Mapeamento de regiões genômicas associadas a caracteres de raízes em genótipos de arroz

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Chagas, Gabriel Brandão das
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
Texto Completo: http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/11564
Resumo: O arroz é um alimento básico para grande parte da população mundial, especialmente para as pessoas de menor renda. Especificamente no Brasil, essa cultura representa um papel importante em termos de consumo, produção e economia. Nos últimos anos a produtividade e a produção total do arroz atingiram um platô em alguns países, enquanto que a população segue aumentando, representando um desafio para os pesquisadores e melhoristas. A produtividade é determinada pelos componentes de rendimento, que são os principais alvos do melhoramento genético. Outro parâmetro chave para o rendimento do arroz é o sistema radicular, visto que é responsável pela captação de água, assim como pela absorção e transporte de nutrientes do solo, além de outras funções diretamente ligadas à produtividade. Elucidar a base molecular das características de raiz em arroz é uma das estratégias para auxiliar os melhoristas de plantas a superar os desafios e alcançar o objetivo final. Dentro desse contexto, o objetivo desse estudo foi mapear regiões do genoma responsáveis pelo comprimento e peso seco de raiz em arroz. Foi empregada a técnica mapeamento associativo com 7098 marcadores SNPs (polimorfismo de nucleotídeo único) em uma coleção de 188 genótipos de arroz utilizados no Brasil. Foram encontrados seis marcadores SNPs para comprimento de raiz e três marcadores para peso seco de raiz. Para comprimento de raiz foram encontrados genes que codificam o fator de transcrição MYB, Cinamil álcool desidrogenase e Cdk ativadora de quinase. Para peso seco de raiz foram identificados genes que codificam celulose sintase, proteína de transferência de lipídeos, quinase citoplasmática e dedo zinco associado com tolerância à seca.
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Outro parâmetro chave para o rendimento do arroz é o sistema radicular, visto que é responsável pela captação de água, assim como pela absorção e transporte de nutrientes do solo, além de outras funções diretamente ligadas à produtividade. Elucidar a base molecular das características de raiz em arroz é uma das estratégias para auxiliar os melhoristas de plantas a superar os desafios e alcançar o objetivo final. Dentro desse contexto, o objetivo desse estudo foi mapear regiões do genoma responsáveis pelo comprimento e peso seco de raiz em arroz. Foi empregada a técnica mapeamento associativo com 7098 marcadores SNPs (polimorfismo de nucleotídeo único) em uma coleção de 188 genótipos de arroz utilizados no Brasil. Foram encontrados seis marcadores SNPs para comprimento de raiz e três marcadores para peso seco de raiz. Para comprimento de raiz foram encontrados genes que codificam o fator de transcrição MYB, Cinamil álcool desidrogenase e Cdk ativadora de quinase. Para peso seco de raiz foram identificados genes que codificam celulose sintase, proteína de transferência de lipídeos, quinase citoplasmática e dedo zinco associado com tolerância à seca.Rice (Oryza sativa L.) is a staple food for more than half of the world's population, especially for low-income people. In Brazil, this crop plays an important role in terms of consumption, production and economy. In recent years, yield and total rice production have reached a plateau in some countries, while population continues to increase, representing a challenge for researchers and breeders. Yield is determined by its components, which are the main targets of genetic improvement. Root system is another key parameter for rice yield, as it is responsible for uptake water. This trait also acts on absorption and transportation of nutrients from soil, in addition to other functions directly linked to yield. Understanding molecular basis of root traits in rice is one of the strategies to help plant breeders overcome challenges and reach the ultimate goal. Within this perspective, the objective of this research was to map genome regions responsible for root dry weight and length in rice. Genome-wide association study was applied using 7098 SNPs (single nucleotide polymorphism) markers and a collection of 188 rice genotypes grown in Brazil. Six SNPs markers for root length and three markers for root dry weight were detected. Genes encoding MYB transcription factor, Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase and Cdk-Activating Kinase, among others, were found associated to root length. Amidst the genes related to root dry weight, those encoding Cellulose synthase, Lipid Transfer Protein, Receptor-Like Cytoplasmic Kinase and CCCH-type zinc finger protein associated to drought tolerance were identified.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilCC BY-NC-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessCIENCIAS AGRARIASAGRONOMIAOryza sativa L.Comprimento de raizPeso seco de raizRoot lengthRoot dry weightMapeamento de regiões genômicas associadas a caracteres de raízes em genótipos de arrozIdentification of genomic regions associated with root characteristics in Brazilian rice genotypesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/0591232727750846http://lattes.cnpq.br/4440061243085201Pegoraro, Camilahttp://lattes.cnpq.br/5859282913464169Maia, Luciano Carlos daChagas, Gabriel Brandão dasreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/11564/2/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD52open accessORIGINALDissertacao_Gabriel_Chagas.pdfDissertacao_Gabriel_Chagas.pdfapplication/pdf1426694http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/11564/1/Dissertacao_Gabriel_Chagas.pdfdd40d44e742137d66aa9040ae88e98f3MD51open accessTEXTDissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.txtDissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.txtExtracted texttext/plain115847http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/11564/3/Dissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.txtddfce5a55367940ffcd2921af205c2deMD53open accessTHUMBNAILDissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.jpgDissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1284http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/11564/4/Dissertacao_Gabriel_Chagas.pdf.jpg7821a4a032d777de5cb44d9c76ae2a8cMD54open accessprefix/115642024-01-12 03:01:57.293open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/11564VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2024-01-12T06:01:57Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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