Aplicação do Xpert® MRB/RIF Ultra pelo método pool como estratégia para o controle da tuberculose nas prisões

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Paulo César Pereira dos
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4937
Resumo: Introdução: A tuberculose (TB) é uma doença causada pelo Mycobacterium tuberculosis (MTB) e sua distribuição na população está vinculada a fatores socioeconômicos, apresentando elevada incidência em subpopulações vulneráveis, como a privada de liberdade (PPL). A utilização do Xpert MTB/RIF® Ultra em triagens sistemáticas para identificação de casos de TB ativa nessa população não é amplamente implementada devido a restrições orçamentárias, principalmente em países de baixa e média renda, necessitando de novas abordagens para a diminuição dos custos de sua aplicação. Objetivo: Identificar novas estratégias para triagens sistemáticas de TB em prisões utilizando o cartucho Xpert MTB/RIF® Ultra através do método pool. Métodos: Neste estudo, 1.280 amostras de escarro de indivíduos de três presídios em Mato Grosso do Sul, Brasil, foram testadas utilizando o Xpert MTB/RIF 4ª Geração. Posteriormente, essas amostras foram selecionadas para produção de pools de 4, 8, 12 e 16 amostras, com cada pool contendo uma única amostra de escarro positiva de carga de MTB semiquantitativa diferente (muito baixa, baixa, média e alta), juntamente com amostras negativas até alcançar o número requerido para se ter 4, 8, 12 e 16 escarros. Além disso, foram realizados pools contendo 16 amostras negativas como controle. Esses pools foram testados no cartucho Xpert® MTB/RIF Ultra, e a partir desses resultados, verificou-se qual pool apresentou maior sensibilidade, bem como, melhor custo-benefício para ser aplicado em uma população hipotética de 1.000 indivíduos com prevalências de 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4% e 5%. Resultados: A sensibilidade geral dos pools contendo amostras positivas foi de 94% (n = 94/100, CI 95%: 88-98%), e com base nesses resultados, foi calculado o número de testes necessário para identificar cada caso de TB em cada estratégia. Com uma menor prevalência (0,5%), pools com mais espécimes (16) resultaram na diminuição significativa na quantidade de testes por caso de TB. O oposto ocorreu em uma prevalência mais elevada (5%), onde pool com menos amostras mostrou-se mais eficaz. A partir desses dados, foi calculada a custo efetividade que a aplicação dessas estratégias apresentaria nessa população. Os pools com maiores quantidades de amostras diminuíram os custos em até 87% em prevalências mais baixas, enquanto os pools com menores quantidades de amostras se adaptaram melhor em prevalências mais altas (57%). Conclusão: Esses dados sugerem que o tamanho do pool escolhido está fortemente relacionado com a prevalência. Quanto maior a prevalência, pool com menos amostras foi mais eficaz, diferentemente de uma prevalência menor, onde pool com mais amostras mostrou-se mais eficiente, elevando o seu custo-efetividade para ser aplicada em triagens sistemáticas nas prisões.
