Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Franklin Cordeiro
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFLA
Texto Completo: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2609
Resumo: Fitopatologia
id UFLA_f70e4e5270902d271819582d6aac58ec
oai_identifier_str oai:localhost:1/2609
network_acronym_str UFLA
network_name_str Repositório Institucional da UFLA
repository_id_str
spelling Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijãoOptimization of the PCR technique for detection of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli in bean seedsFeijão - Xanthomonas axonopodisFeijão - Doenças e pragasFeijão - BacteriosesReação em cadeia de polimeraseCNPQ_NÃO_INFORMADOFitopatologiaO crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap), é a principal bacteriose do feijoeiro no Brasil, sendo transmitida principalmente por sementes. O presente trabalho foi realizado com o objetivo de aperfeiçoar uma técnica para detecção de Xap em sementes de feijão, por meio da utilização de diferentes métodos de preparação do extrato para a detecão via PCR, além da detecção simultânea de Xap e Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) nos extratos, utilizando a Bio-PCR. Após a inoculação das sementes de feijão, foram avaliados: extrato bruto, obtido diretamente das sementes, extrato concentrado em membrana milipore, extrato concentrado por centrifugação e extrato plaqueado em meio seletivo (Bio-PCR). Avaliou-se a presença de Xap e de Cff, em lotes comerciais de feijão provenientes de diversas regiões do Brasil, utilizando-se os mesmos procedimentos das sementes inoculadas. Para a otimização da técnica de PCR, foram utilizados os primers X4c e X4e. A partir do extrato bruto, do extrato concentrado por centrifugação e por membrana milipore, não foi possí­vel a detecção de Xap nas sementes de feijão artificialmente contaminadas nem nos 47 lotes comerciais de sementes/grãos de feijão. A técnica de Bio-PCR permitiu a detecção de Xap a partir de extratos de sementes de feijão artificialmente contaminadas e em 18 dos 47 comerciais. A técnica de detecção simultânea de Xap e Cff no mesmo gel não foi viável, por amplificar fragmentos de DNA tí­picos de Cff na amostra controle Xap. O meio de cultura semi-seletivo XCP1 sem antibióticos pode ser utilizado para a recuperação de colônias de Xap.Common blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) is the main bacterial malady in Brazilian beans, being transmitted mainly by seeds. This present work aimed at improving a technique for the detection of Xap in bean seeds, by using different extract preparation methods for detection through via PCR, and the simultaneous detection of Xap and Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) in the extracts by using a Bio-PCR. After inoculating the bean seeds an assessment was made of gross extract obtained directly from the seeds, extract concentrated in Millipore membrane, extract concentrated via centrifugation and plating of seed extracts on a semi-selective agar medium (Bio-PCR). The presence of Xap and Cff in commercial lots of beans from several regions of Brazil by using the same procedures as those for inoculated seeds was also assessed. For the optimization of the PCR technique primers X4c and X4e were used. Neither from the gross extract, the extract concentrated by centrifugation and by Millipore membrane detection of Xap in artificially contaminated bean seeds nor in the 47 commercial lots of bean seeds/grains was the detection of Xap possible. The Bio-PCR technique enabled for the detection of Xap from artificially contaminated bean seed extracts and in 18 of the 47 commercial lots. The technique for the simultaneous detection of Xap and Cff in the same gel was not viable due to the amplification of typical Cff DNA fragments in the control Xap sample. The semi-selective cultivation medium XCP1 without antibiotics can be used for the recovery of Xap colonies.UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASDFP - Programa de Pós-graduaçãoUFLABRASILSouza, Ricardo Magela deCastro, Hilário Antônio deFigueira, Antonia dos ReisSilva, Franklin Cordeiro2014-08-12T18:12:26Z2014-08-12T18:12:26Z2014-08-122008-07-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSILVA, F. C. Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão. 2008. 49 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2609info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFLAinstname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)instacron:UFLA2023-05-11T19:31:59Zoai:localhost:1/2609Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufla.br/oai/requestnivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.bropendoar:2023-05-11T19:31:59Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)false
dc.title.none.fl_str_mv Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
Optimization of the PCR technique for detection of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli in bean seeds
title Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
spellingShingle Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
Silva, Franklin Cordeiro
Feijão - Xanthomonas axonopodis
Feijão - Doenças e pragas
Feijão - Bacterioses
Reação em cadeia de polimerase
CNPQ_NÃO_INFORMADO
title_short Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
title_full Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
title_fullStr Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
title_full_unstemmed Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
title_sort Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão
author Silva, Franklin Cordeiro
author_facet Silva, Franklin Cordeiro
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Souza, Ricardo Magela de
Castro, Hilário Antônio de
Figueira, Antonia dos Reis
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Franklin Cordeiro
dc.subject.por.fl_str_mv Feijão - Xanthomonas axonopodis
Feijão - Doenças e pragas
Feijão - Bacterioses
Reação em cadeia de polimerase
CNPQ_NÃO_INFORMADO
topic Feijão - Xanthomonas axonopodis
Feijão - Doenças e pragas
Feijão - Bacterioses
Reação em cadeia de polimerase
CNPQ_NÃO_INFORMADO
description Fitopatologia
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008-07-31
2014-08-12T18:12:26Z
2014-08-12T18:12:26Z
2014-08-12
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SILVA, F. C. Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão. 2008. 49 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.
http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2609
identifier_str_mv SILVA, F. C. Otimização da técnica de PCR para detecção de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão. 2008. 49 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.
url http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2609
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DFP - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
publisher.none.fl_str_mv UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
DFP - Programa de Pós-graduação
UFLA
BRASIL
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFLA
instname:Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron:UFLA
instname_str Universidade Federal de Lavras (UFLA)
instacron_str UFLA
institution UFLA
reponame_str Repositório Institucional da UFLA
collection Repositório Institucional da UFLA
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA)
repository.mail.fl_str_mv nivaldo@ufla.br || repositorio.biblioteca@ufla.br
_version_ 1784550153988866048

Registros relacionados