Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
Texto Completo: http://bdm.ufmt.br/handle/1/163
Resumo: Salmonella spp. is an enteric bacterium responsible for severe food poisoning, one of the main agents responsible for outbreaks reported in various countries, externalizing itself with some characteristics such as endemicity, morbidity and above all, the difficulty of adopting the measure of control. Traditional methods for isolation of Salmonella spp. in food is provided by Brazilian law, however, are made of extremely laborious manner and demand working days for confirmation of the genus. In this context, the PCR becomes an excellent alternative for rapid, sensitive and specific detection of Salmonella spp. in food, reducing the analysis time to a few days pathogen hours. Therefore, this research aims to standardize the PCR, independent culture, to detect the presence of Salmonella spp tambaqui (Colossoma macropmum). Was not possible to standardize the PCR technique by using reference strains of Salmonella spp. it was not possible to detect environmental contamination of Salmonella spp. fish in an artificial contamination was also performed. Two methods of DNA extraction by thermal lysis and comecial kit was evaluated. It was noted that the extraction (DNeasy mericon Food Kit) commercial kit Quiagen®, was more efficient and yielded a DNA of better quality compared to extraction by thermal lysis.The optimum conditions for the detection of Salmonella spp was reached and achieved the limit of detection was 101 CFU / mL. The PCR was as sensitive as conventional methods, with the advantage of reducing the analysis time of 7 days to approximately 4 hours of work.
id UFMT-1_51e936fa3be32b728fb02901b3ee7414
oai_identifier_str oai:localhost:1/163
network_acronym_str UFMT-1
network_name_str Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
repository_id_str
spelling Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::NUTRICAOSalmonella spp.Tambaqui (Colossoma macropomum)PCRSalmonella spp.Tambaqui (Colossoma macropomum)PCRSalmonella spp. is an enteric bacterium responsible for severe food poisoning, one of the main agents responsible for outbreaks reported in various countries, externalizing itself with some characteristics such as endemicity, morbidity and above all, the difficulty of adopting the measure of control. Traditional methods for isolation of Salmonella spp. in food is provided by Brazilian law, however, are made of extremely laborious manner and demand working days for confirmation of the genus. In this context, the PCR becomes an excellent alternative for rapid, sensitive and specific detection of Salmonella spp. in food, reducing the analysis time to a few days pathogen hours. Therefore, this research aims to standardize the PCR, independent culture, to detect the presence of Salmonella spp tambaqui (Colossoma macropmum). Was not possible to standardize the PCR technique by using reference strains of Salmonella spp. it was not possible to detect environmental contamination of Salmonella spp. fish in an artificial contamination was also performed. Two methods of DNA extraction by thermal lysis and comecial kit was evaluated. It was noted that the extraction (DNeasy mericon Food Kit) commercial kit Quiagen®, was more efficient and yielded a DNA of better quality compared to extraction by thermal lysis.The optimum conditions for the detection of Salmonella spp was reached and achieved the limit of detection was 101 CFU / mL. The PCR was as sensitive as conventional methods, with the advantage of reducing the analysis time of 7 days to approximately 4 hours of work.A Salmonella spp. é uma bactéria entérica responsável por graves intoxicações alimentares, sendo um dos principais agentes envolvidos em surtos registrados em vários países, exteriorizando-se pelas suas características de endemicidade, alta morbidade e sobretudo, pela dificuldade da adoção de medida de controle. A metodologia tradicional para isolamento de Salmonella spp. em alimentos está prevista pela legislação brasileira, no entanto, são realizadas de forma trabalhosa demandando alguns dias de trabalho para a confirmação do gênero. Neste contexto, a técnica de PCR se torna uma excelente alternativa para detecção rápida, sensível e específica de Salmonella spp. em alimentos, reduzindo o tempo de detecção do patógeno de dias para algumas horas. Dessa forma, esta pesquisa tem como objetivo padronizar uma PCR, cultura independente, para detectar a presença de Salmonella spp em tambaqui (Colossoma macropmum). Foi possível realizar a padronização da técnica de PCR através da utilização de cepas de referência de Salmonella spp. não foi possível detectar contaminação ambiental de Salmonella spp. no pescado, sendo realizado uma contaminação artificial no mesmo. Foi avaliado dois métodos de extração de DNA por lise térmica e por kit comecial. Notou-se que a extração com kit comercial da Quiagen® (DNeasy mericon Food Kit), foi mais eficiente e rendeu um DNA de melhor qualidade comparado com a extração por lise térmica. As condições ótimas para a pesquisa de Salmonella spp. foi alcançada e o limite de detecção obtido foi de 101 UFC/mL. A PCR foi tão sensível quanto a metodologia convencional, com a vantagem de reduzir o tempo de análise de 7 dias para aproximadamente 4 horas de trabalho.Universidade Federal de Mato GrossoBrasilFaculdade de Nutrição (FANUT)UFMT CUC - CuiabáCiência e Tecnologia de Alimentos - CUCFigueiredo, Eduardo Eustáquio de Souzahttp://lattes.cnpq.br/6282282710604561Figueiredo, Eduardo Eustáquio de Souzahttp://lattes.cnpq.br/6282282710604561Silva, Luciana Kimie Savay dahttp://lattes.cnpq.br/2501838118203314Carvalho, Ricardo César deFernandes, Dandara Virginia Guia Semedo2018-08-21T13:26:55Z2014-08-252018-08-21T13:26:55Z2014-08-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/datasetFERNANDES, Dandara Virginia Guia Semedo. Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum). 2014. 38 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência e Tecnologia de Alimentos) – Universidade Federal de Mato Grosso, Faculdade de Nutrição, Cuiabá, 2014.http://bdm.ufmt.br/handle/1/163porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Monografias da UFMTinstname:Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)instacron:UFMT2018-08-22T07:01:00Zoai:localhost:1/163Biblioteca Digital de Monografiahttps://bdm.ufmt.br/PUBhttp://200.129.241.122/oai/requestopendoar:2018-08-22T07:01falseBiblioteca Digital de Monografiahttps://bdm.ufmt.br/PUBhttp://200.129.241.122/oai/requestbibliotecacentral@ufmt.br||opendoar:2018-08-22T07:01Biblioteca Digital de Monografias da UFMT - Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)false
dc.title.none.fl_str_mv Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
title Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
spellingShingle Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::NUTRICAO
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
title_short Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
title_full Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
title_fullStr Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
title_full_unstemmed Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
title_sort Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum)
author Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
author_facet Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Figueiredo, Eduardo Eustáquio de Souza
http://lattes.cnpq.br/6282282710604561
Figueiredo, Eduardo Eustáquio de Souza
http://lattes.cnpq.br/6282282710604561
Silva, Luciana Kimie Savay da
http://lattes.cnpq.br/2501838118203314
Carvalho, Ricardo César de
dc.contributor.author.fl_str_mv Fernandes, Dandara Virginia Guia Semedo
dc.subject.por.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::NUTRICAO
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
topic CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::NUTRICAO
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
Salmonella spp.
Tambaqui (Colossoma macropomum)
PCR
description Salmonella spp. is an enteric bacterium responsible for severe food poisoning, one of the main agents responsible for outbreaks reported in various countries, externalizing itself with some characteristics such as endemicity, morbidity and above all, the difficulty of adopting the measure of control. Traditional methods for isolation of Salmonella spp. in food is provided by Brazilian law, however, are made of extremely laborious manner and demand working days for confirmation of the genus. In this context, the PCR becomes an excellent alternative for rapid, sensitive and specific detection of Salmonella spp. in food, reducing the analysis time to a few days pathogen hours. Therefore, this research aims to standardize the PCR, independent culture, to detect the presence of Salmonella spp tambaqui (Colossoma macropmum). Was not possible to standardize the PCR technique by using reference strains of Salmonella spp. it was not possible to detect environmental contamination of Salmonella spp. fish in an artificial contamination was also performed. Two methods of DNA extraction by thermal lysis and comecial kit was evaluated. It was noted that the extraction (DNeasy mericon Food Kit) commercial kit Quiagen®, was more efficient and yielded a DNA of better quality compared to extraction by thermal lysis.The optimum conditions for the detection of Salmonella spp was reached and achieved the limit of detection was 101 CFU / mL. The PCR was as sensitive as conventional methods, with the advantage of reducing the analysis time of 7 days to approximately 4 hours of work.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-08-25
2014-08-15
2018-08-21T13:26:55Z
2018-08-21T13:26:55Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
info:eu-repo/semantics/dataset
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv FERNANDES, Dandara Virginia Guia Semedo. Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum). 2014. 38 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência e Tecnologia de Alimentos) – Universidade Federal de Mato Grosso, Faculdade de Nutrição, Cuiabá, 2014.
http://bdm.ufmt.br/handle/1/163
identifier_str_mv FERNANDES, Dandara Virginia Guia Semedo. Padronização de PCR, cultura independente, para detecção de Salmonella Spp. em lavado superficial de tambaqui (Colossoma macropomum). 2014. 38 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência e Tecnologia de Alimentos) – Universidade Federal de Mato Grosso, Faculdade de Nutrição, Cuiabá, 2014.
url http://bdm.ufmt.br/handle/1/163
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Faculdade de Nutrição (FANUT)
UFMT CUC - Cuiabá
Ciência e Tecnologia de Alimentos - CUC
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Mato Grosso
Brasil
Faculdade de Nutrição (FANUT)
UFMT CUC - Cuiabá
Ciência e Tecnologia de Alimentos - CUC
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
instname:Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
instacron:UFMT
instname_str Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
instacron_str UFMT
institution UFMT
reponame_str Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
collection Biblioteca Digital de Monografias da UFMT
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Monografias da UFMT - Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT)
repository.mail.fl_str_mv bibliotecacentral@ufmt.br||
_version_ 1813012941572669440