O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rezende, Pâmela Marinho
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727
Resumo: Não
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spelling O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de estBioinformáticaAlinhamento de sequênciasAlinhamento por partiçãoNãoNãoNeste trabalho foi utilizado o algoritmo mBKM (Modificação do algoritmo de K-média por Bisseção) juntamente com o algoritmo de medidas DMK (Medidas de Distancia baseadas em K-tuplas) extraído de Wei, Jiang, et al., (2012). Este algoritmo consiste em um método livre de alinhamentos para agrupamento hierárquico de sequências. Para gerar os agrupamentos do algoritmo foi utilizada a base de dados do NCBI e sequências de ESTs extraído de Fernandes (2011). O algoritmo foi implementado e testado com tamanhos de 10, 20, 30, 40 E 50 agrupamentos. Como resultados dos experimentos em geral demonstraram-se satisfatórios levando em consideração o critério estabelecido. Conclui-se então que através das implementações e modificações propostas por este trabalho o algoritmo apresentou bons agrupamentos para as sequências de café da progeniê Siriema.NãoUFLAbrasilCiência da ComputaçãoChalfun Junior, AntonioUchôa, Joaquim QuinteiroBrum, Christiane Noronha FernandesRezende, Pâmela Marinho2015-12-17T19:12:22Z2014-10-212015-12-17T19:12:22Z2015-12-172014-10-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttp://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2018-09-28T16:18:50Zoai:localhost:1/10727Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2018-09-28T16:18:50Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
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