Caracterização fenotípica e molecular de leveduras isoladas em um hospital do Mato Grosso do Sul
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFGD |
Texto Completo: | http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/1320 |
Resumo: | A correta identificação dos isolados e a determinação do perfil de susceptibilidade são fatores necessários para uma terapia adequada. O estudo avaliou as diferentes técnicas de identificação de espécies de Candida por meio do VITEK 2, CHROMagar Candida e Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). O sistema automatizado VITEK 2 também foi avaliado para a determinação da suscetibilidade antifúngica, em conjunto com o método da microdiluição em caldo. 81 amostras de Candida foram coletas de março de 2013 a março de 2014. A identificação das leveduras foi realizada pelo VITEK 2, CHROMagar Candida e PCR. O VITEK 2 apresentou 34,6% de identificação incorreta. O CHROMagar Candida não identificou 14,8% dos isolados até nível de espécie e apresentou 8,6% de erros em sua identificação. A PCR identificou corretamente 100% dos isolados e os dados foram confirmados pelo seqüenciamento da região ITS. O perfil de susceptibilidade antifúngica foi determinado pelo VITEK 2 e microdiluição em caldo (MIC). 11,1% dos isolados apresentaram resistência a anfotericina B (AMB), 4,9% ao fluconazol (FLC) e 2,4% ao voriconazol (VRC). Pelo MIC, 7,4% dos isolados apresentaram resistência e a apenas ao VRC. Um isolado apresentou resistência ao VRC nos dois métodos de susceptibilidade testados. 50% dos isolados de Candida krusei não foi identificado pelo VITEK 2 e 50% dos isolados desta espécie apresentaram como susceptível ao FLC, o que demonstra a importância de avaliar os dois resultados antes da terapêutica. Portanto, a PCR é uma ferramenta rápida, útil e precisa para a identificação de leveduras, mas, ainda não é viável para a rotina hospitalar. O VITEK 2 é uma ferramenta de grande valia para a identificação e determinação da susceptibilidade antifúngica, mas, considerando centros hospitalares onde há baixa disponibilidade de recursos, o CHROMagar Candida para a identificação laboratorial das espécies de leveduras apresentou como uma alternativa viável, pois seus resultados são tão bons como o sistema automatizado, com um menor custo-benefício. |
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Oliveira, Kelly Mari Pires dehttp://lattes.cnpq.br/5737574588414921http://lattes.cnpq.br/9899842815007015Rodrigues, Luana Mireli Carbonera2019-07-22T18:53:40Z2019-07-22T18:53:40Z2015RODRIGUES, Luana Mireli Carbonera. Caracterização fenotípica e molecular de leveduras isoladas em um hospital do Mato Grosso do Sul. 2015. 52 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) – Faculdade de Ciências da Saúde, Universidade Federal da Grande Dourados, Dourados, MS, 2015.http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/1320A correta identificação dos isolados e a determinação do perfil de susceptibilidade são fatores necessários para uma terapia adequada. O estudo avaliou as diferentes técnicas de identificação de espécies de Candida por meio do VITEK 2, CHROMagar Candida e Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). O sistema automatizado VITEK 2 também foi avaliado para a determinação da suscetibilidade antifúngica, em conjunto com o método da microdiluição em caldo. 81 amostras de Candida foram coletas de março de 2013 a março de 2014. A identificação das leveduras foi realizada pelo VITEK 2, CHROMagar Candida e PCR. O VITEK 2 apresentou 34,6% de identificação incorreta. O CHROMagar Candida não identificou 14,8% dos isolados até nível de espécie e apresentou 8,6% de erros em sua identificação. A PCR identificou corretamente 100% dos isolados e os dados foram confirmados pelo seqüenciamento da região ITS. O perfil de susceptibilidade antifúngica foi determinado pelo VITEK 2 e microdiluição em caldo (MIC). 11,1% dos isolados apresentaram resistência a anfotericina B (AMB), 4,9% ao fluconazol (FLC) e 2,4% ao voriconazol (VRC). Pelo MIC, 7,4% dos isolados apresentaram resistência e a apenas ao VRC. Um isolado apresentou resistência ao VRC nos dois métodos de susceptibilidade testados. 