Expressão gênica diferencial do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) durante interação com a raça 65 de Colletotrichum lindemuthianum
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFLA |
Texto Completo: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/33957 |
Resumo: | Knowing the transcriptional profile of genotypes under specific treatments has been considered as a tool of great relevance for the molecular understanding of the patossystems, illuminating the knowledge of resistance. The anthracnose caused by the fungus Colletotricum lindemuthianum is one of the most important diseases that affects the bean crop, which can cause significant losses in production under conditions favorable to the pathogen. The objective of this work was to: (i) investigate by RT-qPCR, in contrasting genotypes for resistance to race 65 of Colletotricum lindemuthianum, the level of expression of genes previously selected in the literature, for their probable association with the response of resistance to anthracnose, and (ii) to verify, by the cDNA-RAPD technique, the existence of variability of expression and to obtain information about the transcriptome of susceptible and anthracnose resistant cultivars when inoculated by the pathogen. Among the analyzed genes, PVPOD, CBP, MAPKK and PGIA presented differential expression between the inoculated treatments and the control of the lineages, offering information on the resistance pathways in this pathological system. The use of the RAPD technique in express material allowed the amplification of 1,619 bands in 251 loci, about 50% of them being polymorphic, attesting to the existence of variability of gene expression, with the identification of putative loci of interest, through qualitative and quantitative differences observed between inoculated and uninoculated treatments of both lines, showing variation in the gene regulation according to the applied stimulus. |
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Expressão gênica diferencial do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) durante interação com a raça 65 de Colletotrichum lindemuthianumDifferential gene expression of bean (Phaseolus vulgaris L) during interaction with the race 65 of Colletotrichum lindemuthianumcDNA-RAPDRT-qPCRRaça 65FeijoeiroColletotricum lindemuthianumRT-PCRRace 65Common beanGenética VegetalKnowing the transcriptional profile of genotypes under specific treatments has been considered as a tool of great relevance for the molecular understanding of the patossystems, illuminating the knowledge of resistance. The anthracnose caused by the fungus Colletotricum lindemuthianum is one of the most important diseases that affects the bean crop, which can cause significant losses in production under conditions favorable to the pathogen. The objective of this work was to: (i) investigate by RT-qPCR, in contrasting genotypes for resistance to race 65 of Colletotricum lindemuthianum, the level of expression of genes previously selected in the literature, for their probable association with the response of resistance to anthracnose, and (ii) to verify, by the cDNA-RAPD technique, the existence of variability of expression and to obtain information about the transcriptome of susceptible and anthracnose resistant cultivars when inoculated by the pathogen. Among the analyzed genes, PVPOD, CBP, MAPKK and PGIA presented differential expression between the inoculated treatments and the control of the lineages, offering information on the resistance pathways in this pathological system. The use of the RAPD technique in express material allowed the amplification of 1,619 bands in 251 loci, about 50% of them being polymorphic, attesting to the existence of variability of gene expression, with the identification of putative loci of interest, through qualitative and quantitative differences observed between inoculated and uninoculated treatments of both lines, showing variation in the gene regulation according to the applied stimulus.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPQ)Conhecer o perfil transcricional de genótipos sob tratamentos específicos tem sido considerado como ferramenta de grande relevância para a compreensão molecular dos patossistemas, iluminando o conhecimento da resistência. A antracnose, causada pelo fungo Colletotricum lindemuthianum, é uma das doenças mais importantes que afeta a cultura do feijoeiro, podendo causar perdas expressivas na produção, em condições favoráveis ao patógeno. Assim, este trabalho teve como objetivos: (i) investigar, por RT-qPCR, em genótipos contrastantes para a resistência à raça 65 de Colletotricum lindemuthianum, o nível de expressão de genes previamente selecionados na literatura, por sua provável associação com a resposta de resistência a antracnose e; (ii) verificar, pela técnica cDNA- RAPD, a existência de variabilidade de expressão, e obter informações acerca do transcriptoma de cultivares suscetíveis e resistentes a antracnose, quando inoculadas pelo agente patogênico. Os genes analisados, PVPOD, CBP, MAPKK e PGIA, apresentaram expressão diferencial entre os tratamentos inoculados e o controle das linhagens, oferecendo informações sobre as vias de atuação para a resistência nesse patossistema. A utilização da técnica RAPD, em material expresso, permitiu a amplificação de 1.619 bandas em 251 locos, sendo cerca de 50% deles polimórficos, atestando a existência de variabilidade de expressão gênica, com a identificação de locos putativos de interesse, através de diferenças qualitativas e quantitativas observadas entre os tratamentos inoculados e não inoculados, de ambas as linhagens, mostrando variação na regulação gênica de acordo com o estímulo aplicado.Universidade Federal de LavrasPrograma de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de PlantasUFLAbrasilDepartamento de BiologiaPereira, Welison AndradeNovaes, EvandroLeite, Monik EvelinSilva, Caroline Marcela da2019-04-30T20:26:09Z2019-04-30T20:26:09Z2019-04-292019-03-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSILVA, C. M. da. Expressão gênica diferencial do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) durante interação com a raça 65 de Colletotrichum lindemuthianum. 2019. 91 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2019.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/33957porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2019-04-30T20:26:10Zoai:localhost:1/33957Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2019-04-30T20:26:10Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false |
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