Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: COIMBRA, Victor Rafael Matos
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/30865
Resumo: Com o intuito de contribuir com o conhecimento taxonômico e filogenético de espécies do gênero Gymnopus (Agaricales, Basidiomycota) ocorrentes em áreas de Mata Atlântica e Floresta Amazônica do Norte e Nordeste do Brasil, foram realizadas 47 expedições (22 localidades em nove estados) de coleta, entre os anos de 2012 e 2015. Foram coletadas ao todo 104 amostras (≅ 700 basidiomas), sendo posteriormente descartadas 21 delas. As 83 amostras restantes corresponderam a 25 espécies, sendo 15 delas novas para a ciência, uma proposta como nova combinação e três registradas pela primeira vez para o Brasil. Desta forma, houve um incremento na riqueza de Gymnopus no Brasil de aproximadamente 95% (de 19 para 37 espécies). Dentre as cinco seções reconhecidas na sistemática atual do gênero, apenas membros de Gymnopus seção Impudicae (quatro espécies) e Gymnopus seção Vestipedes (21 espécies) foram coletados nas regiões estudadas. Das 88 amostras submetidas aos procedimentos de biologia molecular, 66 delas obtiveram sucesso (75%), resultando em 116 sequências de DNA de boa qualidade (62 de ITS, 47 de LSU e sete de TEF1-ɑ). Baseado exclusivamente em análises morfológicas, foi possível confirmar as identidades de G. collybioides, G. coracicolor e G. subpruinosus, enquanto, as análises polifásicas (morfológicas e filogenéticas multigênicas - ITS+LSU+ TEF1-ɑ) deram suporte a determinações de 15 novos táxons para a ciência, bem como a identificação de G. albelloavellaneus, G. alnicolus, G. gibbosus, G. montagnei, G. omphalodes, G. polygrammus e G. subcyathiformis.
id UFPE_fb86a6f448070aafe1985205ac1fae5a
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/30865
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str 2221
spelling COIMBRA, Victor Rafael Matoshttp://lattes.cnpq.br/7431639583529285http://lattes.cnpq.br/8535172322991148GIBERTONI, Tatiana BaptistaWARTCHOW, Felipe2019-05-28T21:30:08Z2019-05-28T21:30:08Z2017-02-21https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/30865Com o intuito de contribuir com o conhecimento taxonômico e filogenético de espécies do gênero Gymnopus (Agaricales, Basidiomycota) ocorrentes em áreas de Mata Atlântica e Floresta Amazônica do Norte e Nordeste do Brasil, foram realizadas 47 expedições (22 localidades em nove estados) de coleta, entre os anos de 2012 e 2015. Foram coletadas ao todo 104 amostras (≅ 700 basidiomas), sendo posteriormente descartadas 21 delas. As 83 amostras restantes corresponderam a 25 espécies, sendo 15 delas novas para a ciência, uma proposta como nova combinação e três registradas pela primeira vez para o Brasil. Desta forma, houve um incremento na riqueza de Gymnopus no Brasil de aproximadamente 95% (de 19 para 37 espécies). Dentre as cinco seções reconhecidas na sistemática atual do gênero, apenas membros de Gymnopus seção Impudicae (quatro espécies) e Gymnopus seção Vestipedes (21 espécies) foram coletados nas regiões estudadas. Das 88 amostras submetidas aos procedimentos de biologia molecular, 66 delas obtiveram sucesso (75%), resultando em 116 sequências de DNA de boa qualidade (62 de ITS, 47 de LSU e sete de TEF1-ɑ). Baseado exclusivamente em análises morfológicas, foi possível confirmar as identidades de G. collybioides, G. coracicolor e G. subpruinosus, enquanto, as análises polifásicas (morfológicas e filogenéticas multigênicas - ITS+LSU+ TEF1-ɑ) deram suporte a determinações de 15 novos táxons para a ciência, bem como a identificação de G. albelloavellaneus, G. alnicolus, G. gibbosus, G. montagnei, G. omphalodes, G. polygrammus e G. subcyathiformis.FACEPEWith the aim of contributing to the taxonomic and phylogenetic knowledge of species of the genus Gymnopus (Agaricales, Basidiomycota) occurring in Atlantic and Amazon Forest areas of Brazil’s North and Northeast, 47 collection expeditions (22 sites in nine states) were carried out, between the years 2012 and 2015. A total of 104 samples (≅ 700 basidiomas) were collected, being 21 of them later discarded. The 83 remaining samples corresponded to 25 species, being 15 of them new to science, one proposed as new combination and three recorded for the first time to Brazil. Thus, there was an increase in the Gymnopus’ richness in Brazil of about 95% (from 19 to 37 species). Among the five sections recognized in the current systematics of the genus, only members of Gymnopus section Impudicae (four species) and Gymnopus section Vestipedes (21 species) were collected in the studied regions. Of 88 samples submitted to molecular biology procedures, 66 of them were successful (75%), resulting in 116 good quality DNA sequences (62 of ITS, 47 of LSU and seven of TEF1-ɑ). Based exclusively on morphological analyses, it was possible to confirm the identities of G. collybioides, G. coracicolor and G. subpruinosus, while the polyphasic analyses (morphological and multi-gene - ITS+LSU+ TEF1-ɑ) gave support to the determinations of 15 new taxa to science as well as the identification of G. albelloavellaneus, G. alnicolus, G. gibbosus, G. montagnei, G. omphalodes, G. polygrammus and G. subcyathiformis.