Estudo da diversidade genética humana em populações nativas e miscigenadas através da utilização de INDELs informativos de ancestralidade localizados no cromossomo 5 e microssatélites tetra-locais do cromossomo Y DYS464 e DYS503

• Autor(a) principal: Fernanda de Souza Gomes Kehdy
• Data de Publicação: 2010
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9M2PRW
• topic: Bioquímica e Imunologia; Bioquímica; Cromossomo Y; Microssatélites (Genética); Genética de população humana

No primeiro capítulo desta tese nós avaliamos um painel de 31 INDELs com ampla variação de freqüência alélica entre África e Europa ( médio = 0,46), em uma única região cromossômica, abrangendo 90Mb do braço longo do cromossomo 5. Primeiramente genotipamos o painel de diversidade do CEPH-HGDP (1045 indivíduos de 52 populações mundiais, distribuídas em 7 regiões geográficas) para os 31 INDELs. A análise de variância molecular (AMOVA) demonstrou que, dentro das populações, a diferença entre indivíduos equivale a aproximadamente 81% da variabilidade genética, enquanto que a diferença entre as regiões geográficas constitui cerca de 16%. Uma representação gráfica (escalonamento multidimensional) da matriz de distância baseada em Fst (distância de Reynolds) com as 52 populações revelou cinco claros agrupamentos correspondentes às cinco grandes regiões geográficas: África, Oceania, Leste Asiático, Américas e Eurásia (Europa, Ásia Central e Oriente Médio). Nossos resultados corroboram os estudos prévios com locos espalhados no genoma. Em seguida, a fim de inferir a origem ancestral de fragmentos cromossômicos e caracterizar o padrão de mistura da população brasileira, estudamos os 31 INDELs em 261 indivíduos não aparentados, autoclassificados de acordo com o IBGE como pretos (n=104) e brancos (n=157) da cidade de São Paulo. Utilizando as populações parentais como referência, a provável origem ancestral de cada loco foi estimada para cada cromossomo de cada indivíduo brasileiro. Os resultados mostraram que, em média, cada indivíduo preto de SP apresenta 27% da região cromossômica analisada de origem européia, 53% de origem africana e 19% de origem ameríndia, enquanto para os brancos, estas porcentagens foram de 60%, 16% e 24%, respectivamente. Uma correlação significativa entre o número de locos de uma mesma origem ancestral entre os dois cromossomos 5 homólogos de um mesmo indivíduo foi encontrada tanto para os pretos (p<0,000001) quanto para os brancos (p<0,000001). Uma possível explicação para esses achados é o casamento assortativo de acordo com a cor, mas independente da ancestralidade genômica. Nossos resultados mostraram que os marcadores utilizados são capazes de discriminar as três raízes ancestrais brasileiras e que a abordagem utilizada na caracterização da população brasileira em nível cromossômico foi adequada. No segundo capítulo da tese estudamos dois microssatélites tetra locais do cromossomo Y, DYS464 e DYS503, em todas as amostras de homens do painel mundial do CEPH-HGDP. Além disso, avaliamos a utilização das freqüências alélicas do DYS464 na inferência de proporções de mistura de populações parentais em populações miscigenadas. Nos estudos das populações mundiais, para o DYS464, um total de 14 alelos com variações de tamanho de 9 a 23 repetições foram encontrados. Um total de 175 diferentes genótipos foram observados dos quais 90 foram encontrados em um único continente. A África foi a região que apresentou maior porcentagem de genótipos exclusivos. A diversidade genotípica foi de 0,98 na Europa, 0,97 na Ásia Central e Leste asiático, 0,95 na África, 0,94 na Oceania, 0,92 no Oriente Médio e 0,90 nas Américas. A análise de variância molecular (AMOVA) revelou baixos níveis de estruturação genética com 88,42% da variabilidade genética dentro de populações e apenas 1,96% entre regiões geográficas. A utilização de freqüências alélicas do DYS464 na inferência de proporções de mistura em populações miscigenadas revelou valores que corroboram os dados encontrados na literatura. O microssatélite DYS503 apresentou uma diversidade de padrões alélicos na África menor do que na maioria dos outros continentes. Nossos resultados juntos indicam que, embora o DYS464 não nos permita fazer detalhadas inferências a respeito da filogeografia humana, ele é altamente polimórfico e pode ser uma ferramenta útil em estudos evolutivos e em estudos de populações miscigenadas. Além disso, a baixa diversidade do DYS503 na é um dado incomum que, para ser compreendido, deve ser mais detalhadamente estudado.