Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lelis, Flávia Mara Vieira
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1599
Resumo: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, área de concentração em Fitopatologia, para a obtenção do título de Mestre.
id UFLA_3d65403ddc3e1f8caf890b3dc2469f82
oai_identifier_str oai:localhost:1/1599
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearumPrimers development detection of Xanthomonas axonopodis pv. malvacearumPrimerDetecçãoDetectionCNPQ_NÃO_INFORMADODissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, área de concentração em Fitopatologia, para a obtenção do título de Mestre.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)FitopatologiaA semente é um dos principais veículos de introdução de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam) nas lavouras de algodão. A bactéria pode estar associada às sementes, tanto externa como internamente, sendo ambas as formas igualmente eficientes na transmissão da doença. A técnica de PCR tem permitido a detecção precoce de patógenos antes mesmo do surgimento dos sintomas na planta, de forma mais rápida, fácil e com um alto nível de sensibilidade, se comparada aos métodos tradicionais, trazendo economia de tempo e dinheiro nos trabalhos de diagnose e identificação. Objetivou-se, com este trabalho, o desenvolvimento de primers específicos para a detecção de Xam em sementes de algodão. Para tanto, primers foram desenhados e testados quanto à especificidade e à sensibilidade em dezenove isolados de Xam pertencentes aos estados de MG, SP, GO, MT e PR, três de X. campestris pv. viticola (Xcv), dois de X. axonopodis pv. phaseoli, X. campestris pv. campestris, um de X. axonopodis pv. vesicatoria, X. axonopodis pv. glycines, Ralstonia solanacearum, Pectobacterium spp., Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis e Curtobacterium flaccumfaciens pv flaccumfaciens. Os primers XMAL970-2F/1R apresentaram resultados positivos para 18 dos 19 isolados de Xam, não amplificando para os demais gêneros e espécies, exceto para o patovar viticola. Embora Xam e Xcv apresentem as mesmas bandas, essas bactérias podem ser diferenciadas pelo hospedeiro, sendo o patovar viticola patogênico a videira. O isolado IBSBF 1733 produziu um fragmento de, aproximadamente, 2000 pb, não característico de Xam. A técnica PCR é capaz de detectar até 10 ng de Xam, quando se emprega o par de primers desenhado XMAL970-2F/1R, permitindo a amplificação de uma banda de, aproximadamente, 903pb.The seed is the main vehicle for the introduction of Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam) in the cotton field. The bacterium can be seed-associated extern or internally and both forms are equally efficient in the disease transmission. The PCR technique allows the early pathogen detection, even before symptoms appear in the plant, in a faster, easier and higher sensibility level if compared to the traditional plating methods, resulting in a saving in time and money of the identification and diagnosis. The objective, in this work was the development of specific primers for detection of Xam in cotton seed. For such, primers were designed and tested for specificity and sensitivity in nineteen strains of Xam belonging to the States MG, SP, GO, MT e PR, three of X. campestris pv. viticola (Xcv), two of X. axonopodis pv. phaseoli, X. campestris pv. campestris, one of X. axonopodis pv. vesicatoria, X. axonopodis pv. glycines, Ralstonia solanacearum, Pectobacterium spp., Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis and Curtobacterium flaccumfaciens pv flaccumfaciens. The primers XMAL970-2F/1R showed positive results for 18 out of the 19 Xam strains, no amplification to the other genera and species was observed, but the patovar viticola. However, Xam and Xcv presented the same band, this bacterium can be differentiated by host, being the patovar viticola pathogenic to grapevine. The strain IBSBF 1733, yielded an estimated 2000 nt fragment not characteristic of Xam. The PCR technique allowed to detect until 10 ng of Xam, when the designed primer pair XMAL970-2F/1R was used, yielding an estimated 903 nt band.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDFP - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILSouza, Ricardo Magela deRibeiro, Regina Cássia FerreiraFigueira, Antonia dos ReisLelis, Flávia Mara Vieira2014-01-30T11:23:51Z2014-01-30T11:23:51Z201420142009-03-27info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfLELIS, F. M. V. Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. 2009. 32 p. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1599info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-05-11T19:31:34Zoai:localhost:1/1599Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-05-11T19:31:34Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
Primers development detection of Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
title Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
spellingShingle Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
Lelis, Flávia Mara Vieira
Primer
Detecção
Detection
CNPQ_NÃO_INFORMADO
title_short Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
title_full Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
title_fullStr Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
title_full_unstemmed Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
title_sort Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
author Lelis, Flávia Mara Vieira
author_facet Lelis, Flávia Mara Vieira
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Souza, Ricardo Magela de
Ribeiro, Regina Cássia Ferreira
Figueira, Antonia dos Reis
dc.contributor.author.fl_str_mv Lelis, Flávia Mara Vieira
dc.subject.por.fl_str_mv Primer
Detecção
Detection
CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic Primer
Detecção
Detection
CNPQ_NÃO_INFORMADO
description Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, área de concentração em Fitopatologia, para a obtenção do título de Mestre.
publishDate 2009
dc.date.none.fl_str_mv 2009-03-27
2014-01-30T11:23:51Z
2014-01-30T11:23:51Z
2014
2014
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv LELIS, F. M. V. Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. 2009. 32 p. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1599
identifier_str_mv LELIS, F. M. V. Desenvolvimento de primers para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. 2009. 32 p. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.
url http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1599
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DFP - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DFP - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1815439211296194560

Registros relacionados