Utilização de ferramentas computacionais para o estudo do impacto funcional e estrutural de nsSNPs em genes codificadores de proteínas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sergio Amorim de Alencar
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-8MYJL7
Resumo: Os polimorfismos de base única (SNPs) são a forma mais comum de variação na sequência de DNA entre humanos, e têm o potencial de afetar a função gênica, principalmente quando estão localizados em regiões codificadoras ou regulatórias. Dentre os diferentes tipos de SNPs, acredita-se que os SNPs não-sinônimos (nsSNPs) têm o maior impacto na função protéica, sendo frequentemente associados a doenças, alterações na resposta a fármacos, e a reações adversas. A motivação deste trabalho é o fato de que uma abordagem computacional pode ter grande utilidade na avaliação preliminar do impacto funcional e estrutural de nsSNPs em genes codificadores de proteínas em humanos, possibilitando assim a priorização de nsSNPs candidatos para estudos experimentais. Com este propósito, fizemos a modelagem de nsSNPs nas correspondentes estruturas protéicas nativas como codificadas pelos genes, buscando determinar o impacto causado por estas variações utilizando diferentes métodos computacionais, tais como o docking molecular e a otimização de estruturas protéicas. Um banco de dados foi montado, relacionando os resultados das análises computacionais feitas com informações já existentes, tais como de doenças, vias metabólicas, alvos terapêuticos, fármacos, enzimas metabolizadoras de fármacos, e anotações de sequências protéicas, possibilitando a integração de resultados obtidos por diferentes métodos utilizados no estudo do impacto de nsSNPs na função protéica.
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