Análise metagenômica da comunidade bacteriana em solos antropizados

• Autor(a) principal: Lacerda, Maria Priscila Franco
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
• Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4181
• topic: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Biorremediação; Bioinformática; RNA Ribossômico 16S; Bioremediation; Bioinformatics; RNA, Ribosomal, 16S

A metagenômica abriu novos caminhos para a microbiologia. Hoje é crescente o número de metodologias propostas para estudos sobre os microrganismos. Esses organismos possuem grande importância em relação aos ciclos biogeoquímicos do solo. No presente trabalho foram analisadas 2.561 sequências de bactérias usando o gene 16S rRNA, obtidas em trabalhos já publicados através do método de Sanger, em 7 diferentes solos brasileiros que sofreram intensa ação antrópica. Os seguintes códigos foram usados: cultivo de cana – SCC; consórcio de óleo diesel – SCOL; solo cultivado da região da Amazônia – SCA; solo de pasto da região da Amazônia – SPA; solo com cultivo de hortaliças – SCH; solo contaminado com lodo de esgoto – SCLE e solo que foi cultivado por grãos (soja, milho, feijão) - SCG. O objetivo deste trabalho foi fornecer uma visão geral das comunidades bacterianas presentes nestes ambientes. Todas as sequências foram submetidas à ferramenta Web MG-RAST. Os dados foram comparados com o banco de dados do RDP (Ribosomal Database Project) usando um valor máximo de 1e-5 para e-value, uma identidade mínima de 60%, e um comprimento mínimo de alinhamento de 20 nucleotídeos. Os resultados demonstraram a distribuição de filos do domínio Bacteria, o mais representativo foi o filo Proteobacteria - cuja presença foi constatada nas sete amostras analisadas. Foi relatada a presença de 13 filos entre as amostras, sendo que em quatro destes houve a presença em comum em seis solos. Os filos são Bacteroidetes, Firmicutes, Acidobacteria e Actinobacteria. O presente trabalho permitiu a identificação dos filos Spirochaetes, Tenericutes e Cyanobacteria, que em trabalhos anteriores não haviam sido identificados.