Análise transcricional de Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi, linhagem 258, a partir de montagem ab initio: um enfoque nos processos biológicos dos stimulons ácido, térmico e osmótico

• Autor(a) principal: Mariana Passos Santana
• Data de Publicação: 2014
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9NMHUR
• topic: Corynebacterium pseudotuberculosis; Stimulon; RNA-seq; Montagem ab initio; transcriptoma; Estresses; Corynebacterium pseudotuberculosis; Sequenciamento do ácido ribonucléico; Genética; Transcriptoma; Stress (Fisiologia)

Corynebacterium pseudotuberculosis é uma bactéria patogênica, responsável por diferentes patologias, que trazem grandes prejuízos à agropecuária, como linfangite ulcerativa. Esta doença se manifesta, principalmente, em equinos infectados pela linhagem 258 de C. pseudotuberculosis (biovar equi). Com o objetivo de melhor compreender a biologia deste microrganismo e a dinâmica da expressão gênica no início da fase exponencial de crescimento, um estudo transcricional foi realizado. Através do RNA-seq foi possivel identificar os transcritos presentes nos estresses ácido, térmico e osmótico, condições que simulam o ambiente enfrentado pelo patógeno, durante o processo infeccioso no hospedeiro, e compará-los à condição fisiológica. Assim, após sequenciamento pela plataforma SOLiD V3 plus, os transcritos foram montados pela metodologia ab initio e os dados processados no software Blast2go com atribuições GO (Gene Ontology). As CDSs (coding sequences) foram organizadas dentro de cada categoria e termo GO, pelo software CSI (CoreStImulon), e a categoria processo biológico foi selecionada para análise dos genes. Entre os stimulons, conjunto de genes regulados por uma determinada condição ambiental, o estresse ácido foi o que mais contribuiu para um catálogo gênico, os quais genes relacionados ao combate de espécies reativas de oxigênio, ao estresse térmico, entre outros, foram identificados. O stimulon térmico apresentou resultados interessantes, envolvendo as HSPs (heat shock proteins) como moduladoras da expressão, além de genes de aquisição de ferro e síntese da parede celular. No stimulon osmótico não foi possível verificar a presença de genes relevantes ao estresse, mas possíveis genes envolvidos na virulência e sobrevivência do patógeno foram descritos. Entre os genes compartilhados entre duas ou três condições, destacam-se os genes fts, envolvidos na divisão e ciclo celular, e os envolvidos na síntese de osmoprotetores. Os genes codificantes das proteínas MraZ, Trx, TrxR, proteína semelhante ferritina, SDH, Drp1 e Drp2, já demonstraram um papel protetor relevante em outros organismos, e por isso foram considerados os mais promissores à contribuir para soluções eficazes contra doença provocada por C. pseudotuberculosis e assim minimizar os prejuízos trazidos ao agronegócio.