa de controles saudáveis e pacientes com outras doenças pulmonares (AUROC, 0,94; 95% IC: 0,88-0,99). Além disso, o escore de 3 genes identificou pacientes que evoluíram com falência no tratamento anti-TB (AUC, 0,93; 95% IC: 0,83-1,00). Coletivamente, em todas as coortes (1-3), o escore dos 3 genes identificou pacientes com TB ativa com sensibilidade de 90%, especificidade de 70% e valor preditivo negativo acima de 95% com prevalências de 4% a 25%. Estudo II: Com sensibilidade de 90%, o Xpert-MTB-HR teve especificidade significativamente maior (53,0%, 95% IC: 45,0-69,0%) do que CRP (28,1%, 95% IC: 20,2-41,8%), mas nenhum atendeu aos padrões de referência TPP de 70% de especificidade. Entre os indivíduos com maior carga bacilar no escarro, a sensibilidade foi alta (97%) para o Xpert-MTB-HR com especificidade de 70%. Conclusão: Estudo I: Conclui-se que nas três coortes prospectivas independentes o escore, os 3 genes se aproximam dos padrões de referência TPP para teste de triagem não baseado em escarro com alto valor preditivo negativo. Estudo II: Entretanto, ao avaliar o potencial diagnóstico para a busca ativa de casos, o Xpert-MTB-HR e a CRP não atenderam aos padrões de referência do TPP para um teste de triagem. No entanto, o Xpert-MTB-HR apresentou elevada sensibilidade na detecção de indivíduos com média ou alta carga bacilar no escarro.