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A utilização do Xpert MTB/RIF® Ultra em triagens sistemáticas para identificação de casos de TB ativa nessa população não é amplamente implementada devido a restrições orçamentárias, principalmente em países de baixa e média renda, necessitando de novas abordagens para a diminuição dos custos de sua aplicação. Objetivo: Identificar novas estratégias para triagens sistemáticas de TB em prisões utilizando o cartucho Xpert MTB/RIF® Ultra através do método pool. Métodos: Neste estudo, 1.280 amostras de escarro de indivíduos de três presídios em Mato Grosso do Sul, Brasil, foram testadas utilizando o Xpert MTB/RIF 4ª Geração. Posteriormente, essas amostras foram selecionadas para produção de pools de 4, 8, 12 e 16 amostras, com cada pool contendo uma única amostra de escarro positiva de carga de MTB semiquantitativa diferente (muito baixa, baixa, média e alta), juntamente com amostras negativas até alcançar o número requerido para se ter 4, 8, 12 e 16 escarros. Além disso, foram realizados pools contendo 16 amostras negativas como controle. Esses pools foram testados no cartucho Xpert® MTB/RIF Ultra, e a partir desses resultados, verificou-se qual pool apresentou maior sensibilidade, bem como, melhor custo-benefício para ser aplicado em uma população hipotética de 1.000 indivíduos com prevalências de 0,5%, 1%, 2%, 3%, 4% e 5%. Resultados: A sensibilidade geral dos pools contendo amostras positivas foi de 94% (n = 94/100, CI 95%: 88-98%), e com base nesses resultados, foi calculado o número de testes necessário para identificar cada caso de TB em cada estratégia. Com uma menor prevalência (0,5%), pools com mais espécimes (16) resultaram na diminuição significativa na quantidade de testes por caso de TB. O oposto ocorreu em uma prevalência mais elevada (5%), onde pool com menos amostras mostrou-se mais eficaz. A partir desses dados, foi calculada a custo efetividade que a aplicação dessas estratégias apresentaria nessa população. Os pools com maiores quantidades de amostras diminuíram os custos em até 87% em prevalências mais baixas, enquanto os pools com menores quantidades de amostras se adaptaram melhor em prevalências mais altas (57%). Conclusão: Esses dados sugerem que o tamanho do pool escolhido está fortemente relacionado com a prevalência. Quanto maior a prevalência, pool com menos amostras foi mais eficaz, diferentemente de uma prevalência menor, onde pool com mais amostras mostrou-se mais eficiente, elevando o seu custo-efetividade para ser aplicada em triagens sistemáticas nas prisões.Introduction: Tuberculosis (TB) is a disease caused by Mycobacterium tuberculosis (MTB), and its distribution in the population is linked to socioeconomic factors, with a high incidence in vulnerable subpopulations, such as those deprived of liberty (PDL). The use of Xpert MTB/RIF® Ultra in systematic screening to identify cases of active TB in this population is not widely implemented due to budget constraints, especially in low- and middle-income countries, requiring new approaches to reduce the costs of its application. Aim: To identify new strategies for systematic screening of TB in prisons using the Xpert MTB/RIF® Ultra cartridge using the pooling method. Methods: In this study, 1,280 sputum samples from individuals from three prisons in Mato Grosso do Sul, Brazil, were tested using the Xpert MTB/RIF 4th Generation. Subsequently, these samples were selected to produce pools of 4, 8, 12 and 16 samples, with each pool containing a single different semiquantitative MTB load positive sputum sample (very low, low, medium and high) together with samples negative until reaching the required number to have 4, 8, 12 and 16 sputa. In addition, pools containing 16 negative samples were used as a control. These pools were tested in the Xpert® MTB/RIF Ultra cartridge, and from these results, it was verified which pool had the highest sensitivity as well as the best cost-benefit ratio to be applied in a hypothetical population of 1,000 individuals with prevalence rates of 0, 5%, 1%, 2%, 3%, 4% and 5%. Results: The overall sensitivity of pools containing positive samples was 94% (n = 94/100, 95% CI: 88-98%), and based on these results, the number of tests needed to identify each TB case was calculated. in each strategy. With a lower prevalence rate (0.5%), pools with more specimens (16) resulted in a significant decrease in the number of tests per TB case. The opposite occurred at a higher prevalence rate (5%), where a pool with fewer samples was more effective. From these data, the cost-effectiveness that the application of these strategies would present in this population was calculated. Pools with larger amounts of samples reduced costs by up to 87% at lower prevalences, while pools with smaller amounts of samples fit better at higher prevalences (57%). Conclusion: These data suggest that the size of the pool chosen is strongly related to prevalence. The higher the prevalence, the pool with fewer samples was more effective, unlike a lower prevalence, where the pool with more samples was more efficient, increasing its cost effectiveness to be applied in systematic screening in prisons.Submitted by Marcos Pimentel (marcospimentel@ufgd.edu.br) on 2022-05-16T21:46:15Z No. of bitstreams: 1 PauloCesarPereiradosSantos.pdf: 2443137 bytes, checksum: 92b933364b81d0a664b3419020fb1c3d (MD5)Made available in DSpace on 2022-05-16T21:46:15Z (GMT). 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