Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ana Carolina de Oliveira
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/LFSA-7T6JHK
Resumo: Serino proteases são uma classe de enzimas de grande importância terapêutica. Seu papel em processos biológicos críticos como digestão, coagulação sanguínea, fibrinólise e resposta imune tornam-nas um promissor alvo para o desenvolvimento de novos fármacos. Com o objetivo de se sintetizar potenciais inibidores de serino proteases umconjunto de dez moléculas foi submetido a um estudo de modelagem molecular (docking), empregando-se o programa AutoDock 3.0.5, com o fim de se determinar a afinidade e o modo de interação entre a â-tripsina e os potenciais ligantes. A â- tripsina foi escolhida para o presente trabalho por ser considerada um modelo de estudo na classe das serino proteases. Dentre os ligantes submetidos ao docking quatro foram selecionados para síntese. Os compostos 1,3-bis(1-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (7) e 1,3-bis(2-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (8) apresentaram maiores valores de pKi do que os demais compostos e por isso foram escolhidos para síntese. N-(4-nitrofenil)-4-amidinobenzamida (1) e N-benzil-4-amidinobenzamida (2) foram aqueles com os menores valores de pKi e sua escolha para síntese foi baseada na necessidade de se validar o método computacional empregado. Os ligantes 2, 7 e 8 foram obtidos com sucesso e serão submetidos a ensaiosenzimáticos nos laboratórios de colaboradores do presente projeto (professores Amintas Fabiano de Souza Figueiredo e Marcelo Matos Santoro). As tentativas de síntese de 1 levaram à recuperação do material de partida ou a um produto de hidrólise de 1, a p-nitroanilina.
id UFMG_2014f37fe397d63977750c97a9505709
oai_identifier_str oai:repositorio.ufmg.br:1843/LFSA-7T6JHK
network_acronym_str UFMG
network_name_str Repositório Institucional da UFMG
repository_id_str
spelling Ricardo Jose AlvesThais Horta Álvares da SilvaJulio Cesar Dias LopesRossimiriam Pereira de FreitasAna Carolina de Oliveira2019-08-13T00:42:17Z2019-08-13T00:42:17Z2009-03-04http://hdl.handle.net/1843/LFSA-7T6JHKSerino proteases são uma classe de enzimas de grande importância terapêutica. Seu papel em processos biológicos críticos como digestão, coagulação sanguínea, fibrinólise e resposta imune tornam-nas um promissor alvo para o desenvolvimento de novos fármacos. Com o objetivo de se sintetizar potenciais inibidores de serino proteases umconjunto de dez moléculas foi submetido a um estudo de modelagem molecular (docking), empregando-se o programa AutoDock 3.0.5, com o fim de se determinar a afinidade e o modo de interação entre a â-tripsina e os potenciais ligantes. A â- tripsina foi escolhida para o presente trabalho por ser considerada um modelo de estudo na classe das serino proteases. Dentre os ligantes submetidos ao docking quatro foram selecionados para síntese. Os compostos 1,3-bis(1-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (7) e 1,3-bis(2-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (8) apresentaram maiores valores de pKi do que os demais compostos e por isso foram escolhidos para síntese. N-(4-nitrofenil)-4-amidinobenzamida (1) e N-benzil-4-amidinobenzamida (2) foram aqueles com os menores valores de pKi e sua escolha para síntese foi baseada na necessidade de se validar o método computacional empregado. Os ligantes 2, 7 e 8 foram obtidos com sucesso e serão submetidos a ensaiosenzimáticos nos laboratórios de colaboradores do presente projeto (professores Amintas Fabiano de Souza Figueiredo e Marcelo Matos Santoro). As tentativas de síntese de 1 levaram à recuperação do material de partida ou a um produto de hidrólise de 1, a p-nitroanilina.Serine proteases are a class of enzymes of great therapeutic importance. Their role in critical biological processes like digestion, blood coagulation, fibrinolysis and immune response make them promising targets for the development of new drugs. Aiming at the synthesis of potential serine protease inhibitors a set of ten moleculeswas subjected to a molecular modeling study (docking) using the AutoDock 3.0.5 program. The goal of this study was to determine the binding affinity and modes of binding of the potential inhibitors to â- trypsin. â-trypsin was chosen for the present work because it is considered a model for the study of serine proteases. Among the compounds subjected to docking four were selected for synthesis.Compounds 1,3-bis(1-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propane (7) and 1,3- bis(2-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propane (8) were chosen because of their higher affinity as expressed by their higher pKi values as compared to the other compounds. N-(4-nitrofenil)-4-amidinobenzamide (1) and N-benzil-4- amidinobenzamide (2) were those with the lower pKi values and they were selected for synthesis for method validation reasons.The compounds 2, 7 and 8 were obtained successfully and they will be evaluated in enzymatic assays to be carried out in the laboratory of collaborators of the present project (professor Amintas Fabiano de Souza and professor Marcelo Matos