Predição de alvos quimioterápicos e design de vacina multi-epítopo em Corynebacterium ulcerans e C. silvaticum

• Autor(a) principal: Janaína Canário Cerqueira
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/55771
• topic: alvos de drogas; Corynebacterium; doença zoonótica; imunoinformática; patógeno; vacinologia reversa; Bioinformática; Corynebacterium; Zoonoses; Noxas; Vacinologia

Corynebacterium é um gênero de bactérias gram-positivas que contém espécies de importância médica, veterinária e biotecnológica. Entre as bactérias patogênicas existe um clado contendo seis espécies que podem ser lisogenizadas por corynefagos tox+ e produzir a toxina diftérica (DT), denominado complexo da C. diphtheriae. Entre as espécies do complexo, C. ulcerans é uma bactéria zoonótica que infecta diversos mamíferos e pode causar diferentes doenças. Atualmente linhagens produtoras de DT são a maior causa de difteria, que vem aumentando em países subdesenvolvidos devido a vacinação negligenciada. Pessoas vacinadas podem ser infectadas e transmitir o patógeno. Além disso, a vacina não protege contra linhagens não produtoras de DT, que são capazes de causar outras doenças. C. silvaticum é uma espécie recentemente descrita de importância veterinária que causa linfadenite caseosa em porcos e corças, e possui potencial zoonótico. Pouco se sabe sobre sua distribuição geográfica e espectro de hospedeiros. Neste contexto, o desenvolvimento de uma nova vacina capaz de proteger contra linhagens produtoras e não produtoras de DT das duas espécies teria relevância média e veterinária. Além disso, para os casos de tratamento da infecção, a identificação de novos quimioterápicos seria uma alternativa em caso de resistência aos atuais. Neste trabalho utilizamos estratégias in silico para identificar, para as duas espécies, novas proteínas alvo de quimioterápicos e desenvolver novas vacinas. Foram analisados 72 genomas de C. ulcerans e 36 de C. silvaticum. Por meio da genômica subtrativa foi possível identificar quatro proteínas alvo de quimioterápicos. Utilizando-se docking molecular e uma biblioteca de 5.008 compostos naturais, foram identificados três possíveis quimioterápicos para cada uma das proteínas alvo. Por meio da vacinologia reversa foram identificadas nove prováveis proteínas alvo. Uma análise imunoinformática foi realizada para desenhar vacinas multi-epitopos a partir de 25 epítopos em comum entre oito das nove proteínas identificadas anteriormente. Quatro vacinas multi-epítopos foram desenhadas com diferentes adjuvantes, capazes de induzir respostas imunes inatas e adaptativas. As informações geradas poderão reduzir o custo e o tempo para a descoberta de novos antibióticos e para o desenvolvimento de uma vacina para as duas espécies, capaz de proteger contra linhagens não produtoras de DT.