50% dos isolados de Candida krusei não foi identificado pelo VITEK 2 e 50% dos isolados desta espécie apresentaram como susceptível ao FLC, o que demonstra a importância de avaliar os dois resultados antes da terapêutica. Portanto, a PCR é uma ferramenta rápida, útil e precisa para a identificação de leveduras, mas, ainda não é viável para a rotina hospitalar. O VITEK 2 é uma ferramenta de grande valia para a identificação e determinação da susceptibilidade antifúngica, mas, considerando centros hospitalares onde há baixa disponibilidade de recursos, o CHROMagar Candida para a identificação laboratorial das espécies de leveduras apresentou como uma alternativa viável, pois seus resultados são tão bons como o sistema automatizado, com um menor custo-benefício.The correct identification of the isolates and determining the susceptibility profile are factors necessary for adequate therapy. The study evaluated the different techniques for identification of Candida species using the VITEK 2, CHROMagar Candida and Reaction Polymerase Chain (PCR). The automated system VITEK 2 was also evaluated for the determination of antifungal susceptibility together with the microdilution broth method. 81 samples of Candida were collected from March 2013 to March 2014. The identification of yeasts was performed by VITEK 2, CHROMagar Candida and PCR. The VITEK 2 showed 34.6% of misidentification. The CHROMagar Candida did not identify 14.8% of the isolates to the species level and 8.6% had errors in their identification. The PCR correctly identified 100% of the isolates and data were confirmed by sequencing the ITS region. The susceptibility profile antifungal was determined by the VITEK 2 and microdilution (MIC). 11.1% of isolates were resistant to amphotericin B (AMB), 4.9% to fluconazole (FLC) and 2.4% to voriconazole (VRC). The MIC, 7.4% of the isolates showed resistance and just the VRC. One isolate showed resistance VRC susceptibility in the two tested methods. 50% of isolates of Candida krusei was not identified by VITEK 2 and 50% of the isolates of the species presented as susceptible to CRF, which shows the importance of evaluating the two results before therapy. Therefore, the PCR is a fast, useful and accurate tool for identifying yeasts, but is not yet feasible for the hospital routine. The VITEK 2 is a valuable tool for identification and determination of antifungal susceptibility, but considering hospitals where there is low availability of resources, the CHROMagar Candida for laboratory identification of yeast species presented as a viable alternative because their results are as good as the automated system, with a lower cost-effective.Submitted by Alison Souza (alisonsouza@ufgd.edu.br) on 2019-07-22T18:53:40Z No. of bitstreams: 1 LuanaMireliCarboneraRodrigues.pdf: 979849 bytes, checksum: c032ec318a9b79884fbf480b3bd55f6a (MD5)Made available in DSpace on 2019-07-22T18:53:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LuanaMireliCarboneraRodrigues.pdf: 979849 bytes, checksum: c032ec318a9b79884fbf480b3bd55f6a (MD5) Previous issue date: 2015Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino, Ciência e Tecnologia do Estado de Mato Grosso do Sul (FUNDECT)porUniversidade Federal da Grande DouradosPrograma de pós-graduação em Ciências da SaúdeUFGDBrasilFaculdade de Ciências da SaúdeCNPQ::CIENCIAS DA SAUDECandidaSequência de basesBase sequenceCaracterização fenotípica e molecular de leveduras isoladas em um hospital do Mato Grosso do Sulinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFGDinstname:Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD)instacron:UFGDTEXTLuanaMireliCarboneraRodrigues.pdf.txtLuanaMireliCarboneraRodrigues.pdf.txtExtracted texttext/plain109459https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/1320/3/LuanaMireliCarboneraRodrigues.pdf.txt7f0142e970498e5835ed54ca6659c4b2MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/1320/2/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD52ORIGINALLuanaMireliCarboneraRodrigues.pdfLuanaMireliCarboneraRodrigues.pdfapplication/pdf979849https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/bitstream/prefix/1320/1/LuanaMireliCarboneraRodrigues.pdfc032ec318a9b79884fbf480b3bd55f6aMD51prefix/13202023-09-14 01:39:05.522oai:https://repositorio.ufgd.edu.br/jspui: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufgd.edu.br/jspui:8080/oai/requestopendoar:21162023-09-14T05:39:05Repositório Institucional da UFGD - Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD)false |
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