Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
Texto Completo: http://bdm.ufmt.br/handle/1/163
Resumo: Salmonella spp. is an enteric bacterium responsible for severe food poisoning, one of the main agents responsible for outbreaks reported in various countries, externalizing itself with some characteristics such as endemicity, morbidity and above all, the difficulty of adopting the measure of control. Traditional methods for isolation of Salmonella spp. in food is provided by Brazilian law, however, are made of extremely laborious manner and demand working days for confirmation of the genus. In this context, the PCR becomes an excellent alternative for rapid, sensitive and specific detection of Salmonella spp. in food, reducing the analysis time to a few days pathogen hours. Therefore, this research aims to standardize the PCR, independent culture, to detect the presence of Salmonella spp tambaqui (Colossoma macropmum). Was not possible to standardize the PCR technique by using reference strains of Salmonella spp. it was not possible to detect environmental contamination of Salmonella spp. fish in an artificial contamination was also performed. Two methods of DNA extraction by thermal lysis and comecial kit was evaluated. It was noted that the extraction (DNeasy mericon Food Kit) commercial kit Quiagen®, was more efficient and yielded a DNA of better quality compared to extraction by thermal lysis.The optimum conditions for the detection of Salmonella spp was reached and achieved the limit of detection was 101 CFU / mL. The PCR was as sensitive as conventional methods, with the advantage of reducing the analysis time of 7 days to approximately 4 hours of work.
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Therefore, this research aims to standardize the PCR, independent culture, to detect the presence of Salmonella spp tambaqui (Colossoma macropmum). Was not possible to standardize the PCR technique by using reference strains of Salmonella spp. it was not possible to detect environmental contamination of Salmonella spp. fish in an artificial contamination was also performed. Two methods of DNA extraction by thermal lysis and comecial kit was evaluated. It was noted that the extraction (DNeasy mericon Food Kit) commercial kit Quiagen®, was more efficient and yielded a DNA of better quality compared to extraction by thermal lysis.The optimum conditions for the detection of Salmonella spp was reached and achieved the limit of detection was 101 CFU / mL. The PCR was as sensitive as conventional methods, with the advantage of reducing the analysis time of 7 days to approximately 4 hours of work.A Salmonella spp. é uma bactéria entérica responsável por graves intoxicações alimentares, sendo um dos principais agentes envolvidos em surtos registrados em vários países, exteriorizando-se pelas suas características de endemicidade, alta morbidade e sobretudo, pela dificuldade da adoção de medida de controle. A metodologia tradicional para isolamento de Salmonella spp. em alimentos está prevista pela legislação brasileira, no entanto, são realizadas de forma trabalhosa demandando alguns dias de trabalho para a confirmação do gênero. Neste contexto, a técnica de PCR se torna uma excelente alternativa para detecção rápida, sensível e específica de Salmonella spp. em alimentos, reduzindo o tempo de detecção do patógeno de dias para algumas horas. Dessa forma, esta pesquisa tem como objetivo padronizar uma PCR, cultura independente, para detectar a presença de Salmonella spp em tambaqui (Colossoma macropmum). Foi possível realizar a padronização da técnica de PCR através da utilização de cepas de referência de Salmonella spp. não foi possível detectar contaminação ambiental de Salmonella spp. no pescado, sendo realizado uma contaminação artificial no mesmo. Foi avaliado dois métodos de extração de DNA por lise térmica e por kit comecial. Notou-se que a extração com kit comercial da Quiagen® (DNeasy mericon Food Kit), foi mais eficiente e rendeu um DNA de melhor qualidade comparado com a extração por lise térmica. As condições ótimas para a pesquisa de Salmonella spp. foi alcançada e o limite de detecção obtido foi de 101 UFC/mL. A PCR foi tão sensível quanto a metodologia convencional, com a vantagem de reduzir o tempo de análise de 7 dias para aproximadamente 4 horas de trabalho.Universidade Federal de Mato GrossoBrasilFaculdade de Nutrição (FANUT)UFMT CUC - CuiabáCiência e Tecnologia de Alimentos - CUCFigueiredo, Eduardo Eustáquio de Souzahttp://lattes.cnpq.br/6282282710604561Figueiredo, Eduardo Eustáquio de Souzahttp://lattes.cnpq.br/6282282710604561Silva, Luciana Kimie Savay dahttp://lattes.cnpq.br/2501838118203314Carvalho, Ricardo César deFernandes, Dandara Virginia Guia Semedo2018-08-21T13:26:55Z2014-08-252018-08-21T13:26:55Z2014-08-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/datasetFERNANDES, Dandara Virginia Guia Semedo. Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum). 2014. 38 f. 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