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Biologia de FungosUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessAgaricus (cogumelo)FilogeniaMata AtlânticaRiqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisdoutoradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETHUMBNAILTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdf.jpgTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1153https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/5/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdf.jpg4aad82eb7d48d3627b8dc196c15e3665MD55ORIGINALTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdfTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdfapplication/pdf8089185https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/1/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdff92f03b5f5274b291c8e0fd918cc43ddMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82311https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/3/license.txt4b8a02c7f2818eaf00dcf2260dd5eb08MD53TEXTTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdf.txtTESE Victor Rafael Matos Coimbra.pdf.txtExtracted texttext/plain181561https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/4/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdf.txt92321bd867d929948b19706205c0cedeMD54123456789/308652019-10-25 10:10:05.423oai:repositorio.ufpe.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T13:10:05Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
title Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
spellingShingle Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
COIMBRA, Victor Rafael Matos
Agaricus (cogumelo)
Filogenia
Mata Atlântica
title_short Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
title_full Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
title_fullStr Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
title_full_unstemmed Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
title_sort Riqueza e aspectos moleculares de Gymnopus (Omphalotaceae, Agaricales) do Norte e Nordeste brasileiro
author COIMBRA, Victor Rafael Matos
author_facet COIMBRA, Victor Rafael Matos
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7431639583529285
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8535172322991148
dc.contributor.author.fl_str_mv COIMBRA, Victor Rafael Matos
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv GIBERTONI, Tatiana Baptista
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv WARTCHOW, Felipe
contributor_str_mv GIBERTONI, Tatiana Baptista
WARTCHOW, Felipe
dc.subject.por.fl_str_mv Agaricus (cogumelo)
Filogenia
Mata Atlântica
topic Agaricus (cogumelo)
Filogenia
Mata Atlântica
description Com o intuito de contribuir com o conhecimento taxonômico e filogenético de espécies do gênero Gymnopus (Agaricales, Basidiomycota) ocorrentes em áreas de Mata Atlântica e Floresta Amazônica do Norte e Nordeste do Brasil, foram realizadas 47 expedições (22 localidades em nove estados) de coleta, entre os anos de 2012 e 2015. Foram coletadas ao todo 104 amostras (≅ 700 basidiomas), sendo posteriormente descartadas 21 delas. As 83 amostras restantes corresponderam a 25 espécies, sendo 15 delas novas para a ciência, uma proposta como nova combinação e três registradas pela primeira vez para o Brasil. Desta forma, houve um incremento na riqueza de Gymnopus no Brasil de aproximadamente 95% (de 19 para 37 espécies). Dentre as cinco seções reconhecidas na sistemática atual do gênero, apenas membros de Gymnopus seção Impudicae (quatro espécies) e Gymnopus seção Vestipedes (21 espécies) foram coletados nas regiões estudadas. Das 88 amostras submetidas aos procedimentos de biologia molecular, 66 delas obtiveram sucesso (75%), resultando em 116 sequências de DNA de boa qualidade (62 de ITS, 47 de LSU e sete de TEF1-ɑ). Baseado exclusivamente em análises morfológicas, foi possível confirmar as identidades de G. collybioides, G. coracicolor e G. subpruinosus, enquanto, as análises polifásicas (morfológicas e filogenéticas multigênicas - ITS+LSU+ TEF1-ɑ) deram suporte a determinações de 15 novos táxons para a ciência, bem como a identificação de G. albelloavellaneus, G. alnicolus, G. gibbosus, G. montagnei, G. omphalodes, G. polygrammus e G. subcyathiformis.
publishDate 2017
dc.date.issued.fl_str_mv 2017-02-21
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-05-28T21:30:08Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-05-28T21:30:08Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/30865
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/30865
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pos Graduacao em Biologia de Fungos
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFPE
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/5/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdf.jpg
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/1/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/2/license_rdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/3/license.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/30865/4/TESE%20Victor%20Rafael%20Matos%20Coimbra.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 4aad82eb7d48d3627b8dc196c15e3665
f92f03b5f5274b291c8e0fd918cc43dd
e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34
4b8a02c7f2818eaf00dcf2260dd5eb08
92321bd867d929948b19706205c0cede
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1802310819808018432