Análise metagenômica de cinco solos de florestas brasileiras

• Autor(a) principal: Silva, Thays Nogueira da
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFGD
• Texto Completo: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4183
• topic: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Metagenoma; RNA Ribossômico 16S; Bioinformática; Microrganismo do solo; Metagenome; RNA, Ribosomal, 16S; Bioinformatics; Soil microorganisms

O solo é um ambiente muito rico em diversidade de microrganismos. O grupo das bactérias é o que se apresenta em maior quantidade neste sistema e um grama de solo pode conter aproximadamente 10 bilhões de microrganismos e até 10 mil espécies diferentes. O conjunto de genomas presentes em uma dada microbiota é chamado de metagenoma e a abordagem metagenômica tem se mostrado uma alternativa para acessar os genes de bactérias de um determinado ambiente sem a necessidade de se utilizar o cultivo. Os objetivos do presente trabalho foram avaliar a diversidade bacteriana em cinco diferentes solos sob florestas brasileiras através da análise metagenômica do gene 16S rRNA; verificar se o processo de ranotação revelaria novos fitos e observando se algum grupo bacteriano está presente em todos os solos bem como o total de fitos que foram identificados. Para estas análises foi utilizada a ferramenta MG-RAST. Os solos denominados JAB FS, JAB SMS, JAB NFA, JAB EAA E FAOROMataAtlantica foram obtidos de trabalhos anteriores, todos provenientes de florestas brasileiras, e os arquivos com as sequências foram submetido as análises do MG-RAST, sob parâmetros pré-determinados e idênticos para todos os solos. Um total de 1239 sequências foi analisado, e todas eram provenientes do gene 16S rRNA. Foram encontrados quatorze fitos pertencentes ao domínio Bacteria neste trabalho. Os fitos encontrados em todos os solos em números significativos são Proteobacteria, Acidobacteria, Firmicutes, Verrucomicrobia, Actinobacteria e Bacteroidetes. Os fitos Chloroflexi Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Tenericutes, Nitrospirae, Cyanobacteria e Gemmatimonadetes foram encontrados em menor número variando de solo para solo e quatro novos fitos foram encontrados, quando comparados com os trabalhos dos quais foram obtidas as sequências, são eles: Chlamydiae, Spirochaetes, Tenericutes e Cyanobacteria.