Santoro). The attempts to synthesize 1 resulted in starting material recovery or in the isolation of p-nitroaniline, a hydrolysis product.Universidade Federal de Minas GeraisUFMGSíntese orgânicaQuímica farmacêuticaEnzimasSíntese deInibidores potenciais de serino proteasesModelagem molecularPlanejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteasesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALversao__biblioteca.pdfapplication/pdf25829642https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/LFSA-7T6JHK/1/versao__biblioteca.pdf652be9b2133338b10aa8495272c9b0d5MD51TEXTversao__biblioteca.pdf.txtversao__biblioteca.pdf.txtExtracted texttext/plain228911https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/LFSA-7T6JHK/2/versao__biblioteca.pdf.txt7e63a410ed13f72fc50294a43275983cMD521843/LFSA-7T6JHK2019-11-14 20:32:11.358oai:repositorio.ufmg.br:1843/LFSA-7T6JHKRepositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2019-11-14T23:32:11Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
title Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
spellingShingle Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
Ana Carolina de Oliveira
Síntese de
Inibidores potenciais de serino proteases
Modelagem molecular
Síntese orgânica
Química farmacêutica
Enzimas
title_short Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
title_full Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
title_fullStr Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
title_full_unstemmed Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
title_sort Planejamento por modelagem molecular e síntese de inibidores potenciais de serino proteases
author Ana Carolina de Oliveira
author_facet Ana Carolina de Oliveira
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Ricardo Jose Alves
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Thais Horta Álvares da Silva
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Julio Cesar Dias Lopes
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Rossimiriam Pereira de Freitas
dc.contributor.author.fl_str_mv Ana Carolina de Oliveira
contributor_str_mv Ricardo Jose Alves
Thais Horta Álvares da Silva
Julio Cesar Dias Lopes
Rossimiriam Pereira de Freitas
dc.subject.por.fl_str_mv Síntese de
Inibidores potenciais de serino proteases
Modelagem molecular
topic Síntese de
Inibidores potenciais de serino proteases
Modelagem molecular
Síntese orgânica
Química farmacêutica
Enzimas
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Síntese orgânica
Química farmacêutica
Enzimas
description Serino proteases são uma classe de enzimas de grande importância terapêutica. Seu papel em processos biológicos críticos como digestão, coagulação sanguínea, fibrinólise e resposta imune tornam-nas um promissor alvo para o desenvolvimento de novos fármacos. Com o objetivo de se sintetizar potenciais inibidores de serino proteases umconjunto de dez moléculas foi submetido a um estudo de modelagem molecular (docking), empregando-se o programa AutoDock 3.0.5, com o fim de se determinar a afinidade e o modo de interação entre a â-tripsina e os potenciais ligantes. A â- tripsina foi escolhida para o presente trabalho por ser considerada um modelo de estudo na classe das serino proteases. Dentre os ligantes submetidos ao docking quatro foram selecionados para síntese. Os compostos 1,3-bis(1-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (7) e 1,3-bis(2-naftiloxi)-2-[(4-amidinobenzoil)amino]propano (8) apresentaram maiores valores de pKi do que os demais compostos e por isso foram escolhidos para síntese. N-(4-nitrofenil)-4-amidinobenzamida (1) e N-benzil-4-amidinobenzamida (2) foram aqueles com os menores valores de pKi e sua escolha para síntese foi baseada na necessidade de se validar o método computacional empregado. Os ligantes 2, 7 e 8 foram obtidos com sucesso e serão submetidos a ensaiosenzimáticos nos laboratórios de colaboradores do presente projeto (professores Amintas Fabiano de Souza Figueiredo e Marcelo Matos Santoro). As tentativas de síntese de 1 levaram à recuperação do material de partida ou a um produto de hidrólise de 1, a p-nitroanilina.
publishDate 2009
dc.date.issued.fl_str_mv 2009-03-04
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-08-13T00:42:17Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-08-13T00:42:17Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1843/LFSA-7T6JHK
url http://hdl.handle.net/1843/LFSA-7T6JHK
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFMG
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMG
instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron:UFMG
instname_str Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron_str UFMG
institution UFMG
reponame_str Repositório Institucional da UFMG
collection Repositório Institucional da UFMG
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/LFSA-7T6JHK/1/versao__biblioteca.pdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/LFSA-7T6JHK/2/versao__biblioteca.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 652be9b2133338b10aa8495272c9b0d5
7e63a410ed13f72fc50294a43275983c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1803589494249619456